要了解為什么傳統(tǒng) PCR 存在限制,務必要了解 PCR 反應過程中發(fā)生了什么?;?PCR 運行可以分為三個階段:
指數(shù)期
每個循環(huán)積聚的產(chǎn)物準確加倍(假定 ** 反應效率)。該反應具有高度特異性和精確度。出現(xiàn)指數(shù)式擴增,因為所有試劑均新鮮可用,反應的動力學推動反應有利于擴增子加倍。
線性期(高變異性)
隨著反應繼續(xù),一些試劑因擴增而被消耗。反應開始減緩,并且每個循環(huán)的 PCR 產(chǎn)物不再加倍。
平臺期(終點:使用傳統(tǒng)方法進行凝膠檢測)
反應停止,不再產(chǎn)生更多產(chǎn)物,并且如果放置時間夠長,PCR 產(chǎn)物將開始降解。因為每個樣品具有不同的反應動力學,所以每支試管或每個反應將在不同的時間點進入平臺期。在平臺期可以看到這些差異。在平臺期內(nèi),傳統(tǒng) PCR 進行測量,又稱為終點檢測。 MiniDrop?研發(fā)團隊由微流控、光學、機電學、化學、臨床醫(yī)學、分子生物學等多學科交叉領域的**組成。寧波永諾數(shù)字PCR正規(guī)代理
MiniDrop數(shù)字PCR儀由Creator微滴生成儀、Detector微滴檢測儀、MD Microchip微流控芯片及MD Plotter數(shù)據(jù)分析軟件組成,該系統(tǒng)的**為微流控微滴生成技術,采用原創(chuàng)性的油液,在40um微管道中利用氣壓驅動在2分鐘內(nèi)生成50萬微滴,單次運行生成400萬微滴,微滴體積達皮升級,檢測線性范圍達到5個數(shù)量級,各項指標均超越國內(nèi)外的主流產(chǎn)品。
MiniDrop創(chuàng)新性采用高壓驅動的方法將樣本分割成50萬份,打破了國外廠商在微滴式數(shù)字PCR領域的壟斷。 廣州流式數(shù)字PCR解決方案適用復雜樣品的檢測。
數(shù)字PCR檢測及分析原理在上世紀90年代就被提出來了,但是無奈受限于當時的技術條件,樣本稀釋及分配都是靠手工來完成的,受到很多因素的干擾和限制;并且結果分析對于研究者來說也十分枯燥與繁瑣,因此在很長一段時間dPCR發(fā)展停滯不前。后來由于微流控技術與微納集成制造工藝的發(fā)展解決了dPCR過程中的幾個關鍵技術問題,推動了dPCR的研究與商業(yè)化的發(fā)展。
目前根據(jù)dPCR樣本稀釋分配的方式,基本可分為三大類,一種是基于大規(guī)模集成微流控芯片;第二種是使用微反應室/孔板;第三種是微滴式。但不論是走芯片式還是微滴式,其基本原理都是將大量稀釋后的核酸溶液分散至芯片的微反應器或者微滴當中,每個反應器的核酸模板數(shù)少于1或者等于1。經(jīng)過PCR擴增之后,有一個核酸分子的模板的反應器就會給出熒光信號,沒有模板的反應器沒有熒光信號。根據(jù)相對比例和反應器的體積,可以推算出原始溶液的核酸濃度。
定量PCR和數(shù)字PCR的特點:
5. 目前定量PCR已經(jīng)能實現(xiàn)高通量樣品條件下的自動化操作。
6. 數(shù)字PCR在單分子層面上的***定量,可以徹底擺脫對標準曲線的依賴而直接給出靶序列的拷貝數(shù),提高了實驗結果在批內(nèi)和批間的穩(wěn)定性,甚至能用來對標準品進行定標。
7. 基于***定量的方式,數(shù)字PCR結果的高重復性和高精度可實現(xiàn)微小差異的基因表達分析,如等位基因的不平衡表達、單細胞基因表達分析、microRNA表達分析等等。所謂“微小差異”的標準一般而言是指表達水平的差異在2倍以內(nèi)。
8. 同等條件下,數(shù)字PCR在靈敏度方面擁有優(yōu)勢,使得該技術已成為**的液態(tài)活檢、病原微生物檢測、轉基因成分測定、宿主殘留DNA分析等的熱門技術。
定量PCR和數(shù)字PCR的特點:
1. 在20多年的使用和發(fā)展中,定量PCR作為一種技術平臺,已經(jīng)產(chǎn)出海量的數(shù)據(jù),在工業(yè)界和分子檢測的某些應用上,定量PCR已經(jīng)成為“金標準”。基礎研究方面,則形成了被稱為MIQE的“定量PCR標準實驗指南”。
2. 在定量PCR的各種應用中,基因表達分析(gene expression analysis)的應用比重約占七成,綜合各種因素來看,眼下定量PCR還是進行基因表達研究的理想手段。
3. 上述的“各種因素”具體展開,主要包括:通量、自動化程度、各種檢測探針與染料、檢測通道、成本和可參考文獻與protocol的數(shù)目等等。
4. 就目前市場上已有的數(shù)字PCR設備來看,定量PCR在檢測的線性范圍上具有優(yōu)勢,意味著同一個run內(nèi)可對各種表達豐度的樣品進行分析。
關于甲基化含量的鑒定。寧波永諾數(shù)字PCR正規(guī)代理
數(shù)字PCR(Digtal PCR)是一種核酸定量精密檢測的新興技術手段,于20世紀由Vogelstein等提出。它是將稀釋后的核酸模板分配到大量不同的反應單元中,使每個反應單元中有一個或沒有核酸。利用PCR擴增的同時,加入可檢測熒光。待擴增結束時,使用統(tǒng)計學方法采集每個反應單元出現(xiàn)的熒光次數(shù),從而定量檢測樣本中的核酸濃度。
基于分液方式的不同,數(shù)字PCR主要分為3種:微流體數(shù)字PCR(Microfluidic digital PCR,mdPCR)、微滴數(shù)字PCR(Droplet digital PCR,ddPCR)和芯片數(shù)字PCR(Chip digital PCR,cdPCR)。
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浚和(上海)儀器有限公司是一家供應國內(nèi)外先進儀器和設備的專業(yè)供應商和服務商,致力于為客戶提供專業(yè)的定制化解決方案。多年來,持續(xù)為醫(yī)藥、化工、高校、科研單位、檢測院等多個行業(yè)提供先進的產(chǎn)品和專業(yè)的服務。
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公司主要經(jīng)營產(chǎn)品包括:等離子清洗機、真空泵、噴霧干燥器、數(shù)字PCR、高壓滅菌鍋、培養(yǎng)箱、切片機、水分測定儀、激光粒度儀、光譜儀、溫濕度記錄儀等,目前主要合作品牌有:日本雅馬拓YAMATO、日本KASHIYAMA、日本HORIBA、廣州永諾 、日本KEM等。同時,公司還提供專業(yè)的技術服務,如設備的維護、驗證等。
浚和儀器將始終以行業(yè)特點為立足點,以客戶需求為導向,不斷地提高自身專業(yè)技術能力,不停地完善客戶服務質(zhì)量,在發(fā)展中保持創(chuàng)新的精神,力求與客戶共同進步,為行業(yè)的發(fā)展作出不懈的努力。