數(shù)字PCR也叫Digital PCR(dPCR),是近幾年發(fā)展起來的一種核酸定量分析技術(shù)。相較于傳統(tǒng)熒光定量PCR來說,數(shù)字PCR對結(jié)果的判定不依賴于擴增曲線循環(huán)Ct值,不受擴增效率的影響,能夠直接讀出DNA的分子個數(shù),能夠?qū)ζ鹗紭颖竞怂岱肿?**定量。
數(shù)字PCR基本原理是將一個樣本分成幾十到幾萬份,然后再將其分配到不同的反應單元中,使每個微滴單元包含一個或多個拷貝的核酸分子(即DNA模板),每個單元都會對目標分子進行擴增,然后再對每個單元進行熒光信號的統(tǒng)計并計算。相對而言,傳統(tǒng)PCR或qPCR反應都是發(fā)生于同一體系當中,這也是數(shù)字PCR與其比較大的區(qū)別。
線性范圍達到6個數(shù)量級,靈敏度高達萬分之一。杭州微滴式數(shù)字PCR簡介
CNV(Copy Number Variations,拷貝數(shù)變異)研究需要極高的定量精度以區(qū)別不同拷貝數(shù)之間的微小差異,測序方法適用于高于30%的變異率檢測,而qPCR的比較**辨在1.5倍左右,數(shù)字PCR通過直接計數(shù)目標基因與參照基因( 拷貝數(shù)為1的基因,例如RNaseP) 的數(shù)目,計算比值,直接得到目標基因的拷貝數(shù)可以達到極高的拷貝數(shù)分辨精度。
除此之外,dPCR在病原微生物檢測、microRNA研究、基因表達研究、NGS測序文庫的***定量、表觀遺傳學直接相關(guān)的DNA甲基化定量檢測、ChIP定量鑒定等領(lǐng)域的應用都令人極為期待,而在轉(zhuǎn)基因成分鑒定、分子標準品精確定量、環(huán)境樣本檢測等具體的應用方向上,已經(jīng)有大量實驗數(shù)據(jù)和結(jié)果證明了dPCR技術(shù)的優(yōu)良性能。
杭州微滴式數(shù)字PCR簡介FAM、VIC雙通道熒光檢測。
無創(chuàng)產(chǎn)前檢查
鐮狀細胞貧血(sickle cell anemia)是HBB基因突變引起的常染色體顯性遺傳病,有嚴重的危害,可以導致高達5%的胎兒死亡率及4.62%的孕婦死亡率。而精細有效的無創(chuàng)產(chǎn)前診斷是預防鐮狀細胞貧血患兒出生的有效方法。研究人員采用dPCR技術(shù)檢測孕婦胎兒游離DNA(cff-DNA)HBB基因突變。結(jié)果顯示,dPCR技術(shù)能夠確定87%的男性胎兒(n=45)和75%的女性胎兒(n=20)HBB基因的突變狀態(tài)。當cff-DNA濃度大于7%時,可以**的檢測出HBB基因突變[3],可以說是相當厲害了。
數(shù)字PCR是一種核酸分子***值定量技術(shù),能夠直接數(shù)出DNA分子的個數(shù),是對起始樣品的***值定量。該試劑盒采用創(chuàng)新的一步法逆轉(zhuǎn)錄數(shù)字PCR技術(shù),將*****的RNA逆轉(zhuǎn)錄及數(shù)字PCR擴增整合到一個反應體系,單管雙檢同時測定*****的兩個**基因,消除***變異帶來的漏檢風險。
MicroDrop-100全新微滴式數(shù)字PCR系統(tǒng)為永諾生物旗下子公司永諾醫(yī)療自主研發(fā)的檢測設(shè)備,此系統(tǒng)檢測無需依賴標準物質(zhì),可達到***定量,具有超高靈敏度,檢測靈敏度高達1個拷貝,且具有較好的重復性,降低同樣本不同批次的檢測差異。數(shù)字PCR結(jié)果采取終點判讀法,相比熒光定量PCR的過程性讀取可有效降低對PCR 擴增效率的依賴、降低PCR***物對檢測結(jié)果的影響,對于復雜樣本也能提供穩(wěn)定的檢測結(jié)果等特點,在******臨床實驗及***患者的治療過程中可發(fā)揮重要作用。 高靈敏度——數(shù)字PCR的靈敏度與同體積反應體系的分割份數(shù)成正比。
定量PCR和數(shù)字PCR的特點:
1. 在20多年的使用和發(fā)展中,定量PCR作為一種技術(shù)平臺,已經(jīng)產(chǎn)出海量的數(shù)據(jù),在工業(yè)界和分子檢測的某些應用上,定量PCR已經(jīng)成為“金標準”。基礎(chǔ)研究方面,則形成了被稱為MIQE的“定量PCR標準實驗指南”。
2. 在定量PCR的各種應用中,基因表達分析(gene expression analysis)的應用比重約占七成,綜合各種因素來看,眼下定量PCR還是進行基因表達研究的理想手段。
3. 上述的“各種因素”具體展開,主要包括:通量、自動化程度、各種檢測探針與染料、檢測通道、成本和可參考文獻與protocol的數(shù)目等等。
4. 就目前市場上已有的數(shù)字PCR設(shè)備來看,定量PCR在檢測的線性范圍上具有優(yōu)勢,意味著同一個run內(nèi)可對各種表達豐度的樣品進行分析。
液體活檢:早篩、用藥、監(jiān)測、復發(fā)。杭州微滴式數(shù)字PCR簡介
產(chǎn)品特點
無需依賴傳統(tǒng)熒光定量PCR的標準曲線即可實現(xiàn)核酸的***定量。
全封閉防污染設(shè)計,一鍵式自動化操作。
采用主流可靠的解決方案,系統(tǒng)由微滴生成儀、微滴檢測儀、數(shù)據(jù)分析軟件組成,并可選配同品牌封膜儀、PCR儀等
微滴生成采用油包水乳化微滴技術(shù),在微管道中利用氣壓驅(qū)動,2mins生成高達10萬個皮升級的微滴,高效高產(chǎn),支持多重數(shù)字PCR的開發(fā)。
微滴生成芯片為高精度微流控芯片設(shè)計,三維微納防污染結(jié)構(gòu),一張芯片可同時處理8個樣本。
微滴檢測使用雙通道熒光,支持EvaGreen染料法及探針法。
檢測線性范圍達到6個數(shù)量級,基因突變檢測靈敏度高達0.01%。
檢測通量高,可一次檢測高達96個樣本,支持靈活設(shè)定。
全中文分析軟件,人性化界面設(shè)置,多種分析工具供用戶選擇。
本系統(tǒng)為開放式平臺,可使用第三方PCR反應液,支持用戶自行開發(fā)試劑、產(chǎn)品。
杭州微滴式數(shù)字PCR簡介
浚和(上海)儀器有限公司是一家供應國內(nèi)外先進儀器和設(shè)備的專業(yè)供應商和服務(wù)商,致力于為客戶提供專業(yè)的定制化解決方案。多年來,持續(xù)為醫(yī)藥、化工、高校、科研單位、檢測院等多個行業(yè)提供先進的產(chǎn)品和專業(yè)的服務(wù)。
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