ChIP實驗的基本步驟包括:
1. 交聯(lián)(Crosslinking):細胞被甲醛等交聯(lián)劑處理,使得蛋白質和DNA之間的相互作用被固定,形成穩(wěn)定的蛋白質-DNA復合物。
2. 細胞裂解:裂解細胞,釋放染色質,同時保持蛋白質-DNA復合物的完整性。
3. 超聲或酶解:通過超聲或酶解將染色質切割成較小的片段,以便于后續(xù)步驟中的免疫沉淀。
4. 免疫沉淀(Immunoprecipitation):加入針對特定組蛋白修飾或轉錄因子的抗體,這些抗體會特異性地結合到目標蛋白質上。
5. 捕獲復合物:使用蛋白A或蛋白G結合的珠子捕獲抗體-蛋白質-DNA復合物。
6. 洗滌:洗滌珠子以去除未特異性結合的蛋白質和DNA片段。
7. 逆轉錄交聯(lián):將捕獲的復合物從珠子上洗脫,并進行逆轉錄交聯(lián),使固定的蛋白質-DNA復合物分離。
8. DNA純化:純化從免疫沉淀中得到的DNA片段。
9. 分析:通過qPCR、芯片分析(ChIP-chip)或高通量測序(ChIP-seq)等方法分析沉淀的DNA片段,以確定特定蛋白質在基因組上的結合位點。
免疫沉淀抗體的選擇?南京anti DYKDDDDK免疫沉淀磁珠現(xiàn)貨
免疫沉淀ChIP實驗中磁珠還是瓊脂糖珠的選擇取決于客戶實驗情況。
瓊脂糖珠海綿狀的結構 (直徑 50-150 μm) 可以結合抗體 (繼而結合靶蛋白) ,它能夠直接高效、快速結合抗體,而不需借助特殊的專業(yè)設備。瓊脂糖珠呈多孔結構,這使得它們擁有更大的表面積可與蛋白質相互接觸,具有更高的結合載量。
與瓊脂糖珠不同,磁珠是固體,抗體的結合限于磁珠的表面。磁珠 (直徑 1-4 μm) 明顯小于瓊脂糖珠 ,盡管磁珠沒有多孔中心增加結合能力,但每體積的磁珠數(shù)量比瓊脂糖珠多,使磁珠擁有足夠的抗體結合表面積滿足高容量的抗體結合。
簡而言之,瓊脂糖珠的結合能力較強,而磁珠在得率,可重復性以及自動化方面有明顯的優(yōu)勢。
蘇州anti DYKDDDDK免疫沉淀磁珠的選擇免疫沉淀技術RIP實驗步驟。
免疫沉淀技術(Immunoprecipitation, IP)的實驗設計通常包括以下幾個關鍵步驟:
1. 目標蛋白質的選擇:
2. 抗體的選擇:選擇特異性強、親和力高的抗體來捕獲目標蛋白質
3. 樣本的準備:收集和準備細胞或組織樣本。
4. 蛋白質的裂解和釋放:選擇合適的裂解條件,如pH值、離子強度、去污劑等。
5. 蛋白質濃度的測定:確定裂解液中蛋白質的濃度,以便于后續(xù)步驟的標準化。
6. 免疫沉淀的操作:將特異性抗體與裂解液混合,并在適宜的條件下孵育,以形成抗體-抗原復合物。
7. 非特異性結合的減少:通過預純化步驟去除可能的非特異性結合蛋白。
8. 洗滌:多次洗滌以去除未結合的蛋白質和雜質。
9. 目標蛋白質的洗脫:使用適當?shù)木彌_液洗脫抗體-抗原復合物。
10. 后續(xù)分析:對洗脫的蛋白質進行進一步分析,如Western Blot.
11. 對照實驗:設計適當?shù)恼龑φ蘸拓搶φ眨栽u估實驗的特異性和敏感性。
免疫沉淀技術(Immunoprecipitation, IP)的實驗方法通常包括以下步驟:
1. 樣本準備
2. 蛋白質濃度測定:使用BCA、Bradford或Lowry等方法測定裂解液中蛋白質的濃度。
3. 抗體預處理:如果使用預固定的抗體,需先將抗體固定在固相支持物上,如瓊脂糖珠或磁性微珠。
4. 免疫沉淀反應:將裂解液與特異性抗體(固定或未固定)混合,并在4°C下緩慢搖晃孵育過夜,以允許抗體與目標蛋白質充分結合。
5. 固相支持物的回收:對于未固定的抗體,加入與抗體特異性結合的蛋白A或蛋白G結合的固相支持物。
6. 洗滌:去除未結合的蛋白質和雜質,通常需要多次洗滌固相支持物。
7. 洗脫:使用適當?shù)南疵摼彌_液(如加熱的SDS加載緩沖液或酸性緩沖液)從固相支持物上洗脫免疫復合物。
8. 后續(xù)分析:對洗脫的蛋白質進行SDS-PAGE電泳、Western Blot、質譜分析等,以進一步分析目標蛋白質。
免疫沉淀技術ChIP的實驗設計。
免疫沉淀(IP)實驗中抗體的選擇非常關鍵,因為抗體的特異性和親和力直接影響到實驗的成功與否。
1. 特異性:抗體應當對目標蛋白具有高度的特異性,以避免與其他蛋白發(fā)生非特異性結合,導致假陽性結果。
2. 親和力:抗體對目標蛋白的親和力要足夠高,以確保在免疫沉淀過程中能夠有效地捕獲目標蛋白。
3. 抗體類型:單克隆抗體和多克隆抗體都可以用于IP實驗。單克隆抗體提供更高的特異性和批間一致性,而多克隆抗體可能提供更強的結合能力和更廣的表位覆蓋。
4. 應用驗證:選擇已經過免疫沉淀(IP)或相關應用(如Western blot, IHC)驗證的抗體,這增加了實驗成功的可能性。
5. 供應商信息:選擇信譽良好的抗體供應商,并查看供應商提供的技術數(shù)據(jù)和客戶評價,以幫助做出決策。
免疫沉淀技術的應用。南京anti DYKDDDDK免疫沉淀磁珠現(xiàn)貨
免疫沉淀和免疫共沉淀的區(qū)別?南京anti DYKDDDDK免疫沉淀磁珠現(xiàn)貨
免疫沉淀(Co-IP)實驗中抗體的選擇非常關鍵,因為抗體的特異性和親和力直接影響到實驗的成功與否。
1. 特異性:抗體應當對目標蛋白具有高度的特異性,以避免與其他蛋白發(fā)生非特異性結合,導致假陽性結果。
2. 親和力:抗體對目標蛋白的親和力要足夠高,以確保在免疫沉淀過程中能夠有效地捕獲目標蛋白。
3. 抗體類型:單克隆抗體和多克隆抗體都可以用于IP實驗。單克隆抗體提供更高的特異性和批間一致性,而多克隆抗體可能提供更強的結合能力和更廣的表位覆蓋。
4. 應用驗證:選擇已經過免疫沉淀(Co-IP)或相關應用(如Western blot, IHC)驗證的抗體,這增加了實驗成功的可能性。
5. 供應商信息:選擇信譽良好的抗體供應商,并查看供應商提供的技術數(shù)據(jù)和客戶評價,以幫助做出決策。
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