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杭州蛋白免疫沉淀磁珠原理

來源： 發(fā)布時間：2024-07-31

免疫沉淀是利用抗體特異性反應純化富集目的蛋白的一種方法?？贵w與細胞裂解液或表達上清中相應的蛋白結合后，再與蛋白A/G（ProteinA/G）或二抗偶聯(lián)的珠子（agarose或Sepharose）孵育，通過離心得到珠子-蛋白A/G或二抗-抗體-目的蛋白復合物，沉淀經(jīng)過洗滌后，重懸于電泳上樣緩沖液，煮沸5-10min，在高溫及還原劑的作用下，抗原與抗體解離，離心收集上清，上清中包括抗體、目的蛋白和少量的雜蛋白。免疫沉淀是一種生物學技術，它利用抗體的特異性結合特性來富集和分離混合物中的特定蛋白質。這種技術是研究蛋白質表達、蛋白質-蛋白質相互作用、蛋白質修飾和蛋白質功能的強大工具。免疫沉淀技術RIP的優(yōu)缺點是什么？杭州蛋白免疫沉淀磁珠原理

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免疫沉淀ChIP實驗中磁珠還是瓊脂糖珠的選擇取決于客戶實驗情況。
瓊脂糖珠海綿狀的結構  (直徑 50-150 μm)  可以結合抗體  (繼而結合靶蛋白) ，它能夠直接高效、快速結合抗體，而不需借助特殊的專業(yè)設備。瓊脂糖珠呈多孔結構，這使得它們擁有更大的表面積可與蛋白質相互接觸，具有更高的結合載量。
與瓊脂糖珠不同，磁珠是固體，抗體的結合限于磁珠的表面。磁珠 (直徑 1-4 μm) 明顯小于瓊脂糖珠 ，盡管磁珠沒有多孔中心增加結合能力，但每體積的磁珠數(shù)量比瓊脂糖珠多，使磁珠擁有足夠的抗體結合表面積滿足高容量的抗體結合。
簡而言之，瓊脂糖珠的結合能力較強，而磁珠在得率，可重復性以及自動化方面有明顯的優(yōu)勢。
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Co-IP（免疫共沉淀）技術主要用于研究蛋白質之間的相互作用，其應用場景如下：
1. 蛋白質相互作用網(wǎng)絡的鑒定：Co-IP可用于構建蛋白質相互作用網(wǎng)絡，發(fā)現(xiàn)目標蛋白的結合伙伴。
2. 信號傳導途徑的研究：通過Co-IP技術，科學家們發(fā)現(xiàn)了許多關鍵的細胞信號通路，如MAPK和PI3K/Akt通路等，為深入理解這些通路的功能和調控機制提供了重要線索。
3. 藥物靶點篩選：利用Co-IP技術，研究人員可以篩選潛在的藥物靶點。
疾病機制研究：通過分析疾病相關蛋白質的相互作用，Co-IP有助于揭示疾病的分子機制。
4. 抗體藥物開發(fā)：Co-IP可用于研究抗體藥物與其靶標蛋白的結合特性，評估抗體藥物的親和力和特異性。
5. 轉錄因子研究：Co-IP技術可以用于研究轉錄因子與蛋白質的相互作用，進而揭示基因調控網(wǎng)絡。

RNA免疫沉淀技術（RIP）是一種研究RNA與蛋白質相互作用的重要方法，其應用領域主要包括：
1. 轉錄后調控研究：RIP技術可以幫助研究者了解RNA在轉錄后水平如何被調控。
2. 表觀遺傳調控：RIP技術用于研究RNA結合蛋白（RBPs）在表觀遺傳調控中的作用。
3. 非編碼RNA功能研究：RIP技術可以用來研究長非編碼RNA（lncRNA）、miRNA和其他小RNA的種類，以及它們?nèi)绾闻c蛋白質相互作用來調控基因表達。
4. RNA病毒研究：RIP技術也可用于研究RNA病毒與其宿主細胞內(nèi)蛋白質的相互作用，進而了解病毒復制和致病機制。
5. RNA修飾和甲基化研究：RIP技術結合其他技術如m5C-RIP-seq，可用于研究RNA甲基化修飾及其在病理過程中的作用。
6. RNA定位和穩(wěn)定性：通過RIP技術，研究者可以探索特定RNA在細胞內(nèi)的定位以及它們?nèi)绾伪环€(wěn)定或降解。
7. RNA-蛋白質復合物的鑒定：RIP技術可以用來鑒定與特定RNA結合的蛋白質，從而揭示RNA-蛋白質復合物的組成。
8. 疾病相關RNA研究：RIP技術在疾病相關RNA的研究中也有應用。
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免疫沉淀純化所得抗原純度低一般有多種原因：
1. 非特異性蛋白污染
如果洗脫所得抗原純度較低，則有幾種方法可以進行優(yōu)化。在結合或洗滌緩沖液中加入去污劑或其他可以降低非特異性結合的組分。使用普通微珠預純化樣本還可以降低非目標分子的共純化。此外，還可以使用無關蛋白 (如BSA) 封閉微珠 。
2. 抗體污染
使用蛋白A、G或A/G的經(jīng)典免疫沉淀實驗中會出現(xiàn)抗體與抗原共洗脫的情況。如果共洗脫會影響下游分析，則需要使用抗體通過共價連接固定至微珠的方法進行實驗，如Pierce 直接 IP 或交聯(lián) IP 的形式。
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免疫沉淀技術RIP的實驗方法。杭州蛋白免疫沉淀磁珠原理

免疫沉淀RIP實驗中磁珠還是瓊脂糖珠的選擇取決于客戶實驗情況。
瓊脂糖珠海綿狀的結構  (直徑 50-150 μm)  可以結合抗體  (繼而結合靶蛋白) ，它能夠直接高效、快速結合抗體，而不需借助特殊的專業(yè)設備。瓊脂糖珠呈多孔結構，這使得它們擁有更大的表面積可與蛋白質相互接觸，具有更高的結合載量。
與瓊脂糖珠不同，磁珠是固體，抗體的結合限于磁珠的表面。磁珠 (直徑 1-4 μm) 明顯小于瓊脂糖珠 ，盡管磁珠沒有多孔中心增加結合能力，但每體積的磁珠數(shù)量比瓊脂糖珠多，使磁珠擁有足夠的抗體結合表面積滿足高容量的抗體結合。
簡而言之，瓊脂糖珠的結合能力較強，而磁珠在得率，可重復性以及自動化方面有明顯的優(yōu)勢。
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