誘導多能干細胞來源的細胞產(chǎn)品。誘導多能干細胞（inducedpluripotentstemcell，iPS）自身具有致瘤性風險，在體內(nèi)可形成畸胎瘤，整合病毒載體的使用和誘導多能性可能增加iPS細胞插入致突變性和致性的風險。因此，應在shou次臨床試驗前完成致瘤性試驗。若設計科學合理，能夠滿足評價要求，也可在持續(xù)時間足夠長的毒性研究中評估致瘤性風險。體內(nèi)致瘤性試驗建議采用摻入未分化iPS細胞的細胞產(chǎn)品作為陽性對照，以確認實驗系統(tǒng)的靈敏度。如果iPS細胞設計了機制以降低致瘤風險，應在體內(nèi)試驗中確認/驗證此類機制的功能 高深度全基因組重測序服務,該方法能多方位精細地對基因編輯的細胞或個體進行off-target檢測。南京種子基因脫靶檢測評估

gRNA的長度和錯配： 17個核苷酸長度的gRNA顯示出更高的基因組編輯效率。相比之下，18-20 bp的長度顯示出較低的基因組編輯效率。在人類細胞中減少潛在脫靶效應的指導方針：1) 應避免在PAM的7-10 bp范圍內(nèi)靶序列有超過3個錯配；2) 在PAM的12 bp內(nèi)，應避免sgRNA 凸起以減少脫靶效應。gRNA的化學修飾：在gRNA核糖磷酸骨架中加入2?-O-甲基-3?-膦?；宜狨е挛稽c特異性修飾，使脫靶切割減少40-120倍，同時保持靶向性能。gRNA上游5'發(fā)夾結(jié)構(gòu)的修飾可以提高Cas9和Cas12的特異性，降低脫靶效應。深圳高精度脫靶檢測分析脫靶檢測在揭示CRISPR/Cas9系統(tǒng)的脫靶機制以及進一步提高系統(tǒng)靶向性的研究中具有重要作用。

R-loop seq雖然不是一種真正意義上的脫靶位點檢測方法，但能為堿基編輯脫氨酶的脫靶提供一種度量方法，以便于之后的脫氨酶點突變優(yōu)化，來降低脫靶的發(fā)生幾率。2) Detect-seqCRISPR衍生技術(shù)由于其復雜性，檢測其脫靶位點的hexin思路是捕獲實驗過程中的關(guān)鍵中間產(chǎn)物或者終產(chǎn)物。這種設計思路下，目前較為成功的是檢測堿基編輯CBE脫靶位點的Detect-seq[13]。CBE的原理是將dC脫氨變?yōu)閐U，迫使其對側(cè)的dG變?yōu)閐A，較終將堿基對從C-G轉(zhuǎn)變?yōu)門-A。Detect-seq便是針對中間態(tài)的dU，使用Uracil DNA Glycosylase (UDG)，去除U堿基后，替換為帶Biotin的U堿基，捕獲堿基編輯的脫靶位點，并且sgRNA依賴和sgRNA不依賴的脫靶位點都能找到。該方法類似檢測DNA甲基化的重亞硫酸鹽測序法，通過處理特定的堿基，可以捕獲全基因組上的CBE脫靶位點。

堿基編輯器：CBE：胞嘧啶堿基編輯器(Cytosine base editor，CBE)，依賴于胞嘧啶核苷脫氨基酶，通過將胞嘧啶核苷脫氨轉(zhuǎn)換為尿嘧啶核苷，尿嘧啶核苷在DNA復制和修復過程中會轉(zhuǎn)換為胸腺嘧啶核苷，從而實現(xiàn)C到T的轉(zhuǎn)換。已開發(fā)出四代CBE（BE1、BE2、BE3和BE4），由于BE3引起的脫靶效應相對較少，因此它已在動物（小鼠）、細菌和植物細胞中廣用于編輯細胞的基因組成。腺嘌呤堿基編輯器(Adenine base editor，ABE)，依賴于腺嘌呤核苷脫氨基酶，通過將腺嘌呤核苷脫氨轉(zhuǎn)換為次黃苷，然后在DNA復制和修復過程中會轉(zhuǎn)換為鳥嘌呤核苷，從而實現(xiàn)腺嘌呤(A)到鳥嘌呤(G)的轉(zhuǎn)換。新開發(fā)的堿基編輯器ABE8e，比ABE7.10增加了590倍的靶向活性。針對已經(jīng)獲得的有切割能力的sgRNA，需要進一步明確其體內(nèi)脫靶效應。

目前鼓潤已掌握了該項技術(shù)，簡述如下：1、CRISPR與dsODNtag整合的實驗技術(shù)及高通量測序建庫流程將靶向于目標基因組位點的CRISPR質(zhì)粒與dsODNtag以核電轉(zhuǎn)的方式同時轉(zhuǎn)染入真核細胞，CRISPR造成基因組雙鏈斷裂后，dsODNtag將整合入斷點處，作為后續(xù)分析在靶與脫靶情況的標記。轉(zhuǎn)染后3天收集細胞的DNA進行高通量建庫。2、GUIDE-seq生信分析方法1）搭建了高通量測序的數(shù)據(jù)分析流程。2）利用該技術(shù)分析了CRISPR靶向編輯某細胞系基因的在靶與脫靶情況。其中一例樣品的分析結(jié)果如圖4所示：Sequencesofoff-targetsitesidentifiedbyGUIDE-seq.Theintendedtargetsequenceisshowninthetoplinewithcleavedsitesshownunderneathandwithmismatchestotheon-targetsiteshownandhighlightedincolor.GUIDE-seqsequencingreadcountsareshowntotherightofeachsite.3）利用PCR擴增技術(shù)聯(lián)合Sanger測序鑒定了分析出的脫靶位點。脫靶檢測政策，推薦唯可生物，實驗實力強，專業(yè)性高，檢測效率高，結(jié)果準確率高。無錫基因編輯脫靶檢測報告

脫靶(off-target)效應是指MicroRNA Agomir/Antagomir可以與特異性互補的核苷酸序列結(jié)合。南京種子基因脫靶檢測評估

采用基因編輯技術(shù)制備的細胞產(chǎn)品。對于采用基因編輯技術(shù)制備的基因修飾細胞產(chǎn)品，應進行體外在靶和脫靶活性評估，以確認修飾酶或向?qū)NA對靶基因序列的特異性。在評估基因編輯的脫靶風險時，應說明所選擇的評價策略的合理性和敏感性。雖然采用計算機分析預測基因編輯的潛在脫靶位點，并對潛在脫靶位點進行深度測序分析，可用于評估基因編輯的脫靶風險；但選擇的評價策略仍應包含體外全基因組測序比對，以證明潛在脫靶位點未出現(xiàn)脫靶。此外，在評估脫靶活性時，還應評估種屬特異性的差異、細胞病理生理狀態(tài)的差異或細胞類型的差異對非臨床數(shù)據(jù)預測性的影響。必要時，還應分析基因編輯對細胞表型和生理功能的潛在影響。南京種子基因脫靶檢測評估