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質(zhì)粒載體的分類(lèi):按復(fù)制形式:分為嚴(yán)緊型和松弛型復(fù)制。根據(jù)質(zhì)粒DNA復(fù)制與宿主之間的關(guān)系或在宿主細(xì)胞的拷貝數(shù)的多少,可以將質(zhì)粒分為兩種不同的復(fù)制類(lèi)型:嚴(yán)緊型和松弛型。嚴(yán)緊型質(zhì)粒復(fù)制受宿主染色體DNA復(fù)制的嚴(yán)格控制,拷貝數(shù)較小一般只有1~3個(gè)拷貝。疏松型質(zhì)粒的復(fù)制...
上述建議是基于現(xiàn)有科學(xué)認(rèn)識(shí),隨著臨床研究和應(yīng)用數(shù)據(jù)的積累,以及對(duì)免疫細(xì)胞zhiliao產(chǎn)品了解的深入,可能會(huì)對(duì)隨訪時(shí)間的建議進(jìn)行調(diào)整。根據(jù)臨床試驗(yàn)的研究計(jì)劃和持續(xù)時(shí)間,長(zhǎng)期隨訪可能作為臨床試驗(yàn)的一部分,或者設(shè)計(jì)為一項(xiàng)單獨(dú)研究,如果對(duì)長(zhǎng)期監(jiān)測(cè)有一個(gè)單獨(dú)的研究方案...
改進(jìn)Cas變體使用SpCas9和SaCas9 變體:已研發(fā)出諸如SpCas9-Nickase、dCas9 、dCas9–FokI、xCas9、Cas9-NG、evoCas9、SpCas9 – HFI、eSpCas9和Hypa-Cas9等多種Cas變體,可降低脫...
實(shí)時(shí)熒光定量PCR,其定量的基本原理是在PCR反應(yīng)體系中加入非特異性的熒光染料(如:SYBRGREENI)或特異性的熒光探針(如:Taqman探針),實(shí)時(shí)檢測(cè)熒光量的變化,獲得不同樣品達(dá)到一定的熒光信號(hào)(閾值)時(shí)所需的循環(huán)次數(shù):CT值(CycleThresho...
誘導(dǎo)多能干細(xì)胞來(lái)源的細(xì)胞產(chǎn)品。誘導(dǎo)多能干細(xì)胞(inducedpluripotentstemcell,iPS)自身具有致瘤性風(fēng)險(xiǎn),在體內(nèi)可形成畸胎瘤,整合病毒載體的使用和誘導(dǎo)多能性可能增加iPS細(xì)胞插入致突變性和致性的風(fēng)險(xiǎn)。因此,應(yīng)在shou次臨床試驗(yàn)前完成...
免疫細(xì)胞zhiliao產(chǎn)品的劑量描述,很多免疫細(xì)胞zhiliao產(chǎn)品的細(xì)胞組成并非均一,往往包含多種類(lèi)型的細(xì)胞,起主要zhiliao作用的可能是其中一種細(xì)胞類(lèi)型,但不良反應(yīng)可能受同一產(chǎn)品中其它類(lèi)型細(xì)胞的影響。在描述免疫細(xì)胞zhiliao產(chǎn)品的劑量時(shí),需要考慮產(chǎn)...
慢病毒是逆轉(zhuǎn)錄病毒的一類(lèi),慢病毒整合到宿主細(xì)胞的染色體上可以長(zhǎng)期穩(wěn)定表達(dá),并且與其他逆轉(zhuǎn)錄病毒(例如腺病毒)相比,慢病毒不但能ganran分裂期細(xì)胞,而且還能ganran非分裂期的細(xì)胞?;谝陨蟽?yōu)點(diǎn),慢病毒載體(lentiviral vector)作為外源基因...
基于已有科學(xué)經(jīng)驗(yàn)和既往非臨床/臨床研究結(jié)果,如果認(rèn)為基因修飾細(xì)胞所采用的載體系統(tǒng)可將外源基因整合到細(xì)胞基因組中并可在體內(nèi)長(zhǎng)期存續(xù),需綜合分析以上風(fēng)險(xiǎn)因素,評(píng)估潛在的插入突變、致瘤/致性風(fēng)險(xiǎn)。非臨床研究,應(yīng)采用具有代表性的基因轉(zhuǎn)導(dǎo)細(xì)胞進(jìn)行基因整合位點(diǎn)分析,分析細(xì)...
自基因zhiliao出現(xiàn)之日起,安全性問(wèn)題就隨之產(chǎn)生了,并成為阻礙基因zhiliao研發(fā)的一大障礙,吳寧博士認(rèn)為:“基因zhiliao產(chǎn)品的研發(fā)和上市,安全性會(huì)將是一個(gè)非常重要考量。如果一款產(chǎn)品它安全性有問(wèn)題的話,在市場(chǎng)化道路上就會(huì)受到很大影響。尤其是基因zh...
細(xì)胞經(jīng)基因修飾后會(huì)改變其生物學(xué)特性,同時(shí)也會(huì)帶來(lái)新的安全性風(fēng)險(xiǎn),如基因編輯脫靶風(fēng)險(xiǎn)、載體插入突變風(fēng)險(xiǎn)、載體重組風(fēng)險(xiǎn)、表達(dá)的轉(zhuǎn)基因產(chǎn)物的風(fēng)險(xiǎn)等。在制定非臨床研究計(jì)劃時(shí),除參考《細(xì)胞zhilliao產(chǎn)品研究與評(píng)價(jià)技術(shù)指導(dǎo)原則》(試行)中的對(duì)細(xì)胞zhilliao產(chǎn)品...
如何檢測(cè)脫靶效應(yīng)?在gRNA修飾中,截短的sgRNA是一種減少脫靶效應(yīng)的簡(jiǎn)單方法,并且基于RNP的遞送在大多數(shù)情況下適用于獲得更高的目標(biāo)活性。此外,選擇合適的Cas變體對(duì)于減少脫靶效應(yīng)也至關(guān)重要。但選擇合適的脫靶檢測(cè)工具,也是重中之重。脫靶預(yù)測(cè)結(jié)合PCR檢測(cè)法...
Southern blot 是一種常用的 DNA 定量的分子生物學(xué)方法。其原理是將待測(cè)的 DNA 樣品固定在固相載體(硝酸纖維膜或尼龍膜)上,與標(biāo)記的核酸探針進(jìn)行雜交,在與探針有同源序列的固相 DNA 的位置上顯示出雜交信號(hào),通過(guò)檢測(cè)信號(hào)的有無(wú)、強(qiáng)弱可以對(duì)樣品...
檢測(cè)方法的敏感度、特異性和可重復(fù)性應(yīng)經(jīng)過(guò)驗(yàn)證,并設(shè)計(jì)適當(dāng)?shù)年?yáng)性和陰性對(duì)照;當(dāng)體內(nèi)靶細(xì)胞或替代細(xì)胞中載體序列陽(yáng)性的比例超出預(yù)期范圍時(shí),應(yīng)開(kāi)展克隆性生長(zhǎng)的評(píng)估。如果存在優(yōu)勢(shì)克隆或單克隆生長(zhǎng),應(yīng)在不超過(guò)3個(gè)月的時(shí)間內(nèi)再次檢測(cè)確認(rèn),并盡快開(kāi)展整合位點(diǎn)的分析。當(dāng)載體的整...
CIRCLE-seq和CHANGE-seq與SITE-seq同期發(fā)表的CIRCLE-seq一定程度上解決了SITE-seq的一些問(wèn)題。CIRCLE-seq的第一步是將純化后的基因組DNA隨機(jī)打斷成300bp左右的片段,然后首尾相連成環(huán)狀DNA,這種方法很好地避...
如何檢測(cè)脫靶效應(yīng)?在gRNA修飾中,截短的sgRNA是一種減少脫靶效應(yīng)的簡(jiǎn)單方法,并且基于RNP的遞送在大多數(shù)情況下適用于獲得更高的目標(biāo)活性。此外,選擇合適的Cas變體對(duì)于減少脫靶效應(yīng)也至關(guān)重要。但選擇合適的脫靶檢測(cè)工具,也是重中之重。脫靶預(yù)測(cè)結(jié)合PCR檢測(cè)法...
用低拷貝質(zhì)粒作表達(dá)載體有什么好處?因?yàn)楦呖截愘|(zhì)粒穩(wěn)定性低,而且給宿主細(xì)胞的壓力大。低拷貝數(shù)的質(zhì)粒DNA在宿主細(xì)胞分裂前只能復(fù)制1~2次,而多拷貝數(shù)質(zhì)粒可以在細(xì)胞分裂前復(fù)制成10~200拷貝。高拷貝數(shù)的質(zhì)粒稱為松弛型質(zhì)粒(relaxedplasmid),單獨(dú)于細(xì)...
基因編輯定量脫靶檢測(cè):基因編輯定量脫靶檢測(cè),使用CRISPR/Cas9、ZFNs和TALENs等設(shè)計(jì)核酸酶進(jìn)行基因組編輯,可以將遺傳物質(zhì)定向?qū)氩溉閯?dòng)物基因組的特定位點(diǎn)。然而,可能會(huì)出現(xiàn)非預(yù)期的靶上和靶外基因組修飾,這可能導(dǎo)致基因組不穩(wěn)定,并破壞正常基因的功能...
質(zhì)粒的接合轉(zhuǎn)移與穿梭質(zhì)粒質(zhì)粒的接合轉(zhuǎn)移:是細(xì)菌遺傳物質(zhì)轉(zhuǎn)移的一個(gè)重要方式。在質(zhì)粒轉(zhuǎn)移過(guò)程中,供體菌和受體菌通過(guò)結(jié)合作用緊密接觸,質(zhì)粒從供體細(xì)胞向受體轉(zhuǎn)移,同時(shí)進(jìn)行質(zhì)粒復(fù)制。按能否自主轉(zhuǎn)移,可以將天然存在的質(zhì)粒分為轉(zhuǎn)移型質(zhì)粒和非轉(zhuǎn)移型質(zhì)粒兩大類(lèi)。這里要注意的是,...
由于設(shè)計(jì)的sgRNA會(huì)與非靶點(diǎn)DNA序列錯(cuò)配,引入非預(yù)期的基因突變,即脫靶效應(yīng)(Off-targeteffects)。脫靶效應(yīng)造成了研究中的許多不確定性,這無(wú)疑限制了該技術(shù)的應(yīng)用。因此,研究者希望能開(kāi)發(fā)有效的方法來(lái)檢測(cè)脫靶效應(yīng)。在目前主流的脫靶效應(yīng)評(píng)估方法中,...
先導(dǎo)編輯器:CBE和ABE組合使用可以有效地進(jìn)行4種堿基轉(zhuǎn)換(C→T, G→A, A→G, T→C),而無(wú)需產(chǎn)生DSB,然而除了這4種堿基轉(zhuǎn)換,對(duì)另外8種堿基轉(zhuǎn)換(C→A, C→G, G→C, G→T, A→C, A→T, T→A, T→G)以及堿基的插入和缺...
CRISPR/Cas9的問(wèn)題:和TALEN和ZFNS技術(shù)一樣,CRISPR/Cas9技術(shù)在應(yīng)用時(shí)也存在一定概率的脫靶問(wèn)題——Cas9核酸酶在非目標(biāo)位點(diǎn)發(fā)生切割,引入非預(yù)期的基因突變。脫靶切割引入的突變可能會(huì)直接破壞細(xì)胞的基本功能,帶來(lái)不可預(yù)控的嚴(yán)重后果。如何減...
臨床研究人群,如果一種基因zhiliao產(chǎn)品具有引起遲發(fā)性不良反應(yīng)的風(fēng)險(xiǎn),需要開(kāi)展長(zhǎng)期隨訪觀察時(shí),所有接受基因zhiliao產(chǎn)品的受試者在簽署知情同意書(shū)后均應(yīng)入組長(zhǎng)期隨訪臨床研究。在設(shè)計(jì)長(zhǎng)期隨訪臨床研究的方案時(shí),應(yīng)考慮目標(biāo)受試者人群及特征、整體健康情況以及接受...
2022年2月下旬,在醫(yī)麥客舉辦的年度盛會(huì)——“蓄力前行,助航新生——2021 CSGCT基因與細(xì)胞zhiliao醫(yī)學(xué)峰會(huì)”期間,唯可生物創(chuàng)始人兼CEO-吳寧博士分享了唯可生物在基因zhiliao賽道針對(duì)安全性展開(kāi)的技術(shù)服務(wù),讓在場(chǎng)行業(yè)大咖和觀眾真正領(lǐng)會(huì)到IS...
對(duì)基于慢病毒/逆轉(zhuǎn)錄病毒載體的基因zhiliao產(chǎn)品,如出現(xiàn)與可復(fù)制xingbing毒可能相關(guān)的不良事件,還應(yīng)開(kāi)展可復(fù)制xingbing毒(replicablecompetentlentivirus/retrovirus,RCL/RCR)的檢測(cè)。關(guān)于基因編輯產(chǎn)...
病人在6個(gè)月后達(dá)到MRD陰性,CAR-T細(xì)胞在4.2年后仍然可以在外周血檢測(cè)到,并且骨髓中檢測(cè)不到B細(xì)胞liu克隆。二代測(cè)序整合位點(diǎn)分析顯示這是因?yàn)槟承〤AR-T細(xì)胞的融合位置位于TET2基因9號(hào)到10號(hào)外顯子之間可變剪切區(qū)域,導(dǎo)致TET2基因跳讀和功能障礙,...
細(xì)胞經(jīng)基因修飾后會(huì)改變其生物學(xué)特性,同時(shí)也會(huì)帶來(lái)新的安全性風(fēng)險(xiǎn),如基因編輯脫靶風(fēng)險(xiǎn)、載體插入突變風(fēng)險(xiǎn)、載體重組風(fēng)險(xiǎn)、表達(dá)的轉(zhuǎn)基因產(chǎn)物的風(fēng)險(xiǎn)等。在制定非臨床研究計(jì)劃時(shí),除參考《細(xì)胞zhilliao產(chǎn)品研究與評(píng)價(jià)技術(shù)指導(dǎo)原則》(試行)中的對(duì)細(xì)胞zhilliao產(chǎn)品...
質(zhì)粒載體的分類(lèi):按復(fù)制形式:分為嚴(yán)緊型和松弛型復(fù)制。根據(jù)質(zhì)粒DNA復(fù)制與宿主之間的關(guān)系或在宿主細(xì)胞的拷貝數(shù)的多少,可以將質(zhì)粒分為兩種不同的復(fù)制類(lèi)型:嚴(yán)緊型和松弛型。嚴(yán)緊型質(zhì)粒復(fù)制受宿主染色體DNA復(fù)制的嚴(yán)格控制,拷貝數(shù)較小一般只有1~3個(gè)拷貝。疏松型質(zhì)粒的復(fù)制...
基因編輯定量脫靶檢測(cè):基因編輯定量脫靶檢測(cè),使用CRISPR/Cas9、ZFNs和TALENs等設(shè)計(jì)核酸酶進(jìn)行基因組編輯,可以將遺傳物質(zhì)定向?qū)氩溉閯?dòng)物基因組的特定位點(diǎn)。然而,可能會(huì)出現(xiàn)非預(yù)期的靶上和靶外基因組修飾,這可能導(dǎo)致基因組不穩(wěn)定,并破壞正常基因的功能...
對(duì)于CAR修飾的免疫細(xì)胞,應(yīng)采用多種體外方法評(píng)估其胞外抗原識(shí)別區(qū)的脫靶風(fēng)險(xiǎn)。TCR修飾免疫細(xì)胞的脫靶毒性可通過(guò)評(píng)估TCR與人體自身抗原肽的交叉識(shí)別能力來(lái)評(píng)估。首先,應(yīng)采用體外試驗(yàn)測(cè)定TCR修飾的免疫細(xì)胞與人自身抗原肽-HLA(與遞呈靶抗原肽的HLA等位基因相同...
國(guó)內(nèi)外基因zhiliao產(chǎn)品開(kāi)展的非臨床研究、長(zhǎng)期隨訪獲得的臨床經(jīng)驗(yàn)以及基因組整合位點(diǎn)分析方法的明顯改進(jìn),都有助于更好地理解整合性基因zhiliao載體相關(guān)風(fēng)險(xiǎn)。通常認(rèn)為,很多能夠介導(dǎo)外源基因轉(zhuǎn)入細(xì)胞核的載體(如逆轉(zhuǎn)錄病毒載體、轉(zhuǎn)座子元件和基因編輯產(chǎn)品等)有基...