細胞外檢測方法：細胞外檢測方法較為直接，將基因組提純后進行CRISPR體外切割實驗，再捕獲發(fā)生脫靶切割的位點即可。1) Digenome-seqDigenome-seq是較早提出的一類細胞外脫靶位點檢測方法，提純的基因組DNA被Cas9/sgRNA切割后，再經(jīng)過標準的全基因組測序流程獲得測序數(shù)據(jù)，之后需要較為復雜的生物信息學分析才能夠獲得CRISPR切割位點的信息?？傮w來講，這種方法測序成本較高，并且檢測靈敏度也有限。2)SITE-seq為了有效檢測到低頻脫靶位點，一般需要在建庫時定向捕獲CRISPR切割位點。SITE-seq就是這樣一種測序方法，提純的基因組DNA經(jīng)過Cas9/sgRNA切割后，在切割位點末端連接帶Biotin的接頭；再隨機打斷基因組，在另一端連接第二個接頭；經(jīng)過鏈霉親和素磁珠純化，只有一輪被Cas9切割的DNA才能夠被純化并測序，實現(xiàn)了CRISPR切割位點的富集。該方法雖然提高了脫靶位點的檢測靈敏度，但有著較高的實驗要求，每次需要投入大量的基因組DNA，并且無法區(qū)分提純基因組DNA時發(fā)生的隨機斷裂和Cas9的切割，導致產出較為明顯的背景信號。同時，由于一輪Biotin接頭只會接在Cas9切割位點的一側，導致測序結果里只能看到脫靶位點一側的序列?？梢耘c靶基因之外的其他基因作用而非特異性阻斷基因表達,即產生非靶基因的沉默效應。浙江育種脫靶檢測方法

使用CRISPR/Cas9、ZFNs和TALENs等設計核酸酶進行基因組編輯，可以將遺傳物質定向導入哺乳動物基因組的特定位點。然而，可能會出現(xiàn)非預期的靶上和靶外基因組修飾，這可能導致基因組不穩(wěn)定，并破壞正?；虻墓δ?，從而可能導致臨床前和臨床研究中的安全問題?；蚓庉嬆壳暗拿摪蟹治黾夹g主要依賴于生物信息學預測和全基因組脫靶檢測技術。這些預測缺乏可靠性，因為它們只涵蓋了潛在基因組改變的一小部分。而頻率低于0.5%的脫靶突變大多無法被全基因組脫靶檢測技術檢測到。我們是開發(fā)用于全基因組靶向/非靶向分析的無偏分析的先驅。靶向基因組編輯唯可生物為基因編輯安全性評估提供多方面的PCR和基于NGS的分析。我們的多功能且經(jīng)濟高效的檢測方法可檢測靶向和非靶向基因組改變。我們先進的分析技術與強大的內部生物信息學體系相結合，可靠地量化了預期的靶向整合與非預期結果(如易位和INDEL)之間的比率。上海crispr/cas9脫靶檢測方法脫靶檢測評估標準，推薦唯可生物，實驗實力強，專業(yè)性高，檢測效率高，結果準確率高。

對于基因修飾細胞zhiliao產品，充分的非臨床研究是為了：（1）闡明基因修飾的目的、功能以及產品的作用機制，明確其在擬定患者人群中使用的生物學合理性；（2）為臨床試驗的給藥途徑、給藥程序、給藥劑量的選擇提供支持性依據(jù)；（3）根據(jù)潛在風險因素，闡明毒性反應特征，預測人體可能出現(xiàn)的不良反應，確定不良反應的臨床監(jiān)測指標，為制定臨床風險控制措施提供參考依據(jù)。因此，應充分開展非臨床研究，收集用于風險獲益評估的信息，以確立擬開發(fā)產品在目標患者人群中預期具有合理的、可接受的獲益風險比，同時為臨床試驗的設計和風險控制策略的制定提供支持性依據(jù)。

CIRCLE-seq和CHANGE-seq與SITE-seq同期發(fā)表的CIRCLE-seq一定程度上解決了SITE-seq的一些問題。CIRCLE-seq的第一步是將純化后的基因組DNA隨機打斷成300bp左右的片段，然后首尾相連成環(huán)狀DNA，這種方法很好地避免了DNA隨機斷裂造成的背景噪聲。實驗的第二步是用Cas9切割環(huán)狀DNA，再連上接頭并進行雙端測序，這樣就可以在一次測序中同時獲取切割位點的兩側序列，彌補了SITE-seq的另一個缺點。CIRCLE-seq從總體上來說要優(yōu)于SITE-seq，但是將基因組DNA隨機打斷后成環(huán)的效率并不高，所以同一作者在3年后發(fā)表了CHANGE-seq，用Tn5一步法打斷基因組并加接頭，提高了成環(huán)效率，降低了起始基因組DNA的用量。脫靶檢測安評，推薦唯可生物，實驗實力強，專業(yè)性高，檢測效率高，結果準確率高。

BLESS：利用生物素標簽對DSBs進行原位標記，后經(jīng)PCR擴增實現(xiàn)對于生物素標記片段的富集，并通過二代測序實現(xiàn)脫靶位點檢測。直接檢測細胞中的切割位點，靈敏度與細胞、組織密切相關。LAM-HTGTS，片段化的gDNA經(jīng)過LAM-PCR引入接頭，然后進行全基因組易位測序。高通量的全基因組范圍檢測，可準確檢測DSBs引發(fā)的重排。GUIDE-Seq，將dsODN    s標簽整合到DSBs位點，通過二代測序檢測這些標簽所在的基因組區(qū)域，從而確定脫靶突變的位置。廣使用的細胞內檢測方法。能檢測低頻脫靶突變。Digenome-Seq，片段化的gDNA與CRISPR/RNP混合孵育，進行全基因組測序檢測脫靶。全基因組測序，直接檢測切割位點，能檢測低頻脫靶突變。種子脫靶檢測，推薦唯可生物，實驗實力強，專業(yè)性高，檢測效率高，結果準確率高。浙江育種脫靶檢測方法

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脫靶來自于這些技術所攜帶的功能基團，如堿基編輯的脫氨酶和先導編輯的逆轉錄酶，不依賴sgRNA結合基因組DNA的情況下產生的脫靶。為檢測第二類脫靶現(xiàn)象，研究者需要針對每種技術設計專門的檢測方法。1) R-loop seq在堿基編輯開發(fā)早期，雖然靶位點的編輯效率很高，但研究者也很快發(fā)現(xiàn)脫氨酶會在游離的時候隨機修飾暴露的DNA單鏈，導致大量的脫靶位點。為降低這類脫靶現(xiàn)象的發(fā)生，研究者設計了R-loop seq，以dSaCas9結合DNA形成R-loop，暴露出DNA單鏈，為堿基編輯的脫氨酶提供一個固定的脫靶位點，然后以該位點的編輯效率反映堿基編輯脫氨酶的脫靶程度。浙江育種脫靶檢測方法