拷貝數(shù),是指某基因(可以是質粒)在某一生物的基因組中的個數(shù)。單拷貝就是該基因在該生物基因組中只有一個,多拷貝則指有多個。在細菌細胞中,根據(jù)復制特性,質粒分嚴緊型和松弛型兩類,前者在細胞中只含1?2個,而后者含10?15個以上。恒定的拷貝數(shù)與質粒復制控制系統(tǒng)、宿主細胞遺傳背景及生長條件有關??截悢?shù)變異(Copynumbervariation,CNV)是由基因組發(fā)生重排而導致的,一般指長度為1kb以上的基因組大片段的拷貝數(shù)增加或者減少,主要表現(xiàn)為亞顯微水平的缺失和重復。用于檢測慢病毒載體拷貝數(shù)的方法及其應用。蘇州細胞療法載體拷貝數(shù)檢測
一般情況下重組載體基因較少整合到基因組中,但近年來已發(fā)現(xiàn)載體基因整合到特定基因座中導致的可能性。建議設計時充分考慮重組載體的安全性,關注目的基因的啟動子選擇、給藥劑量、整合區(qū)域等多種相關因素。建議對病毒載體進行全基因組測序。另外,也可將病毒載體轉導目標細胞后,對整合有載體序列的細胞基因組進行測序,說明載體骨架及目的基因序列的準確性。對于整合型載體還應考慮插入突變的風險,應對插入位點進行分析并說明對細胞存在的潛在的安全性影響,并對分析方法的合理性進行說明。嘉興CAR-T載體拷貝數(shù)分析腺相關病毒的基因組為單鏈 DNA,外源 DNA 拷貝數(shù)病毒基因組拷貝數(shù)。
為促進及早發(fā)現(xiàn)此類風險并提供有效地風險控制措施,本指導原則在借鑒ICHE2E藥物警戒計劃、《藥物警戒質量管理規(guī)范》和國內外風險管理計劃相關指導原則的基礎上,列舉了CAR-T細胞zhiliao產(chǎn)品可能存在的安全性風險,以及常規(guī)和本類產(chǎn)品特異的額外藥物警戒活動和風險較小化措施。CAR-T細胞zhiliao產(chǎn)品的風險識別應盡早開始,并在整個研發(fā)過程中持續(xù)進行,以在可能的情況下預防、較小化風險。隨著對風險認知的變化,應及時更新風險管理計劃。本指導原則包括CAR-T細胞zhiliao產(chǎn)品申報上市臨床風險管理計劃的結構和內容,重點就撰寫CAR-T細胞zhiliao產(chǎn)品風險管理計劃時的特殊考慮進行描述,CAR-T細胞zhiliao產(chǎn)品申報上市臨床風險管理計劃還應參考ICHE2E、《藥物警戒質量管理規(guī)范》以及我國藥品監(jiān)管機構發(fā)布的有關技術指導原則。隨著技術的發(fā)展和相關研究數(shù)據(jù)的積累,本指導原則也將適時進行更新。
載體拷貝數(shù)檢測唯可生物開發(fā)并驗證了一種基于探針的定量聚合酶鏈反應(qPCR)分析方法,用于慢病毒載體拷貝數(shù)(VCN)定量。該分析利用基于Taqman水解探針的方法對100ng級別的人類基因組DNA中的目標拷貝進行定量?;谔结樀膓PCR,用于靈敏和準確的VCN定量LV載體拷貝數(shù)qPCR分析可根據(jù)監(jiān)管要求,使用100ng級別的人類基因組DNA,定量從10000000到10個拷貝的載體拷貝數(shù)。由于在評估未翻譯的人類基因組DNA時未檢測到背景噪聲水平,因此該分析具有高度特異性。驗證慢病毒載體基因組拷貝的定量qPCR分析可用于定量測定人類基因組DNA中的慢病毒載體基因組拷貝。該分析滿足研究/患者樣本分析的目標特異性、精密度和準確度要求。如何查到某個載體的拷貝數(shù)?
使用核酸載體進行基因轉導或修飾時,應持續(xù)關注細胞產(chǎn)品中載體系統(tǒng)的殘留情況,分析外源在基因組中的插入位置、拷貝數(shù)等,監(jiān)控基因編輯用酶的細胞內持續(xù)表達時間等,并在受試者給藥后進行長期安全性監(jiān)測。當基因zhiliao產(chǎn)品在生殖qiguan持續(xù)存在時,需要進一步研究確定其在生殖細胞(例如卵母細胞、精子)的暴露水平。根據(jù)載體類型、復制能力、基因組整合特性、劑量水平、給藥途徑等因素,分析評估基因zhiliao產(chǎn)品生殖系整合風險。基因zhiliao產(chǎn)品將遺傳物質轉移到宿主細胞內或整合到宿主基因組中或對宿主基因組進行編輯,存在潛在的遺傳毒性風險。目前對于判斷細胞基因組插入/修飾是否會產(chǎn)生遺傳毒性、是否較終會發(fā)生變依然還缺乏系統(tǒng)的認知,因此,需要分析基因組改變(載體或遺傳物質整合進基因組、對基因組編輯等)的特征,并評估相關潛在風險。一些整合性載體(如逆轉錄病毒、慢病毒、轉座子)可將外源基因插入整合到細胞基因組中,這可能會導致關鍵基因突變或jihuo原基因,從而導致惡性風險增加。載體拷貝數(shù)的分析方法,歡迎咨詢上海唯可生物科技有限公司。杭州 LV載體拷貝數(shù)安全性評價
載體拷貝數(shù)計算公式:copies/ml(拷貝數(shù))=(6.02 x 10(23)次拷貝數(shù)/摩爾) x (濃度) / (MW g/mol)。蘇州細胞療法載體拷貝數(shù)檢測
利用ddPCR檢測溶液中空載體的濃度和整合到T細胞群中的CAR和TCR載體的平均數(shù)量。ddPCR檢測到的平均每個細胞的載體拷貝數(shù)與流式細胞術檢測到的細胞轉導比例呈線性關系。使用ddPCR與Real-time PCR的定量精度比較表明,ddPCR明顯更精確,測量的差異減少了7倍,文中通過一些數(shù)據(jù)的比較說明了ddPCR具有更高的準確性和穩(wěn)定性。使用ddPCR測定法通過不同的工作人員獲得了類似的載體拷貝數(shù)測量結果,突出了該測定法在技術人員之間的可重復性。對新鮮的和冷凍保存的CAR T和TCR工程改造的T細胞進行的分析得出了相似的結果。說明ddPCR是一種準確定量CAR和TCR工程T細胞中平均載體拷貝數(shù)的強大工具。該試驗也適用于其他類型的基因工程細胞,包括自然殺傷細胞和造血干細胞。蘇州細胞療法載體拷貝數(shù)檢測