關(guān)于二代測(cè)序的簡(jiǎn)介:
二代測(cè)序技術(shù)(Next-Generation Seguencing,NGS)也稱為高通量測(cè)序技術(shù),是一種能夠同時(shí)對(duì)數(shù)百萬(wàn)甚至數(shù)十億個(gè) DNA片段進(jìn)行測(cè)序的方法。與傳統(tǒng)的桑格測(cè)序相比二代測(cè)序技術(shù)具有高通量、高準(zhǔn)確性、高靈敏度和低成本等優(yōu)勢(shì)。
二代測(cè)序技術(shù)在大幅提高了測(cè)序速度的同時(shí),大幅度的降低了測(cè)序成本,保持了高準(zhǔn)確性,以前完成一個(gè)人類基因組的測(cè)序需要3年時(shí)間,而使用二代測(cè)序技術(shù)則需要1周,但其序列讀長(zhǎng)方面比起一代測(cè)序技術(shù)則要短很多,大多只100bp-150bp。
二代測(cè)序結(jié)果怎么分析?寧夏嘉安健達(dá)二代測(cè)序價(jià)格
二代測(cè)序技術(shù)在不同人群中的準(zhǔn)確性有何差異④
***性疾病患者
優(yōu)勢(shì):病原學(xué)二代測(cè)序可準(zhǔn)確檢測(cè)病原體的基因序**定病原體種類和基因型,為***性疾病的診斷和***提供依據(jù),在檢測(cè)罕見(jiàn)病原體、病毒***等方面具有獨(dú)特優(yōu)勢(shì),有助于快速明確診斷,尤其是對(duì)于一些傳統(tǒng)檢測(cè)方法難以診斷的***性疾病,如不明原因的發(fā)熱、肺炎、腦膜炎等。
局限性:對(duì)于低豐度病原體,可能出現(xiàn)假陽(yáng)性或假陰性結(jié)果。樣本質(zhì)量、測(cè)序深度和數(shù)據(jù)分析方法等因素也會(huì)影響準(zhǔn)確性,若樣本中病原體含量低或雜質(zhì)多,可能導(dǎo)致檢測(cè)失敗或結(jié)果不準(zhǔn)確 湖南哪里有二代測(cè)序流程二代測(cè)序使用的是哪種設(shè)備?
二代測(cè)序——RNA甲基化的概念、作用和檢測(cè)方法
RNA 甲基化概念及位置:RNA 甲基化是在 RNA 分子上添加甲基基團(tuán),其中 N6 - 甲基腺苷(m6A)是最常見(jiàn)的一種 RNA 甲基化修飾形式,它主要發(fā)生在 mRNA(信使 RNA)的腺嘌呤(A)殘基上。
作用
1、影響 RNA 的穩(wěn)定性:m6A 修飾可以影響 mRNA 的穩(wěn)定性。例如,一些帶有 m6A 修飾的 mRNA 更容易被降解,從而調(diào)控基因表達(dá)的時(shí)間和水平。2、調(diào)節(jié) RNA 的剪接和翻譯:m6A 修飾還能夠調(diào)節(jié) mRNA 的剪接過(guò)程,影響不同轉(zhuǎn)錄本的生成。同時(shí),它也可以在翻譯水平上發(fā)揮作用,影響蛋白質(zhì)合成的效率。
檢測(cè)方法
甲基化 RNA 免疫沉淀測(cè)序(MeRIP - Seq):這種方法主要是利用特異性識(shí)別 m6A 修飾的抗體,對(duì) RNA 進(jìn)行免疫沉淀富集,然后通過(guò)高通量測(cè)序來(lái)鑒定 m6A 修飾的位點(diǎn)和水平。
二代測(cè)序技術(shù)在不同人群中的準(zhǔn)確性有何差異③
孕婦及胎兒
優(yōu)勢(shì):無(wú)創(chuàng)產(chǎn)前篩查(NIPT)是二代測(cè)序技術(shù)用于孕期胎兒常見(jiàn)染色體非整倍體篩查的應(yīng)用,對(duì)于唐氏綜合征、18-三體綜合征、13-三體綜合征等染色體異常疾病的檢測(cè)準(zhǔn)確率分別能達(dá)到95%、85%、75%以上,明顯高于傳統(tǒng)血清學(xué)篩查。
局限性:孕婦外周血中胎兒游離DNA來(lái)源于胎盤(pán)滋養(yǎng)細(xì)胞,可能與胎兒實(shí)際情況不一致,導(dǎo)致假陽(yáng)性。母親若合并免疫疾病、凝血功能障礙等,會(huì)使外周血中游離DNA含量過(guò)高,掩蓋胎兒來(lái)源的游離DNA,造成假陰性510. 一代、二代、三代測(cè)序的區(qū)別是什么?
二代測(cè)序——轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的背景和基本原理
1、背景:在基因表達(dá)過(guò)程中,DNA 轉(zhuǎn)錄為 RNA,轉(zhuǎn)錄后的 RNA 會(huì)經(jīng)過(guò)一系列加工,包括剪接等過(guò)程形成成熟的 mRNA,然后進(jìn)行翻譯產(chǎn)生蛋白質(zhì)。轉(zhuǎn)錄組測(cè)序可以讓我們?cè)谌蚪M范圍內(nèi)研究基因的表達(dá)情況,相比于傳統(tǒng)的基因表達(dá)研究方法(如芯片技術(shù)),它具有更高的分辨率和更廣的檢測(cè)范圍。
2、原理:首先從樣本(如細(xì)胞、組織)中提取總 RNA,然后將 RNA 反轉(zhuǎn)錄為 cDNA(互補(bǔ) DNA)。這些 cDNA 會(huì)構(gòu)建測(cè)序文庫(kù),在文庫(kù)中加入特定的接頭序列,以便后續(xù)在測(cè)序平臺(tái)上進(jìn)行測(cè)序。測(cè)序過(guò)程中,測(cè)序儀會(huì)讀取 cDN**段的堿基序列信息。通過(guò)生物信息學(xué)分析,將這些短序列(reads)比對(duì)到參考基因組或進(jìn)行從頭組裝(如果沒(méi)有參考基因組),從而確定轉(zhuǎn)錄本的序列和表達(dá)量。 二代測(cè)序的優(yōu)勢(shì)是高靈敏度。寧夏二代測(cè)序分析
高通量測(cè)序是二代測(cè)序嗎?寧夏嘉安健達(dá)二代測(cè)序價(jià)格
①二代測(cè)序一般多久出結(jié)果?
二代測(cè)序(Next-GenerationSequencing,NGS)出結(jié)果的時(shí)間會(huì)受到多種因素的影響,一般在數(shù)天到數(shù)周不等。
1、樣本類型和質(zhì)量
不同的樣本類型處理時(shí)間不同。例如,血液樣本相對(duì)容易處理,提取DNA的過(guò)程比較常規(guī)。如果是組織樣本,可能需要先進(jìn)行樣本的解離等復(fù)雜操作。如果樣本質(zhì)量高,DNA提取和文庫(kù)構(gòu)建等前期工作會(huì)比較順利,能加快整體進(jìn)程。但如果樣本量少或者DNA有降解等質(zhì)量問(wèn)題,可能需要重新提取樣本或者進(jìn)行DNA修復(fù)等操作,這會(huì)**延長(zhǎng)時(shí)間。例如,對(duì)于新鮮血液樣本,DNA提取可能在1-2天內(nèi)完成;而對(duì)于一些福爾馬林固定石蠟包埋(FFPE)組織樣本,可能需要3-5天來(lái)完成高質(zhì)量DNA的提取和后續(xù)的優(yōu)化處理。
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