PCR反應(yīng)的特異性決定因素為:①引物與模板DNA特異正確的結(jié)合;②堿基配對原則;③TaqDNA聚合酶合成反應(yīng)的忠實性;④靶基因的特異性與保守性。其中引物與模板的正確結(jié)合是關(guān)鍵。引物與模板的結(jié)合及引物鏈的延伸是遵循堿基配對原則的。聚合酶合成反應(yīng)的忠實性及TaqDNA聚合酶耐高溫性,使反應(yīng)中模板與引物的結(jié)合(復(fù)性)可以在較高的溫度下進(jìn)行,結(jié)合的特異性明顯增加,被擴(kuò)增的靶基因片段也就能保持很高的正確度。再通過選擇特異性和保守性高的靶基因區(qū),其特異性程度就更高。英瀚斯生物可承接臨床樣本、動物組織、細(xì)胞樣本各類pcr檢測。湖南細(xì)胞pcr原理
PCR實驗技術(shù)中的反向PCR介紹:反向PCR的目的在于擴(kuò)增一段已知序列旁側(cè)的DNA,也就是說這一反應(yīng)體系不是在一對引物之間而是在引物外側(cè)合成DNA.反向PCR可用于研究與已知DNA區(qū)段相連接的未知染色體序列,因此又稱為染色體步移。這時選擇的引物雖然與中心DNA兩末端序列互補(bǔ),但引物3’端是相互反向的。反向PCR的操作流程:擴(kuò)增前先用限制性內(nèi)切酶酶切樣品DNA,然后用DNA連接酶連接成一個環(huán)狀分子,通過反向PCR擴(kuò)增引物的上游片段和下游片段。選擇多種限制性內(nèi)切酶,基本準(zhǔn)則是選擇不能在非酶切位點切斷靶DNA的酶。裂解中心區(qū)的內(nèi)切酶使反向PCR只能擴(kuò)增引物所定模板(依賴于引物)的上游或下游區(qū),而不裂解中心區(qū)的酶則使兩側(cè)序列都擴(kuò)增Southern雜交來確定內(nèi)切酶用以產(chǎn)生大小適于環(huán)化及反向PCR的片段的末端片段大多數(shù)有核基因組含有大量中度和高度重復(fù)序列,所以往往需要兩組到三組嵌套引物山東高效pcr檢測pcr檢測實驗數(shù)據(jù)如何分析?
PCR設(shè)計引物應(yīng)遵循以下原則:①引物長度:15-30bp,常用為20bp左右。②引物擴(kuò)增跨度:以200-500bp為宜,特定條件下可擴(kuò)增長至10kb的片段。③引物堿基:G+C含量以40-60%為宜,G+C太少擴(kuò)增效果不佳,G+C過多易出現(xiàn)非特異條帶。ATGC比較好隨機(jī)分布,避免5個以上的嘌呤或嘧啶核苷酸的成串排列。④避免引物內(nèi)部出現(xiàn)二級結(jié)構(gòu),避免兩條引物間互補(bǔ),特別是3'端的互補(bǔ),否則會形成引物二聚體,產(chǎn)生非特異的擴(kuò)增條帶。⑤引物3'端的堿基,特別是較末及倒數(shù)第二個堿基,應(yīng)嚴(yán)格要求配對,以避免因末端堿基不配對而導(dǎo)致PCR失敗。⑥引物中有或能加上合適的酶切位點,被擴(kuò)增的靶序列比較好有適宜的酶切位點,這對酶切分析或分子克隆很有好處。⑦引物的特異性:引物應(yīng)與核酸序列數(shù)據(jù)庫的其它序列無明顯同源性。引物量:每條引物的濃度0.1~1umol或10~100pmol,以比較低引物量產(chǎn)生所需要的結(jié)果為好,引物濃度偏高會引起錯配和非特異性擴(kuò)增,且可增加引物之間形成二聚體的機(jī)會。
pcr是一種在體外擴(kuò)增特定DNA序列的技術(shù)方法,通過與特定DNA區(qū)域兩端互補(bǔ)的寡核苷酸為引物(primer)在試管中DNA聚合酶選擇性地單獨復(fù)制合成介于兩引物直接的基因片段,如同DNA復(fù)制中的半保留復(fù)制一樣,新合成的基因片段與模板鏈形成新的DNA雙鏈,經(jīng)反復(fù)的變性(denature)引物退火(anerling)和引物延伸(extention)三步循環(huán),前一循環(huán)合成的DNA鏈成為下一循環(huán)引物結(jié)合的模板,每循環(huán)一次,反應(yīng)體系的DNA的量就增加一倍,20-30次反復(fù)循環(huán),即可由微量的DNA模板開始獲得大量的DNA特異片段。近年來,PCR迅速發(fā)展,已深入生命科學(xué)的各個領(lǐng)域,技術(shù)方法不端完善,基本的PCR實驗技術(shù)主要有經(jīng)典PCR技術(shù)、RT-PCR技術(shù)、免疫-PCR技術(shù)、PCR-SSCP技術(shù)等。pcr檢測知識要點總結(jié)匯總。
PCR實驗技術(shù)中的RT-PCR介紹:在RT-PCR中,通過逆轉(zhuǎn)錄(RT)將RNA轉(zhuǎn)化為cDNA,然后通過聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)擴(kuò)增cDNA(圖1)。利用cDNA擴(kuò)增步驟,有望對初始RNA進(jìn)行進(jìn)一步研究,即便RNA樣本數(shù)量有限或低豐度表達(dá)。RT-PCR的常見應(yīng)用包括表達(dá)基因檢測、轉(zhuǎn)錄物變異檢測,以及克隆和測序用cDNA模板制備。由于逆轉(zhuǎn)錄可為PCR擴(kuò)增和下游實驗提供cDNA模板,因此,它是實驗成功的關(guān)鍵步驟之一。選定的逆轉(zhuǎn)錄酶應(yīng)對所有樣本均具有**高效率,即便是難轉(zhuǎn)錄RNA樣本,如降解、抑制劑殘留或具有高度二級結(jié)構(gòu)的RNA樣本。一步法和兩步法是兩種**常用的RT-PCR方法,每種方法都具有各自的優(yōu)缺點。RNA的多聚酶反應(yīng)(RT-PCR)是以RNA為模板,聯(lián)合逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)(reversetranscription,RT)與PCR,可用于檢測單個細(xì)胞或少數(shù)細(xì)胞中少于10個拷貝的RNA模板。英瀚斯生物,分子平臺實驗人員十年以上經(jīng)驗,專業(yè)pcr檢測。湖南細(xì)胞pcr原理
pcr檢測有哪些操作步驟?湖南細(xì)胞pcr原理
PCR實驗技術(shù)中cDNA第二鏈的合成方法有以下幾種:1、自身引導(dǎo)法合成的單鏈cDNA3'端能夠形成一短的發(fā)夾結(jié)構(gòu),這就為第二鏈的合成提供了現(xiàn)成的引物,當(dāng)***鏈合成反應(yīng)產(chǎn)物的DNA:RNA雜交鏈變性后利用大腸桿菌DNA聚合酶ⅠKlenow片段或反轉(zhuǎn)錄酶合成cDNA第二鏈,***用對單鏈特異性的S1核酸酶消化該環(huán),即可進(jìn)一步克隆。但自身引導(dǎo)合成法較難控制反應(yīng),而且用S1核酸酶切割發(fā)夾結(jié)構(gòu)時無一例外地將導(dǎo)致對應(yīng)于mRNA5'端序列出現(xiàn)缺失和重排,因而該方法目前很少使用。2、置換合成法該方法利用鏈在反轉(zhuǎn)錄酶作用下產(chǎn)生的cDNA:mRNA雜交鏈不用堿變性,而是在dNTP存在下,利用RNA酶H在雜交鏈的mRNA鏈上造成切口和缺口。從而產(chǎn)生一系列RNA引物,使之成為合成第二鏈的引物,在大腸桿菌DNA聚合酶Ⅰ的作用下合成第二鏈。該反應(yīng)有3個主要優(yōu)點:(1)非常有效;(2)直接利用鏈反應(yīng)產(chǎn)物,無須進(jìn)一步處理和純化;(3)不必使用S1核酸酶來切割雙鏈cDNA中的單鏈發(fā)夾環(huán)。湖南細(xì)胞pcr原理
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