CIRCLE-Seq，將gDNA打斷并環(huán)化，環(huán)化的DNA與CRISPR/RNP孵育，NGS測序檢測線性化的DNapian段，確定脫靶位點。PCR富集后測序，成本相對較低，能檢測低頻脫靶突變。安必奇sgRNA脫靶效應評估，安必奇生物提供sgRNA脫靶效應評估服務，幫助您挑選高度特異，脫靶率低的sgRNA進行后續(xù)實驗。同時，我們也協(xié)助您檢測分析基因編輯后細胞樣品的脫靶情況，通過各種高通量測序檢測技術(shù)，我們能準確的分析全基因組范圍內(nèi)的脫靶位點，推動CRISPR/Cas9技術(shù)在zhiliao藥物開發(fā)和臨床研究中的應用。我們的優(yōu)勢：靈敏度高：能檢測低頻脫靶突變★準確性高：檢測結(jié)果可通過實驗驗證★多種檢測方法可選擇以滿足不同的實驗需求定量脫靶檢測，推薦唯可生物，實驗實力強，專業(yè)性高，檢測效率高，結(jié)果準確率高。上海crispr脫靶檢測方法

BLESS：利用生物素標簽對DSBs進行原位標記，后經(jīng)PCR擴增實現(xiàn)對于生物素標記片段的富集，并通過二代測序?qū)崿F(xiàn)脫靶位點檢測。直接檢測細胞中的切割位點，靈敏度與細胞、組織密切相關(guān)。LAM-HTGTS，片段化的gDNA經(jīng)過LAM-PCR引入接頭，然后進行全基因組易位測序。高通量的全基因組范圍檢測，可準確檢測DSBs引發(fā)的重排。GUIDE-Seq，將dsODN    s標簽整合到DSBs位點，通過二代測序檢測這些標簽所在的基因組區(qū)域，從而確定脫靶突變的位置。廣使用的細胞內(nèi)檢測方法。能檢測低頻脫靶突變。Digenome-Seq，片段化的gDNA與CRISPR/RNP混合孵育，進行全基因組測序檢測脫靶。全基因組測序，直接檢測切割位點，能檢測低頻脫靶突變。江蘇基因療法脫靶檢測評估內(nèi)基因編輯技術(shù)可能造成的脫靶效應。

CIRCLE-seq和CHANGE-seq與SITE-seq同期發(fā)表的CIRCLE-seq一定程度上解決了SITE-seq的一些問題。CIRCLE-seq的第一步是將純化后的基因組DNA隨機打斷成300bp左右的片段，然后首尾相連成環(huán)狀DNA，這種方法很好地避免了DNA隨機斷裂造成的背景噪聲。實驗的第二步是用Cas9切割環(huán)狀DNA，再連上接頭并進行雙端測序，這樣就可以在一次測序中同時獲取切割位點的兩側(cè)序列，彌補了SITE-seq的另一個缺點。CIRCLE-seq從總體上來說要優(yōu)于SITE-seq，但是將基因組DNA隨機打斷后成環(huán)的效率并不高，所以同一作者在3年后發(fā)表了CHANGE-seq，用Tn5一步法打斷基因組并加接頭，提高了成環(huán)效率，降低了起始基因組DNA的用量。

自基因zhiliao出現(xiàn)之日起，安全性問題就隨之產(chǎn)生了，并成為阻礙基因zhiliao研發(fā)的一大障礙，吳寧博士認為：“基因zhiliao產(chǎn)品的研發(fā)和上市，安全性會將是一個非常重要考量。如果一款產(chǎn)品它安全性有問題的話，在市場化道路上就會受到很大影響。尤其是基因zhiliao，目前處于起始階段，一旦出現(xiàn)不良事件，很有可能對整個行業(yè)都會產(chǎn)生致命打擊。具體說來，基因zhiliao的安全性問題主要涉及基因插入突變、脫靶、生物分布和持久性、潛伏再jihuo以及潛在免疫原性等。”如何檢測是否發(fā)生脫靶? 基因編輯的脫靶率檢測一般有兩種方法。

細胞經(jīng)基因修飾后會改變其生物學特性，同時也會帶來新的安全性風險，如基因編輯脫靶風險、載體插入突變風險、載體重組風險、表達的轉(zhuǎn)基因產(chǎn)物的風險等。在制定非臨床研究計劃時，除參考《細胞zhilliao產(chǎn)品研究與評價技術(shù)指導原則》（試行）中的對細胞zhilliao產(chǎn)品的一般要求外，還應具體問題具體分析，基于產(chǎn)品特點和目前已有的科學認知，結(jié)合擬定適應癥、患者人群、給藥途徑和給yaofang案等方面的考慮，科學合理的設(shè)計和實施非臨床研究，充分表征產(chǎn)品的藥理學、毒理學和藥代動力學特征。在進行獲益風險評估時，還應重點關(guān)注由非臨床向臨床過渡時非臨床研究的局限性和風險預測的不確定性。脫靶檢測評估，推薦唯可生物，實驗實力強，專業(yè)性高，檢測效率高，結(jié)果準確率高。南通種子基因脫靶檢測實驗室

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細胞外檢測方法：細胞外檢測方法較為直接，將基因組提純后進行CRISPR體外切割實驗，再捕獲發(fā)生脫靶切割的位點即可。1) Digenome-seqDigenome-seq是較早提出的一類細胞外脫靶位點檢測方法，提純的基因組DNA被Cas9/sgRNA切割后，再經(jīng)過標準的全基因組測序流程獲得測序數(shù)據(jù)，之后需要較為復雜的生物信息學分析才能夠獲得CRISPR切割位點的信息。總體來講，這種方法測序成本較高，并且檢測靈敏度也有限。2)SITE-seq為了有效檢測到低頻脫靶位點，一般需要在建庫時定向捕獲CRISPR切割位點。SITE-seq就是這樣一種測序方法，提純的基因組DNA經(jīng)過Cas9/sgRNA切割后，在切割位點末端連接帶Biotin的接頭；再隨機打斷基因組，在另一端連接第二個接頭；經(jīng)過鏈霉親和素磁珠純化，只有一輪被Cas9切割的DNA才能夠被純化并測序，實現(xiàn)了CRISPR切割位點的富集。該方法雖然提高了脫靶位點的檢測靈敏度，但有著較高的實驗要求，每次需要投入大量的基因組DNA，并且無法區(qū)分提純基因組DNA時發(fā)生的隨機斷裂和Cas9的切割，導致產(chǎn)出較為明顯的背景信號。同時，由于一輪Biotin接頭只會接在Cas9切割位點的一側(cè)，導致測序結(jié)果里只能看到脫靶位點一側(cè)的序列。上海crispr脫靶檢測方法