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不論在科研還是臨床中,CRISPR技術(shù)的使用都帶來了非常高的回報(bào),也同時(shí)伴隨著各種風(fēng)險(xiǎn),這其中脫靶現(xiàn)象就研究者們較為擔(dān)心的一類風(fēng)險(xiǎn)。本文中我們盤點(diǎn)了多種主流的CRISPR脫靶位點(diǎn)檢測方法,但沒有一種方法是適用于所有CRISPR技術(shù)的脫靶檢測,一個(gè)項(xiàng)目中只使用一種脫靶檢測方法也是不足夠的。如何在實(shí)驗(yàn)中,特別是臨床試驗(yàn)中多方面評(píng)估CRISPR的脫靶風(fēng)險(xiǎn),需要將多種脫靶檢測方法有效組合。同時(shí),每一條sgRNA都不可避免地存在脫靶位點(diǎn),如何評(píng)估這種風(fēng)險(xiǎn),如何降低這種風(fēng)險(xiǎn),具體的解決方案我們用臨床實(shí)例來為大家介紹。選擇潛在的脫靶位點(diǎn),例如選擇gRNA預(yù)測網(wǎng)站上Top 5潛在脫靶位點(diǎn),進(jìn)行Sanger測序單克?。唤K高精度脫靶檢測企業(yè)
GUIDE-Seq脫靶評(píng)估技術(shù)的優(yōu)勢分析鼓潤致力于基因組編輯工具脫靶的分析檢測工作,為篩選、優(yōu)化基因組編輯工具的保真性提供標(biāo)準(zhǔn)化的分析。我們脫靶分析具有如下優(yōu)勢:實(shí)用性強(qiáng):能反映CRISPR在真核細(xì)胞中進(jìn)行基因編輯的在靶與脫靶情況,以進(jìn)行安全性和有效性評(píng)價(jià);檢測通量高:一次能檢測多個(gè)樣本的在靶與脫靶情況,并通過優(yōu)化的標(biāo)簽設(shè)計(jì),降低實(shí)際的測序reads數(shù)量;準(zhǔn)確性高:絕大部分檢測結(jié)果可被驗(yàn)證;靈敏度高:能夠高效檢測出低頻脫靶位點(diǎn),檢測低至0.1%的脫靶突變;實(shí)驗(yàn)難度低:操作過程簡單易行細(xì)胞適應(yīng)性強(qiáng)。浙江基因療法脫靶檢測服務(wù)根據(jù)選擇的sgRNA,通過生物信息學(xué)方法,對(duì)sgRNA進(jìn)行脫靶分析。
CRISPR基因編輯zhiliao發(fā)展如火如荼,但也有不少人對(duì)基因zhiliao的安全性提出擔(dān)憂,由于CRISPR技術(shù)是直接改變基因組DNA,其中任何的改變都會(huì)被長久保留下來,所以CRISPR對(duì)于DNA序列的任何改變都需要嚴(yán)謹(jǐn)?shù)陌踩u(píng)估。根據(jù)目前已經(jīng)公開的FDA關(guān)于基因zhiliao的指導(dǎo)文件,對(duì)于基因zhiliao安全性的評(píng)估可以簡單總結(jié)為兩個(gè)方面:由于目前大部分CRISPR基因編輯zhiliao方案是基于CRISPR引起的DNA雙鏈斷裂和隨機(jī)突變進(jìn)行基因敲除,所以一類風(fēng)險(xiǎn)主要是指靶位點(diǎn)的隨機(jī)突變引發(fā)的安全風(fēng)險(xiǎn),如果出現(xiàn)大片段丟失、染色體重排等異常變化,都存在巨大的安全隱患。
對(duì)于基因修飾細(xì)胞zhiliao產(chǎn)品,充分的非臨床研究是為了:(1)闡明基因修飾的目的、功能以及產(chǎn)品的作用機(jī)制,明確其在擬定患者人群中使用的生物學(xué)合理性;(2)為臨床試驗(yàn)的給藥途徑、給藥程序、給藥劑量的選擇提供支持性依據(jù);(3)根據(jù)潛在風(fēng)險(xiǎn)因素,闡明毒性反應(yīng)特征,預(yù)測人體可能出現(xiàn)的不良反應(yīng),確定不良反應(yīng)的臨床監(jiān)測指標(biāo),為制定臨床風(fēng)險(xiǎn)控制措施提供參考依據(jù)。因此,應(yīng)充分開展非臨床研究,收集用于風(fēng)險(xiǎn)獲益評(píng)估的信息,以確立擬開發(fā)產(chǎn)品在目標(biāo)患者人群中預(yù)期具有合理的、可接受的獲益風(fēng)險(xiǎn)比,同時(shí)為臨床試驗(yàn)的設(shè)計(jì)和風(fēng)險(xiǎn)控制策略的制定提供支持性依據(jù)。如何檢測是否發(fā)生脫靶?
使用CRISPR/Cas9、ZFNs和TALENs等設(shè)計(jì)核酸酶進(jìn)行基因組編輯,可以將遺傳物質(zhì)定向?qū)氩溉閯?dòng)物基因組的特定位點(diǎn)。然而,可能會(huì)出現(xiàn)非預(yù)期的靶上和靶外基因組修飾,這可能導(dǎo)致基因組不穩(wěn)定,并破壞正常基因的功能,從而可能導(dǎo)致臨床前和臨床研究中的安全問題?;蚓庉嬆壳暗拿摪蟹治黾夹g(shù)主要依賴于生物信息學(xué)預(yù)測和全基因組脫靶檢測技術(shù)。這些預(yù)測缺乏可靠性,因?yàn)樗鼈冎缓w了潛在基因組改變的一小部分。而頻率低于0.5%的脫靶突變大多無法被全基因組脫靶檢測技術(shù)檢測到。我們是開發(fā)用于全基因組靶向/非靶向分析的無偏分析的先驅(qū)。靶向基因組編輯唯可生物為基因編輯安全性評(píng)估提供多方面的PCR和基于NGS的分析。我們的多功能且經(jīng)濟(jì)高效的檢測方法可檢測靶向和非靶向基因組改變。我們先進(jìn)的分析技術(shù)與強(qiáng)大的內(nèi)部生物信息學(xué)體系相結(jié)合,可靠地量化了預(yù)期的靶向整合與非預(yù)期結(jié)果(如易位和INDEL)之間的比率。高深度全基因組重測序服務(wù),該方法能多方位精細(xì)地對(duì)基因編輯的細(xì)胞或個(gè)體進(jìn)行off-target檢測。南通高精度脫靶檢測技術(shù)
脫靶檢測政策,推薦唯可生物,實(shí)驗(yàn)實(shí)力強(qiáng),專業(yè)性高,檢測效率高,結(jié)果準(zhǔn)確率高。江蘇高精度脫靶檢測企業(yè)
基因zhiliao產(chǎn)品特有的可能會(huì)引起遲發(fā)性不良反應(yīng)的風(fēng)險(xiǎn)因素包括:基因組整合活性基因zhiliao產(chǎn)品可能會(huì)采用修飾宿主基因組的技術(shù),并有可能在宿主細(xì)胞或組織中持續(xù)存在。很多基因zhiliao載體的基因整合不會(huì)指向基因組的特定位點(diǎn),可能在整合位點(diǎn)處產(chǎn)生插入突變、或jihuo整合位點(diǎn)附近的原基因等,進(jìn)而破壞重要基因功能或增加惡性liu的風(fēng)險(xiǎn),例如,國外已有多項(xiàng)研究報(bào)告在接受了使用γ-逆轉(zhuǎn)錄病毒載體轉(zhuǎn)導(dǎo)的基因修飾細(xì)胞zhiliao的受試者中發(fā)生白血病。因此,對(duì)于存在此類風(fēng)險(xiǎn)的產(chǎn)品,有必要進(jìn)行長期隨訪臨床研究以評(píng)估出現(xiàn)遲發(fā)不良反應(yīng)的風(fēng)險(xiǎn)。江蘇高精度脫靶檢測企業(yè)
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