要了解為什么傳統(tǒng) PCR 存在限制,務必要了解 PCR 反應過程中發(fā)生了什么?;?PCR 運行可以分為三個階段:
指數期
每個循環(huán)積聚的產物準確加倍(假定 ** 反應效率)。該反應具有高度特異性和精確度。出現(xiàn)指數式擴增,因為所有試劑均新鮮可用,反應的動力學推動反應有利于擴增子加倍。
線性期(高變異性)
隨著反應繼續(xù),一些試劑因擴增而被消耗。反應開始減緩,并且每個循環(huán)的 PCR 產物不再加倍。
平臺期(終點:使用傳統(tǒng)方法進行凝膠檢測)
反應停止,不再產生更多產物,并且如果放置時間夠長,PCR 產物將開始降解。因為每個樣品具有不同的反應動力學,所以每支試管或每個反應將在不同的時間點進入平臺期。在平臺期可以看到這些差異。在平臺期內,傳統(tǒng) PCR 進行測量,又稱為終點檢測。 數字PCR技術是公認的液體活檢領域靈敏度比較好的檢測方法。廣州JUE對定量數字PCR
與常規(guī)PCR方法相比,數字PCR有如下優(yōu)勢:
1、能夠***定量:常規(guī)PCR定量需要制定已知拷貝數的標準DNA曲線,但是由于待檢樣本與標準曲線不在統(tǒng)一體系,條件上會存在差異,另外加上PCR擴增效率的差異從而影響定量結果的準確性。而數字PCR不受標準曲線和擴增動力學影響,可進行***定量。
2、樣本需求量低:適用于珍貴樣本或核酸降解嚴重的樣本。
3、靈敏度高:數字PCR是將傳統(tǒng)PCR反應體系分割成數萬個**PCR反應,這些反應可以精確地檢測很小的目的片段差異、單拷貝甚至低濃度的混雜樣本。且能避免非同源異質雙鏈的形成。
4、高耐受性:由于目的序列被分配到多個**反應體系中,***降低了背景信號和***物對反應的干擾,擴增基質效應大大減小。 無錫流式數字PCR解決方案MiniDrop?研發(fā)團隊由微流控、光學、機電學、化學、臨床醫(yī)學、分子生物學等多學科交叉領域的**組成。
MiniDrop數字PCR儀由Creator微滴生成儀、Detector微滴檢測儀、MD Microchip微流控芯片及MD Plotter數據分析軟件組成,該系統(tǒng)的**為微流控微滴生成技術,采用原創(chuàng)性的油液,在40um微管道中利用氣壓驅動在2分鐘內生成50萬微滴,單次運行生成400萬微滴,微滴體積達皮升級,檢測線性范圍達到5個數量級,各項指標均超越國內外的主流產品。
MiniDrop創(chuàng)新性采用高壓驅動的方法將樣本分割成50萬份,打破了國外廠商在微滴式數字PCR領域的壟斷。
MicroDrop-100微滴式數字PCR 應用范圍如下:
a. 動植物檢驗檢疫,動物源性分析、極微量病原菌檢測定量分析、轉基因產品檢測;
b. 降低篩查成本、縮短檢測周期,適用于T13\T18\T21三體綜合征等遺傳病的風險評估;適用于zhong瘤早期篩查、分子分型、靶向用藥和療效監(jiān)測等;適用于傳染性疾病的早期診斷和診療指導;
c. 可用于DNA甲基化的檢測、CRISPR-Cas9基因編輯效率檢測等。
d.基因表達差異監(jiān)測單細胞研究:測序、PCR
e.無創(chuàng)產前篩查:低成本、快速、傳染性疾?。篐BV、HIV、COVID-19 定量
無創(chuàng)產前篩查:低成本、快速。
CNV(Copy Number Variations,拷貝數變異)研究需要極高的定量精度以區(qū)別不同拷貝數之間的微小差異,測序方法適用于高于30%的變異率檢測,而qPCR的比較**辨在1.5倍左右,數字PCR通過直接計數目標基因與參照基因( 拷貝數為1的基因,例如RNaseP) 的數目,計算比值,直接得到目標基因的拷貝數可以達到極高的拷貝數分辨精度。
除此之外,dPCR在病原微生物檢測、microRNA研究、基因表達研究、NGS測序文庫的***定量、表觀遺傳學直接相關的DNA甲基化定量檢測、ChIP定量鑒定等領域的應用都令人極為期待,而在轉基因成分鑒定、分子標準品精確定量、環(huán)境樣本檢測等具體的應用方向上,已經有大量實驗數據和結果證明了dPCR技術的優(yōu)良性能。
關于甲基化含量的鑒定。無錫JUE對定量數字PCR哪家好
單細胞研究:測序、PCR。廣州JUE對定量數字PCR
**個體化診療
通過檢測T790M位點突變情況,可以更好地評估一代TKI***的療效及耐藥情況并指導第三代TKI靶向藥Osimertinib的使用。然而,由于qPCR平臺ARMS檢測技術的靈敏度有限,沒有辦法在含大量EGFR基因野生型背景核酸中高效準確的檢測到T790M突變。這個時候dPCR技術展現(xiàn)出了****的檢測精度,此外,dPCR***定量的優(yōu)勢也能充分發(fā)揮出來了,可以監(jiān)控突變含量變化,做到及早發(fā)現(xiàn)耐藥。
2.)基因表達分析
伊馬替尼(Imatinib)可以有效幫助很多慢性髓細胞白血?。–ML)患者延長生存期,但是臨床上發(fā)現(xiàn),伊馬替尼的療效與BCR-ABL1融合基因的轉錄產物表達量有很大的關系。研究人員采用dPCR對CML患者的BCR-ABL1融合基因轉錄產物進行測定,結果檢測下限可以達到0.001%,顯示出dPCR在痕量核酸檢測方面比qPCR具有無可比擬的優(yōu)勢 廣州JUE對定量數字PCR
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