常規(guī)生物學實驗中,實時定量PCR技術(RT-PCR)普遍用于microRNA的檢測實踐中,但外泌體樣品中的microRNA豐度極低,普通RT-PCR技術的靈敏度已經不能夠滿足。第三代微滴式數字PCR——ddPCR技術,成為外泌體microRNA檢測的選擇技術。微滴式數字PCR(DropletdigitalPCR),又成為“油包水PCR”,在傳統(tǒng)的PCR擴增前對樣品進行微滴化處理,即將含有核酸分子的反應體系分成成千上萬個納升級的微滴,其中每個微滴或不含待檢核酸靶分子,或者含有一個至數個待檢核酸靶分子。經PCR擴增后,逐個對每個微滴進行檢測,有熒光信號的微滴判讀為1,沒有熒光信號的微滴判讀為0,根據泊松分布原理及陽性微滴的個數與比例即可得出靶分子的起始拷貝數或濃度。外泌體的膜蛋白有可能與細胞膜蛋白作用,活躍細胞內通路。外泌體表征方法
外泌體的臨床應用:間充質干細胞是目前較普遍使用的細胞類型,它具有自我更新,多向分化、分泌細胞因子和細胞外囊泡體、免疫調節(jié)、來源普遍等特點,在流感病毒的臨床診療中取得了良好的成果。間充質干細胞來源外泌體與間充質干細胞有著相似的功能,包括修復與再生組織、阻止炎癥反應及調節(jié)機體免疫,但外泌體相對于間充質干細胞又有許多優(yōu)勢。首先,間充質干細胞來源外泌體更穩(wěn)定,更好保存,易于管理和控制,可以人為改變其內容物的種類和數量。其次,它們沒有活細胞,不會像間充質干細胞那樣可能會過多增殖而放大療效或者病變導致疾病加重;另外,它有可能避免某些針對間充質干細胞的調控問題,間充質干細胞來源外泌體有代替間充質干細胞的趨勢。外泌體的形成外泌體的提取的方式:過濾離心。
外泌體的相關成分:1、外泌體的膜同細胞一樣,是磷脂雙分子層。2、外泌體膜含有MHC-1/2蛋白,能綁定特異性的肽鏈。3、外泌體膜中有跨膜蛋白PGRL、LAMP1、LAMP2。4、外泌體膜中有膜轉運融合蛋白annexins、RAN、GTPases。5、外泌體膜上有脂質筏Chol、ceramide、SM、PC,限制膜流動,參與包括跨膜信號轉導、物質內吞、脂質及蛋白定向分選的多種功能。6、外泌體中含有核酸,包括miRNA、DNA、lncRNA、mRNA;同時還有一些蛋白、脂類也能被包裹到外泌體中。7、與外泌體產生相關的重要分子:Ral、ARF6、PLD2、RAB家族。8、一些物質進行外泌體中是特異性的:如hnRNPA2B1能結合lncRNA或miRNA特異性的序列(GGAG/CCCU),進行主動包埋。外泌體的膜同細胞一樣,是磷脂雙分子層。
Exosome,中文名外泌體,是一種能被大多數細胞分泌的微小膜泡,具有脂質雙層膜結構,直徑大約40-100nm。盡管外泌體較初在1983年就被發(fā)現(xiàn),但人們一直認為它只是一種細胞的廢棄物。然而較近幾年,人們發(fā)現(xiàn)這種微小膜泡中含有細胞特異的蛋白、脂質和核酸,能作為信號分子傳遞給其他細胞從而改變其他細胞的功能。這些發(fā)現(xiàn)點燃了人們對細胞分泌膜泡的興趣。2015年,隨著精確醫(yī)學概念的提出,越來越多的人開始關注如何能做到疾病的精確診斷和診療。外泌體作為一個新型的研究熱點,由于它在體內存在的普遍性和獲取的便捷性,已經成為了疾病診斷診療的潛在有效方式,在精確醫(yī)學發(fā)展上有著光明的前景。外泌體是其中一類小囊泡,直徑為30~150nm,密度1.10~1.18g/ml。
NTA技術已被作為外泌體表征手段之一,相較于其他表征方式NTA技術的樣本處理更簡單、更能保證外泌體原始狀態(tài)、檢測速度更快。大致方法是:將分離的外泌體樣本注入納米顆粒追蹤分析儀,用激光光束穿過樣本,激光在腔室內與顆粒相互作用時會發(fā)生散射,通過裝有攝像頭的顯微鏡收集散射光,捕捉外泌體的布朗運動,實現(xiàn)顆??梢暬?。然后使用Stokes-Einstein方程來測量粒子的平均速度,繼而估算粒子的大小。NTA能夠測量粒徑10-1000nm之間的顆粒,包含了外泌體50-150nm的徑粒范圍,但是NTA鑒定需要大于0.5毫升的樣品體積以及優(yōu)化的數據收集和分析參數,另外,NTA比較難區(qū)分與外泌體具有相似布朗運動的蛋白質聚集體,因此無法排除其他物質干擾。外泌體產生相關的重要分子:Ral、ARF6、PLD2、RAB家族。血清外泌體circRNA測序
外泌體可通過其攜帶的蛋白質、核酸、脂類等來調節(jié)受體細胞的生物學活性。外泌體表征方法
外泌體的提取分離方法:1、PEG-base沉淀法:聚乙二醇可與疏水性蛋白和脂質分子結合共沉淀,早先應用于從血清等樣本中收集病毒,現(xiàn)在也被用來沉淀外泌體,其原理可能與競爭性結合游離水分子有關。利用PEG沉淀外泌體存在不少問題:比如純度和回收率低,雜蛋白較多(假陽性),顆粒大小不均一,產生難以去除的聚合物,機械力或者吐溫-20等化學添加物將會破壞外泌體等,因此發(fā)表文章時易受質疑。2、試劑盒提取:近幾年來,市場上已出現(xiàn)各種商業(yè)化的外泌體提取試劑盒,有的是通過特殊設計的過濾器過濾掉雜質成分,有的則采用空間排阻色譜法(SEC)進行分離純化,也有的則利用化合物沉淀將法外泌體沉淀出來。外泌體表征方法
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