PCR實(shí)驗(yàn)技術(shù)中的RT-PCR一步法和兩步法的優(yōu)缺點(diǎn)介紹:一步法:利用同一緩沖液,在同一體系中加入逆轉(zhuǎn)錄酶、引物、Taq酶、4種dNTP直接進(jìn)行mRNA反轉(zhuǎn)錄與PCR擴(kuò)增。發(fā)現(xiàn)Taq酶不僅具有DNA多聚酶的作用,而且具有反轉(zhuǎn)錄酶活性,可利用其雙重作用在同一體系中直接以mRNA為模板進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄和其后PCR擴(kuò)增,從而使mRNA的PCR步驟更為簡化。所需樣品量減少到比較低限度,臨床小樣品的檢測非常有利。用一步法擴(kuò)增可檢測出總RNA中小于1ng的低豐度mRNA.該法可用于低豐度mRNA的cDNA文庫的構(gòu)建及特異cDNA的克隆,并有可能與Taq酶的測序技術(shù)相組合,使得自動反轉(zhuǎn)錄、基因擴(kuò)增與基因轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的測序在單管中進(jìn)行。兩步法:由于單管反應(yīng)時(shí)RT和PCR都不能在比較好條件下進(jìn)行并且容易相互干擾,常只適宜用基因特異引物擴(kuò)增較短的基因,及定量PCR.兩步法則是將RT和PCR分別進(jìn)行,這樣使得兩個(gè)反應(yīng)充分發(fā)揮各自的特點(diǎn),更為靈活而且嚴(yán)謹(jǐn),適合那些GC含量、二級結(jié)構(gòu)嚴(yán)重的模板或者是未知模板,以及多個(gè)基因的RT-PCR。pcr檢測知識要點(diǎn)總結(jié)匯總。云南樣本pcr檢測
PCR實(shí)驗(yàn)技術(shù)中的連接酶鏈反應(yīng)(Ligasechainreaction,LCR)介紹:連接酶鏈反應(yīng)(Ligasechainreaction,LCR),是一種新的DNA體外擴(kuò)增和檢測技術(shù),主要用于點(diǎn)突變的研究及靶基因的擴(kuò)增。連接酶鏈反應(yīng)是Backman1997年為檢出靶基因序列中的點(diǎn)突變而設(shè)計(jì)發(fā)明,并申報(bào)了**。1988年Landegren也進(jìn)行了該項(xiàng)研究。1988年Backman等又因分離熱穩(wěn)定的連接酶,1991年Backman和Barany分別用耐熱DNA連接酶進(jìn)行了LCR試驗(yàn)。耐熱DNA連接酶可以在熱循環(huán)中保持活性,提高連接反應(yīng)的特異性,排除了背景擴(kuò)增和免除了不斷補(bǔ)充酶的繁瑣程序。甘肅組織pcr檢測哪些公司可以做pcr檢測?
PCR實(shí)驗(yàn)技術(shù)中cDNA第二鏈的合成方法有以下幾種:1、自身引導(dǎo)法合成的單鏈cDNA3'端能夠形成一短的發(fā)夾結(jié)構(gòu),這就為第二鏈的合成提供了現(xiàn)成的引物,當(dāng)***鏈合成反應(yīng)產(chǎn)物的DNA:RNA雜交鏈變性后利用大腸桿菌DNA聚合酶ⅠKlenow片段或反轉(zhuǎn)錄酶合成cDNA第二鏈,***用對單鏈特異性的S1核酸酶消化該環(huán),即可進(jìn)一步克隆。但自身引導(dǎo)合成法較難控制反應(yīng),而且用S1核酸酶切割發(fā)夾結(jié)構(gòu)時(shí)無一例外地將導(dǎo)致對應(yīng)于mRNA5'端序列出現(xiàn)缺失和重排,因而該方法目前很少使用。2、置換合成法該方法利用鏈在反轉(zhuǎn)錄酶作用下產(chǎn)生的cDNA:mRNA雜交鏈不用堿變性,而是在dNTP存在下,利用RNA酶H在雜交鏈的mRNA鏈上造成切口和缺口。從而產(chǎn)生一系列RNA引物,使之成為合成第二鏈的引物,在大腸桿菌DNA聚合酶Ⅰ的作用下合成第二鏈。該反應(yīng)有3個(gè)主要優(yōu)點(diǎn):(1)非常有效;(2)直接利用鏈反應(yīng)產(chǎn)物,無須進(jìn)一步處理和純化;(3)不必使用S1核酸酶來切割雙鏈cDNA中的單鏈發(fā)夾環(huán)。
PCR實(shí)驗(yàn)技術(shù)中的3’RACE-PCR介紹:利用mRNA的3‘末端的poly(A)尾巴作為一個(gè)引物結(jié)合位點(diǎn),以連有SMART寡核營酸序列通用接頭引物的Oligo(dT)30MN作為鎖定引物反轉(zhuǎn)錄合成標(biāo)準(zhǔn)1號鏈cDNA.然后用一個(gè)基因特異引物GSP1(genespecificprimer,GSP)作為上游引物,用一個(gè)含有部分接頭序列的通用引物UPM(universalprimer,UPM)作為下游引物,以cDNA1號鏈為模板,進(jìn)行PCR循環(huán),把目的基因3‘末端的。DNA的片段擴(kuò)增出來。
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PCR實(shí)驗(yàn)技術(shù)中的定量PCR介紹:由于序列擴(kuò)增的產(chǎn)量依賴于模板DNA的量,所以PCR常用于對樣品中DNA進(jìn)行定量,常用的應(yīng)用是基因表達(dá)的定量。終點(diǎn)法PCR是一種可能的方法,但其有較大的缺點(diǎn),通過凝膠電泳來檢測產(chǎn)量,檢測的靈敏度非常有限。更重要的是,使用終點(diǎn)PCR是在PCR反應(yīng)結(jié)束后進(jìn)行定量,此時(shí)擴(kuò)增已經(jīng)達(dá)到平臺期,DNA凝膠染色的強(qiáng)度與DNA起始量不成線性關(guān)系。盡管如此,通過終點(diǎn)法PCR可以對基因表達(dá)進(jìn)行半定量,可以使用一系列稀釋程度不同的DNA樣本作為模板起始量,或者在特定的PCR循環(huán)處獲取擴(kuò)增產(chǎn)物,然后通過凝膠顯色強(qiáng)度來估計(jì)基因的表達(dá)量。pcr檢測實(shí)驗(yàn)成功的訣竅!浙江常見pcr實(shí)驗(yàn)
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PCR實(shí)驗(yàn)技術(shù)中的熱啟動PCR介紹:熱啟動PCR是除了好的引物設(shè)計(jì)之外,提高PCR特異性的重要的方法之一。盡管TaqDNA聚合酶的比較好延伸溫度在72℃,聚合酶在室溫仍然有活性。因此,在進(jìn)行PCR反應(yīng)配制過程中,以及在熱循環(huán)剛開始,保溫溫度低于退火溫度時(shí)會產(chǎn)生非特異性的產(chǎn)物。這些非特異性產(chǎn)物一旦形成,就會被有效擴(kuò)增。在用于引物設(shè)計(jì)的位點(diǎn)因?yàn)檫z傳元件的定位而受限時(shí),如site-directed突變、表達(dá)克隆或用于DNA工程的遺傳元件的構(gòu)建和操作,熱啟動PCR尤為有效。云南樣本pcr檢測
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