BLESS：利用生物素標(biāo)簽對DSBs進行原位標(biāo)記，后經(jīng)PCR擴增實現(xiàn)對于生物素標(biāo)記片段的富集，并通過二代測序?qū)崿F(xiàn)脫靶位點檢測。直接檢測細胞中的切割位點，靈敏度與細胞、組織密切相關(guān)。LAM-HTGTS，片段化的gDNA經(jīng)過LAM-PCR引入接頭，然后進行全基因組易位測序。高通量的全基因組范圍檢測，可準(zhǔn)確檢測DSBs引發(fā)的重排。GUIDE-Seq，將dsODN    s標(biāo)簽整合到DSBs位點，通過二代測序檢測這些標(biāo)簽所在的基因組區(qū)域，從而確定脫靶突變的位置。廣使用的細胞內(nèi)檢測方法。能檢測低頻脫靶突變。Digenome-Seq，片段化的gDNA與CRISPR/RNP混合孵育，進行全基因組測序檢測脫靶。全基因組測序，直接檢測切割位點，能檢測低頻脫靶突變。脫靶檢測政策，推薦唯可生物，實驗實力強，專業(yè)性高，檢測效率高，結(jié)果準(zhǔn)確率高?；虔煼摪袡z測分析

Cas9蛋白是一種切割外來DNA的酶，像一把分子剪刀。該蛋白通常與兩個RNA分子結(jié)合：crRNA和另一個稱為tracrRNA（或“反式j(luò)ihuocrRNA”）。這兩個RNA分子引導(dǎo)Cas9到它將進行切割的目標(biāo)部位。這段DNA是與crRNA的20個核苷酸互補的。CRISPR技術(shù)是從細菌和古細菌的自然防御機制中改編而來的。這些生物體使用CRISPR衍生的RNA和各種Cas蛋白，包括Cas9，來阻止病毒和其他異物的攻擊。它們主要通過切碎和破壞外來入侵者的DNA來做到這一點。當(dāng)這些組件被轉(zhuǎn)移到其他更復(fù)雜的生物體中時，它允許對基因進行操縱，或“編輯”。廣州基因編輯脫靶檢測安評預(yù)算允許的情況下，通過全基因組測序的方法進行全基因組序列的分析和比對更精細，如基于NGS的iGUIDE方法。

但是由于CHIP-seq實驗本身的難度較高，DISCOVER-seq這類方法的接受度并不高。3. 其他特殊方法CRISPR技術(shù)經(jīng)過這么多年的發(fā)展，其應(yīng)用已經(jīng)不局限于造成DNA雙鏈斷裂，一些不要切割DNA雙鏈的CRISPR衍生技術(shù)（如堿基編輯、先導(dǎo)編輯和CRISPRi/a），可以在不引發(fā)隨機突變的情況下，對基因組進行精細編輯或者調(diào)控。這些技術(shù)所使用nCas9或dCas9只結(jié)合或者切割雙鏈中的一條鏈，之前的脫靶檢測方法都不能直接適用。這些CRISPR衍生技術(shù)中，CRISPR產(chǎn)生的脫靶可以被細分為兩個部分，其一是Cas9/sgRNA結(jié)合DNA導(dǎo)致的脫靶，這部分信息使用同樣序列的sgRNA進行野生型Cas9脫靶位點檢測能夠間接得到

采用基因編輯技術(shù)制備的細胞產(chǎn)品。對于采用基因編輯技術(shù)制備的基因修飾細胞產(chǎn)品，應(yīng)進行體外在靶和脫靶活性評估，以確認修飾酶或向?qū)NA對靶基因序列的特異性。在評估基因編輯的脫靶風(fēng)險時，應(yīng)說明所選擇的評價策略的合理性和敏感性。雖然采用計算機分析預(yù)測基因編輯的潛在脫靶位點，并對潛在脫靶位點進行深度測序分析，可用于評估基因編輯的脫靶風(fēng)險；但選擇的評價策略仍應(yīng)包含體外全基因組測序比對，以證明潛在脫靶位點未出現(xiàn)脫靶。此外，在評估脫靶活性時，還應(yīng)評估種屬特異性的差異、細胞病理生理狀態(tài)的差異或細胞類型的差異對非臨床數(shù)據(jù)預(yù)測性的影響。必要時，還應(yīng)分析基因編輯對細胞表型和生理功能的潛在影響。脫靶檢測guide-sequence，推薦唯可生物，實驗實力強，專業(yè)性高，檢測效率高，結(jié)果準(zhǔn)確率高。

細胞經(jīng)基因修飾后會改變其生物學(xué)特性，同時也會帶來新的安全性風(fēng)險，如基因編輯脫靶風(fēng)險、載體插入突變風(fēng)險、載體重組風(fēng)險、表達的轉(zhuǎn)基因產(chǎn)物的風(fēng)險等。細胞經(jīng)基因修飾后會改變其生物學(xué)特性，同時也會帶來新的安全性風(fēng)險，如基因編輯脫靶風(fēng)險、載體插入突變風(fēng)險、載體重組風(fēng)險、表達的轉(zhuǎn)基因產(chǎn)物的風(fēng)險等。基于基因修飾細胞的產(chǎn)品種類繁多、各有特點，除上述一般技術(shù)要求外，還應(yīng)基于產(chǎn)品的性進行相應(yīng)的特殊考慮。本指導(dǎo)原則列舉了以下三種情形的特殊考慮。種子基因脫靶檢測，推薦唯可生物，實驗實力強，專業(yè)性高，檢測效率高，結(jié)果準(zhǔn)確率高。臺州crispr/cas9脫靶檢測分析

檢測脫靶效應(yīng)比較好的方法:CIRCLE-seq?；虔煼摪袡z測分析

細胞外檢測方法：細胞外檢測方法較為直接，將基因組提純后進行CRISPR體外切割實驗，再捕獲發(fā)生脫靶切割的位點即可。1) Digenome-seqDigenome-seq是較早提出的一類細胞外脫靶位點檢測方法，提純的基因組DNA被Cas9/sgRNA切割后，再經(jīng)過標(biāo)準(zhǔn)的全基因組測序流程獲得測序數(shù)據(jù)，之后需要較為復(fù)雜的生物信息學(xué)分析才能夠獲得CRISPR切割位點的信息?？傮w來講，這種方法測序成本較高，并且檢測靈敏度也有限。2)SITE-seq為了有效檢測到低頻脫靶位點，一般需要在建庫時定向捕獲CRISPR切割位點。SITE-seq就是這樣一種測序方法，提純的基因組DNA經(jīng)過Cas9/sgRNA切割后，在切割位點末端連接帶Biotin的接頭；再隨機打斷基因組，在另一端連接第二個接頭；經(jīng)過鏈霉親和素磁珠純化，只有一輪被Cas9切割的DNA才能夠被純化并測序，實現(xiàn)了CRISPR切割位點的富集。該方法雖然提高了脫靶位點的檢測靈敏度，但有著較高的實驗要求，每次需要投入大量的基因組DNA，并且無法區(qū)分提純基因組DNA時發(fā)生的隨機斷裂和Cas9的切割，導(dǎo)致產(chǎn)出較為明顯的背景信號。同時，由于一輪Biotin接頭只會接在Cas9切割位點的一側(cè)，導(dǎo)致測序結(jié)果里只能看到脫靶位點一側(cè)的序列?；虔煼摪袡z測分析