應(yīng)用場(chǎng)景：?jiǎn)慰寺】贵w藥物輔助篩選；致xingbing毒整合位點(diǎn)檢測(cè)與整合偏好性分析等；WGS不適用于轉(zhuǎn)染之后未經(jīng)過傳代培養(yǎng)和表型篩選的細(xì)胞系。豐富的項(xiàng)目經(jīng)驗(yàn)?zāi)壳埃梢雅c國(guó)內(nèi)外多家免疫zhiliao研究前沿企業(yè)開展合作，采用該方法對(duì)高度異質(zhì)性的CAR-T細(xì)胞進(jìn)行整合位點(diǎn)檢測(cè)與細(xì)胞安全性評(píng)估，具有較為豐富的項(xiàng)目經(jīng)驗(yàn)。一般HBV插入到基因組中形成下圖結(jié)構(gòu)。使用三代測(cè)序，靶向插入?yún)^(qū)域的測(cè)序reads可分為Readsgroup1（HBV插入?yún)^(qū)域測(cè)通）和Readsgroup2（reads部分比對(duì)染色體，部分比對(duì)HBV插入?yún)^(qū)域）?；谌鷶?shù)據(jù)比對(duì)后bam文件的IGV圖，判斷變異類型，推斷斷點(diǎn)類型和插入序列。目前,基因整合位點(diǎn)主要通過PCR方法分離并經(jīng)測(cè)序鑒定。溫州載體整合位點(diǎn)安全性評(píng)價(jià)

當(dāng)載體或基因zhiliao產(chǎn)品原有的風(fēng)險(xiǎn)特征增加時(shí)，例如經(jīng)過修飾以攜帶基因組編輯成分的質(zhì)?；蚋淖兘oyaofang式以提高整合能力等，需要提高對(duì)長(zhǎng)期隨訪觀察的要求；反之，也可以對(duì)目前認(rèn)為存在遲發(fā)風(fēng)險(xiǎn)的基因zhiliao載體進(jìn)行修飾，以降低這些風(fēng)險(xiǎn)。長(zhǎng)期表達(dá)，與其他產(chǎn)品相比，部分基因zhiliao產(chǎn)品的明顯特征是可以在患者靶細(xì)胞或基因修飾細(xì)胞中持續(xù)存在并編碼表達(dá)作用因子（功能性蛋白或基因表達(dá)調(diào)節(jié)元件），并通過長(zhǎng)久或長(zhǎng)期改變靶細(xì)胞或組織的功能來達(dá)到zhiliao效果。同時(shí)，由于基因zhiliao編碼的作用因子在體內(nèi)的長(zhǎng)期暴露或表達(dá)異常，可能產(chǎn)生與其功能相關(guān)的長(zhǎng)期安全性風(fēng)險(xiǎn)，如細(xì)胞生長(zhǎng)失控和惡性liu形成、自身免疫反應(yīng)或其他無法預(yù)測(cè)的遲發(fā)性不良反應(yīng)。南京整合位點(diǎn)安評(píng)通過分選CAR-T 細(xì)胞,對(duì)T細(xì)胞受體(TCR)β鏈庫(kù)進(jìn)行深度測(cè)序(TCR-seq)以及慢病毒載體整合位點(diǎn)(LVIS)分析。

插入突變風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估一些整合性載體（如逆轉(zhuǎn)錄病毒、慢病毒、轉(zhuǎn)座子）可將外源基因插入整合到細(xì)胞基因組中，這可能會(huì)導(dǎo)致關(guān)鍵基因突變或jihuo原基因，從而導(dǎo)致惡性liu風(fēng)險(xiǎn)增加。影響插入突變的關(guān)鍵風(fēng)險(xiǎn)因素包括：（1）載體的整合特征，如插入位點(diǎn)的偏好性；（2）載體的設(shè)計(jì)，如增強(qiáng)子、啟動(dòng)子等構(gòu)建元件的活性，影響鄰近基因的潛力；產(chǎn)生剪接突變體的潛在剪接位點(diǎn)或多聚腺苷酸信號(hào)等；（3）細(xì)胞載體拷貝數(shù)；4）轉(zhuǎn)基因表達(dá)產(chǎn)物的功能活性（如與細(xì)胞生長(zhǎng)調(diào)控相關(guān)）和表達(dá)水平；5）靶細(xì)胞群的轉(zhuǎn)化可能性，這可能與細(xì)胞的分化狀態(tài)、增殖潛力、體外培養(yǎng)條件和體內(nèi)植入環(huán)境等有關(guān)。

基因編輯產(chǎn)品建議觀察15年或至數(shù)據(jù)表明不再存在任何風(fēng)險(xiǎn)。?腺相關(guān)病毒載體建議觀察5年或至數(shù)據(jù)表明不再存在任何風(fēng)險(xiǎn)。以上長(zhǎng)期隨訪時(shí)間的建議主要基于基因zhiliao的產(chǎn)品類型，具體產(chǎn)品的隨訪時(shí)間取決于產(chǎn)品的特性和體內(nèi)存在時(shí)間、轉(zhuǎn)基因表達(dá)時(shí)間、遲發(fā)性不良反應(yīng)的預(yù)期時(shí)間及發(fā)生率、受試者適應(yīng)癥和預(yù)期生存期、給藥途徑、以及長(zhǎng)期隨訪的其他觀察目的。隨著隨訪數(shù)據(jù)的積累，研究者和研究申辦方可能會(huì)根據(jù)產(chǎn)品的存在情況、轉(zhuǎn)基因表達(dá)和臨床表現(xiàn)的持續(xù)評(píng)估情況，延長(zhǎng)或縮短長(zhǎng)期隨訪的持續(xù)時(shí)間。如果研究申辦方認(rèn)為其基因zhiliao產(chǎn)品安全性風(fēng)險(xiǎn)較低、無需開展長(zhǎng)期隨訪臨床研究，或者希望變更隨訪時(shí)間，應(yīng)合理說明依據(jù)或變更理由并與藥品監(jiān)督管理部門進(jìn)行溝通。慢病毒載體介導(dǎo)的轉(zhuǎn)基因整合位點(diǎn)研究方法。

?如果受試者體內(nèi)出現(xiàn)載體陽(yáng)性細(xì)胞的克隆性生長(zhǎng)，或檢測(cè)發(fā)現(xiàn)基因整合位點(diǎn)在基因或相關(guān)基因附近，應(yīng)縮短檢測(cè)間隔至不超過3個(gè)月并密切監(jiān)測(cè)惡性liu征兆，直至檢測(cè)不到基因zhiliao載體。?對(duì)基于慢病毒/逆轉(zhuǎn)錄病毒載體的基因zhiliao產(chǎn)品，如出現(xiàn)與可復(fù)制xingbing毒可能相關(guān)的不良事件，還應(yīng)開展可復(fù)制xingbing毒（replicablecompetentlentivirus/retrovirus，RCL/RCR）的檢測(cè)。關(guān)于基因編輯產(chǎn)品的特殊考慮基因編輯產(chǎn)品除了適用基因zhiliao產(chǎn)品的一般考慮以及整合性載體的特殊考慮外，長(zhǎng)期隨訪中還應(yīng)額外關(guān)注脫靶風(fēng)險(xiǎn)，量化評(píng)估脫靶活性和在靶活性之間的相關(guān)性，或利用在靶活性來預(yù)測(cè)脫靶活性的水平。如果基因zhiliao產(chǎn)品通過全身給yaofang式遞送，長(zhǎng)期隨訪中的安全性監(jiān)測(cè)不僅包括靶qiguan或靶組織的脫靶活性，而且還應(yīng)包括可能發(fā)生在其他組織和qiguan中的脫靶活性。采用LM-PCR和全基因組重測(cè)序兩種方法,可以有效分析重組細(xì)胞外源序列的整合位點(diǎn)。杭州AAV整合位點(diǎn)服務(wù)

整合位點(diǎn)安評(píng)，推薦唯可生物，實(shí)驗(yàn)實(shí)力強(qiáng)，專業(yè)性高，檢測(cè)效率高，結(jié)果準(zhǔn)確率高。溫州載體整合位點(diǎn)安全性評(píng)價(jià)

由于免疫細(xì)胞zhiliao產(chǎn)品的長(zhǎng)期存活及持久性作用，申請(qǐng)人應(yīng)對(duì)臨床試驗(yàn)期間接受zhiliao的所有受試者進(jìn)行適當(dāng)?shù)拈L(zhǎng)期隨訪，關(guān)注受試者生存、新發(fā)或繼發(fā)aizheng、ganran、免疫功能變化及遲發(fā)性不良反應(yīng)等安全性風(fēng)險(xiǎn)，以及非臨床或臨床數(shù)據(jù)提示需要關(guān)注的潛在風(fēng)險(xiǎn)，并觀察產(chǎn)品在體內(nèi)的持續(xù)存在時(shí)間、轉(zhuǎn)基因表達(dá)時(shí)間（如有）、是否有致瘤性、免疫原性等。隨訪時(shí)間主要取決于免疫細(xì)胞zhiliao產(chǎn)品的風(fēng)險(xiǎn)水平、體內(nèi)的存活和作用時(shí)間、疾病進(jìn)程的認(rèn)識(shí)等，應(yīng)足以觀察到可能由于產(chǎn)品特性、暴露性質(zhì)等導(dǎo)致的受試者風(fēng)險(xiǎn)，并不應(yīng)短于遲發(fā)不良事件的預(yù)期發(fā)生時(shí)間。溫州載體整合位點(diǎn)安全性評(píng)價(jià)