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嘉興基因療法脫靶檢測(cè)

來(lái)源: 發(fā)布時(shí)間:2024-04-15

CRISPR基因編輯zhiliao發(fā)展如火如荼,但也有不少人對(duì)基因zhiliao的安全性提出擔(dān)憂,由于CRISPR技術(shù)是直接改變基因組DNA,其中任何的改變都會(huì)被長(zhǎng)久保留下來(lái),所以CRISPR對(duì)于DNA序列的任何改變都需要嚴(yán)謹(jǐn)?shù)陌踩u(píng)估。根據(jù)目前已經(jīng)公開(kāi)的FDA關(guān)于基因zhiliao的指導(dǎo)文件,對(duì)于基因zhiliao安全性的評(píng)估可以簡(jiǎn)單總結(jié)為兩個(gè)方面:由于目前大部分CRISPR基因編輯zhiliao方案是基于CRISPR引起的DNA雙鏈斷裂和隨機(jī)突變進(jìn)行基因敲除,所以一類風(fēng)險(xiǎn)主要是指靶位點(diǎn)的隨機(jī)突變引發(fā)的安全風(fēng)險(xiǎn),如果出現(xiàn)大片段丟失、染色體重排等異常變化,都存在巨大的安全隱患。脫靶檢測(cè)方法,推薦唯可生物,實(shí)驗(yàn)實(shí)力強(qiáng),專業(yè)性高,檢測(cè)效率高,結(jié)果準(zhǔn)確率高。嘉興基因療法脫靶檢測(cè)

嘉興基因療法脫靶檢測(cè),脫靶檢測(cè)

插入突變風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估一些整合性載體(如逆轉(zhuǎn)錄病毒、慢病毒、轉(zhuǎn)座子)可將外源基因插入整合到細(xì)胞基因組中,這可能會(huì)導(dǎo)致關(guān)鍵基因突變或jihuo原基因,從而導(dǎo)致惡性liu風(fēng)險(xiǎn)增加。影響插入突變的關(guān)鍵風(fēng)險(xiǎn)因素包括:(1)載體的整合特征,如插入位點(diǎn)的偏好性;(2)載體的設(shè)計(jì),如增強(qiáng)子、啟動(dòng)子等構(gòu)建元件的活性,影響鄰近基因的潛力;產(chǎn)生剪接突變體的潛在剪接位點(diǎn)或多聚腺苷酸信號(hào)等;(3)細(xì)胞載體拷貝數(shù);4)轉(zhuǎn)基因表達(dá)產(chǎn)物的功能活性(如與細(xì)胞生長(zhǎng)調(diào)控相關(guān))和表達(dá)水平;5)靶細(xì)胞群的轉(zhuǎn)化可能性,這可能與細(xì)胞的分化狀態(tài)、增殖潛力、體外培養(yǎng)條件和體內(nèi)植入環(huán)境等有關(guān)。武漢高精度脫靶檢測(cè)分析挑選前面的潛在脫靶位點(diǎn),通過(guò)PCR測(cè)序驗(yàn)證是否脫靶。

嘉興基因療法脫靶檢測(cè),脫靶檢測(cè)

基于已有科學(xué)經(jīng)驗(yàn)和既往非臨床/臨床研究結(jié)果,如果認(rèn)為基因修飾細(xì)胞所采用的載體系統(tǒng)可將外源基因整合到細(xì)胞基因組中并可在體內(nèi)長(zhǎng)期存續(xù),需綜合分析以上風(fēng)險(xiǎn)因素,評(píng)估潛在的插入突變、致瘤/致性風(fēng)險(xiǎn)。非臨床研究,應(yīng)采用具有代表性的基因轉(zhuǎn)導(dǎo)細(xì)胞進(jìn)行基因整合位點(diǎn)分析,分析細(xì)胞的克隆組成以及在關(guān)注基因(如liu相關(guān)調(diào)控基因)附近有無(wú)優(yōu)先整合跡象,含有關(guān)注整合位點(diǎn)的細(xì)胞有無(wú)優(yōu)先異常增殖。對(duì)于嵌合抗原受體(Chimericantigenreceptor,CAR)或T細(xì)胞受體(Tcellreceptor,TCR)修飾的免疫細(xì)胞,應(yīng)盡可能采用多種方法評(píng)估其靶點(diǎn)相關(guān)毒性和脫靶毒性風(fēng)險(xiǎn)。

堿基編輯器:CBE:胞嘧啶堿基編輯器(Cytosine base editor,CBE),依賴于胞嘧啶核苷脫氨基酶,通過(guò)將胞嘧啶核苷脫氨轉(zhuǎn)換為尿嘧啶核苷,尿嘧啶核苷在DNA復(fù)制和修復(fù)過(guò)程中會(huì)轉(zhuǎn)換為胸腺嘧啶核苷,從而實(shí)現(xiàn)C到T的轉(zhuǎn)換。已開(kāi)發(fā)出四代CBE(BE1、BE2、BE3和BE4),由于BE3引起的脫靶效應(yīng)相對(duì)較少,因此它已在動(dòng)物(小鼠)、細(xì)菌和植物細(xì)胞中廣用于編輯細(xì)胞的基因組成。腺嘌呤堿基編輯器(Adenine base editor,ABE),依賴于腺嘌呤核苷脫氨基酶,通過(guò)將腺嘌呤核苷脫氨轉(zhuǎn)換為次黃苷,然后在DNA復(fù)制和修復(fù)過(guò)程中會(huì)轉(zhuǎn)換為鳥(niǎo)嘌呤核苷,從而實(shí)現(xiàn)腺嘌呤(A)到鳥(niǎo)嘌呤(G)的轉(zhuǎn)換。新開(kāi)發(fā)的堿基編輯器ABE8e,比ABE7.10增加了590倍的靶向活性。脫靶檢測(cè)技術(shù)是一系列針對(duì)CRISPR/Cas9系統(tǒng)作用機(jī)制研發(fā)的用于確定CRISPR/Cas9系統(tǒng)基因編輯準(zhǔn)確性檢測(cè)工具。

嘉興基因療法脫靶檢測(cè),脫靶檢測(cè)

目前鼓潤(rùn)已掌握了該項(xiàng)技術(shù),簡(jiǎn)述如下:1、CRISPR與dsODNtag整合的實(shí)驗(yàn)技術(shù)及高通量測(cè)序建庫(kù)流程將靶向于目標(biāo)基因組位點(diǎn)的CRISPR質(zhì)粒與dsODNtag以核電轉(zhuǎn)的方式同時(shí)轉(zhuǎn)染入真核細(xì)胞,CRISPR造成基因組雙鏈斷裂后,dsODNtag將整合入斷點(diǎn)處,作為后續(xù)分析在靶與脫靶情況的標(biāo)記。轉(zhuǎn)染后3天收集細(xì)胞的DNA進(jìn)行高通量建庫(kù)。2、GUIDE-seq生信分析方法1)搭建了高通量測(cè)序的數(shù)據(jù)分析流程。2)利用該技術(shù)分析了CRISPR靶向編輯某細(xì)胞系基因的在靶與脫靶情況。其中一例樣品的分析結(jié)果如圖4所示:Sequencesofoff-targetsitesidentifiedbyGUIDE-seq.Theintendedtargetsequenceisshowninthetoplinewithcleavedsitesshownunderneathandwithmismatchestotheon-targetsiteshownandhighlightedincolor.GUIDE-seqsequencingreadcountsareshowntotherightofeachsite.3)利用PCR擴(kuò)增技術(shù)聯(lián)合Sanger測(cè)序鑒定了分析出的脫靶位點(diǎn)。種子脫靶檢測(cè),推薦唯可生物,實(shí)驗(yàn)實(shí)力強(qiáng),專業(yè)性高,檢測(cè)效率高,結(jié)果準(zhǔn)確率高。武漢高精度脫靶檢測(cè)分析

基因編輯脫靶將無(wú)處隱藏。嘉興基因療法脫靶檢測(cè)

臨床研究人群,如果一種基因zhiliao產(chǎn)品具有引起遲發(fā)性不良反應(yīng)的風(fēng)險(xiǎn),需要開(kāi)展長(zhǎng)期隨訪觀察時(shí),所有接受基因zhiliao產(chǎn)品的受試者在簽署知情同意書后均應(yīng)入組長(zhǎng)期隨訪臨床研究。在設(shè)計(jì)長(zhǎng)期隨訪臨床研究的方案時(shí),應(yīng)考慮目標(biāo)受試者人群及特征、整體健康情況以及接受zhiliao的患者的預(yù)期生存期等特征對(duì)遲發(fā)性不良反應(yīng)的收集的影響。通常來(lái)說(shuō),當(dāng)臨床研究人群的某些特征(如預(yù)期壽命短、多重合并癥、以及暴露于放療或化療等其他藥物)可能干擾遲發(fā)性不良反應(yīng)的觀察分析時(shí),會(huì)影響長(zhǎng)期隨訪觀察在評(píng)估和減輕受試者風(fēng)險(xiǎn)方面的效用;而在病情較輕或較局限,合并癥以及伴隨zhiliao有限或較穩(wěn)定的受試者中,通過(guò)長(zhǎng)期隨訪觀察收集到的評(píng)估數(shù)據(jù)可能更容易分析。嘉興基因療法脫靶檢測(cè)

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