Cas9蛋白是一種切割外來(lái)DNA的酶,像一把分子剪刀。該蛋白通常與兩個(gè)RNA分子結(jié)合:crRNA和另一個(gè)稱為tracrRNA(或“反式j(luò)ihuocrRNA”)。這兩個(gè)RNA分子引導(dǎo)Cas9到它將進(jìn)行切割的目標(biāo)部位。這段DNA是與crRNA的20個(gè)核苷酸互補(bǔ)的。CRISPR技術(shù)是從細(xì)菌和古細(xì)菌的自然防御機(jī)制中改編而來(lái)的。這些生物體使用CRISPR衍生的RNA和各種Cas蛋白,包括Cas9,來(lái)阻止病毒和其他異物的攻擊。它們主要通過(guò)切碎和破壞外來(lái)入侵者的DNA來(lái)做到這一點(diǎn)。當(dāng)這些組件被轉(zhuǎn)移到其他更復(fù)雜的生物體中時(shí),它允許對(duì)基因進(jìn)行操縱,或“編輯”。脫靶檢測(cè)評(píng)估,推薦唯可生物,實(shí)驗(yàn)實(shí)力強(qiáng),專業(yè)性高,檢測(cè)效率高,結(jié)果準(zhǔn)確率高。廣州育種脫靶檢測(cè)評(píng)估
細(xì)胞經(jīng)基因修飾后會(huì)改變其生物學(xué)特性,同時(shí)也會(huì)帶來(lái)新的安全性風(fēng)險(xiǎn),如基因編輯脫靶風(fēng)險(xiǎn)、載體插入突變風(fēng)險(xiǎn)、載體重組風(fēng)險(xiǎn)、表達(dá)的轉(zhuǎn)基因產(chǎn)物的風(fēng)險(xiǎn)等。在制定非臨床研究計(jì)劃時(shí),除參考《細(xì)胞zhilliao產(chǎn)品研究與評(píng)價(jià)技術(shù)指導(dǎo)原則》(試行)中的對(duì)細(xì)胞zhilliao產(chǎn)品的一般要求外,還應(yīng)具體問(wèn)題具體分析,基于產(chǎn)品特點(diǎn)和目前已有的科學(xué)認(rèn)知,結(jié)合擬定適應(yīng)癥、患者人群、給藥途徑和給yaofang案等方面的考慮,科學(xué)合理的設(shè)計(jì)和實(shí)施非臨床研究,充分表征產(chǎn)品的藥理學(xué)、毒理學(xué)和藥代動(dòng)力學(xué)特征。在進(jìn)行獲益風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估時(shí),還應(yīng)重點(diǎn)關(guān)注由非臨床向臨床過(guò)渡時(shí)非臨床研究的局限性和風(fēng)險(xiǎn)預(yù)測(cè)的不確定性。臺(tái)州基因療法脫靶檢測(cè)政策可以與靶基因之外的其他基因作用而非特異性阻斷基因表達(dá),即產(chǎn)生非靶基因的沉默效應(yīng)。
CRISPR/Cas9的問(wèn)題:和TALEN和ZFNS技術(shù)一樣,CRISPR/Cas9技術(shù)在應(yīng)用時(shí)也存在一定概率的脫靶問(wèn)題——Cas9核酸酶在非目標(biāo)位點(diǎn)發(fā)生切割,引入非預(yù)期的基因突變。脫靶切割引入的突變可能會(huì)直接破壞細(xì)胞的基本功能,帶來(lái)不可預(yù)控的嚴(yán)重后果。如何減輕脫靶效應(yīng)?gRNA的GC含量:gRNA 的序列結(jié)構(gòu)對(duì)CRISPR/Cas9基因編輯的靶向活性有影響。gRNA 序列中 40%–60%的 GC 含量可以增加靶向活性,因?yàn)檩^高的 GC 含量穩(wěn)定了DNA:RNA 雙鏈體并破壞了脫靶結(jié)合。gRNA-on-gRNA序列的位置對(duì)編輯有影響,位于四個(gè)核苷酸末端的嘌呤殘基可以提高編輯效率。鳥(niǎo)嘌呤優(yōu)先選擇在gRNA的20位,胞嘧啶優(yōu)先選擇在16位以增加靶向編輯。
BLESS:利用生物素標(biāo)簽對(duì)DSBs進(jìn)行原位標(biāo)記,后經(jīng)PCR擴(kuò)增實(shí)現(xiàn)對(duì)于生物素標(biāo)記片段的富集,并通過(guò)二代測(cè)序?qū)崿F(xiàn)脫靶位點(diǎn)檢測(cè)。直接檢測(cè)細(xì)胞中的切割位點(diǎn),靈敏度與細(xì)胞、組織密切相關(guān)。LAM-HTGTS,片段化的gDNA經(jīng)過(guò)LAM-PCR引入接頭,然后進(jìn)行全基因組易位測(cè)序。高通量的全基因組范圍檢測(cè),可準(zhǔn)確檢測(cè)DSBs引發(fā)的重排。GUIDE-Seq,將dsODN s標(biāo)簽整合到DSBs位點(diǎn),通過(guò)二代測(cè)序檢測(cè)這些標(biāo)簽所在的基因組區(qū)域,從而確定脫靶突變的位置。廣使用的細(xì)胞內(nèi)檢測(cè)方法。能檢測(cè)低頻脫靶突變。Digenome-Seq,片段化的gDNA與CRISPR/RNP混合孵育,進(jìn)行全基因組測(cè)序檢測(cè)脫靶。全基因組測(cè)序,直接檢測(cè)切割位點(diǎn),能檢測(cè)低頻脫靶突變。通過(guò)對(duì)DSB的標(biāo)記實(shí)現(xiàn)了全基因組無(wú)偏脫靶檢測(cè),如IDLVs、BLESS、GUIDE-seq技術(shù)等。
臨床研究人群,如果一種基因zhiliao產(chǎn)品具有引起遲發(fā)性不良反應(yīng)的風(fēng)險(xiǎn),需要開(kāi)展長(zhǎng)期隨訪觀察時(shí),所有接受基因zhiliao產(chǎn)品的受試者在簽署知情同意書(shū)后均應(yīng)入組長(zhǎng)期隨訪臨床研究。在設(shè)計(jì)長(zhǎng)期隨訪臨床研究的方案時(shí),應(yīng)考慮目標(biāo)受試者人群及特征、整體健康情況以及接受zhiliao的患者的預(yù)期生存期等特征對(duì)遲發(fā)性不良反應(yīng)的收集的影響。通常來(lái)說(shuō),當(dāng)臨床研究人群的某些特征(如預(yù)期壽命短、多重合并癥、以及暴露于放療或化療等其他藥物)可能干擾遲發(fā)性不良反應(yīng)的觀察分析時(shí),會(huì)影響長(zhǎng)期隨訪觀察在評(píng)估和減輕受試者風(fēng)險(xiǎn)方面的效用;而在病情較輕或較局限,合并癥以及伴隨zhiliao有限或較穩(wěn)定的受試者中,通過(guò)長(zhǎng)期隨訪觀察收集到的評(píng)估數(shù)據(jù)可能更容易分析。種子基因脫靶檢測(cè)多少錢?南通種子脫靶檢測(cè)安全性評(píng)價(jià)
檢測(cè)脫靶效應(yīng)比較好的方法:CIRCLE-seq。廣州育種脫靶檢測(cè)評(píng)估
長(zhǎng)期隨訪觀察的考慮要素:遲發(fā)性不良反應(yīng)相關(guān)的潛在風(fēng)險(xiǎn)因素.在評(píng)估基因zhiliao產(chǎn)品的風(fēng)險(xiǎn)因素時(shí),申請(qǐng)人應(yīng)考慮基因zhiliao產(chǎn)品的特性,同時(shí)參考該產(chǎn)品的非臨床和臨床數(shù)據(jù)以及類似產(chǎn)品的已知數(shù)據(jù)。基因zhiliao產(chǎn)品的非臨床研究旨在為臨床研究提供支持性信息和關(guān)鍵安全性特征參數(shù),如機(jī)體中的生物分布和持久性、整合/修飾宿主基因組、潛伏再jihuo以及潛在免疫原性等。對(duì)于新型基因zhiliao產(chǎn)品,可參考數(shù)據(jù)有限,申請(qǐng)人應(yīng)盡可能在非臨床研究中獲得用于評(píng)估遲發(fā)性不良反應(yīng)風(fēng)險(xiǎn)的數(shù)據(jù)。廣州育種脫靶檢測(cè)評(píng)估