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蘇州RIP免疫沉淀實驗視頻

來源： 發(fā)布時間：2024-06-01

Co-IP的實驗步驟：
1. 細胞裂解：首先，細胞或組織被裂解，釋放其中的蛋白質。
2. 抗體結合：然后，將特異性抗體（針對已知蛋白質之一的抗體）加入到裂解物中。這些抗體會特異性地結合到目標蛋白（誘餌蛋白）上。
3. 免疫復合物形成：抗體與目標蛋白結合后，形成免疫復合物。
4. 沉淀：接著，使用蛋白A或蛋白G結合的珠子（如瓊脂糖或磁性珠子）來捕獲免疫復合物。蛋白A或蛋白G能夠與抗體的Fc部分結合，從而拉下抗體以及與之結合的目標蛋白和任何相關的相互作用蛋白。
5. 洗滌：捕獲的免疫復合物被洗滌以去除未特異性結合的蛋白質。
6. 洗脫和分析：免疫復合物被洗脫并進行進一步的分析，如Western blot（WB）或質譜分析，以鑒定相互作用的蛋白質。
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RIP實驗步驟通常包括：
1. 細胞收集與交聯(lián)：培養(yǎng)細胞至適當密度。使用交聯(lián)劑（如甲醛）進行交聯(lián)，以固定蛋白質-RNA復合物。
2. 細胞裂解：收集細胞并進行裂解，釋放RNA-蛋白質復合物。在裂解過程中添加蛋白酶抑制劑以防止蛋白質降解。
3. 超聲處理：使用超聲波破壞細胞，獲得更小的染色質片段，這有助于后續(xù)步驟中抗體的接觸。
4. 除去細胞碎片：通過離心去除細胞碎片和未裂解的細胞，收集含RNA-蛋白質復合物的上清液。
5. 免疫沉淀：將針對特定RNA結合蛋白（RBP）的抗體加入到上清液中。孵育一段時間，使抗體與目標蛋白充分結合。
6. 捕獲免疫復合物：添加蛋白A或蛋白G結合的磁珠或瓊脂糖珠。孵育使抗體-蛋白質-RNA復合物與珠子結合。
7. 洗滌：多次洗滌珠子以去除未特異性結合的蛋白質和RNA。
8. 洗脫與逆轉交聯(lián)：使用適當?shù)木彌_液洗脫免疫復合物。使用蛋白酶K處理樣品以逆轉交聯(lián)，釋放RNA。
9. RNA提取與純化：從免疫沉淀樣品中提取RNA，并進行純化。
10. RNA分析：使用qPCR、Northern blot、RNA-Seq等方法分析沉淀的RNA，以確定與目標蛋白相互作用的RNA種類。
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免疫沉淀（ChIP）實驗中抗體的選擇非常關鍵，因為抗體的特異性和親和力直接影響到實驗的成功與否。
1. 特異性：抗體應當對目標蛋白具有高度的特異性，以避免與其他蛋白發(fā)生非特異性結合，導致假陽性結果。
2. 親和力：抗體對目標蛋白的親和力要足夠高，以確保在免疫沉淀過程中能夠有效地捕獲目標蛋白。
3. 抗體類型：單克隆抗體和多克隆抗體都可以用于IP實驗。單克隆抗體提供更高的特異性和批間一致性，而多克隆抗體可能提供更強的結合能力和更廣的表位覆蓋。
4. 應用驗證：選擇已經過免疫沉淀（ChIP）或相關應用（如Western blot, IHC）驗證的抗體，這增加了實驗成功的可能性。
5. 供應商信息：選擇信譽良好的抗體供應商，并查看供應商提供的技術數(shù)據(jù)和客戶評價，以幫助做出決策。

免疫沉淀技術（Immunoprecipitation，簡稱IP）是一種生物化學方法，它利用特異性抗體對抗原進行親和純化。在含有目的抗原的細胞裂解液中加入特定的抗體以及Protein A/G-Beads（預先將Protein A/G固定結合在磁珠上），根據(jù)抗原與抗體、Protein A/G與抗體的Fc的特異性，形成“抗原-抗體-Protein A/G-Beads”復合物，清洗離心后去除溶液中未結合的雜蛋白，檢測是否存在目的蛋白。
免疫沉淀技術常用于從細胞或組織裂解物中分離用于免疫印跡檢測或其他檢測技術的蛋白和其他生物分子。它的目標是分離足夠用于Western Blot或其他檢測方法檢測的蛋白質。
免疫沉淀的操作步驟？

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免疫沉淀技術RIP（RNA Immunoprecipitation，RNA免疫沉淀）是一種用于研究細胞內RNA與蛋白質相互作用的技術。RIP技術可以幫助我們了解轉錄后調控網絡的動態(tài)過程，并發(fā)現(xiàn)miRNA等非編碼RNA的調節(jié)靶點。
RIP技術的原理是利用針對特定RNA結合蛋白的抗體，將細胞內的RNA-蛋白質復合物沉淀下來。然后，可以通過分離純化，對這些復合物中的RNA進行檢測，如qPCR驗證或測序分析。
表觀遺傳學和RNA生物學領域對不同RNA作用和功能的關注增加。RNA-蛋白質相互作用能夠調控mRNA和非編碼RNA的功能。對RNA潛能的這一新認識帶動了新方法的發(fā)展，使研究人員能夠定位 RNA-蛋白質相互作用。
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免疫沉淀技術（Immunoprecipitation, IP）是一種用于研究蛋白質相互作用、蛋白質復合物組成以及特定蛋白質的表達和純化的實驗技術。
基本原理
免疫沉淀技術基于抗體與特定蛋白質（抗原）之間的特異性相互作用。通過使用針對目標蛋白質的特異性抗體，可以從含有多種蛋白質的復雜樣本中捕獲并富集目標蛋白質。
免疫沉淀技術有多種類型，包括：
1. 個別免疫沉淀法（Individual IP）
2. 免疫共沉淀法（Co-IP）
3. 染色質免疫沉淀法（ChIP）
4. RNA免疫沉淀法（RIP）
近年來，免疫沉淀技術在固相支持物的選擇上有了很大進步。磁性微珠因其操作簡便、快速和自動化程度高而逐漸取代了傳統(tǒng)的瓊脂糖樹脂。
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