TCR修飾免疫細(xì)胞的脫靶毒性可通過評估TCR與人體自身抗原肽的交叉識別能力來評估。首先,應(yīng)采用體外試驗(yàn)測定TCR修飾的免疫細(xì)胞與人自身抗原肽-HLA(與遞呈靶抗原肽的HLA等位基因相同)復(fù)合物的親和力,并說明抗原肽的選擇依據(jù)及選擇范圍。此外,還應(yīng)研究其他相關(guān)或不相關(guān)的蛋白中是否含有靶抗原肽序列。如果TCR與人自身抗原肽有交叉反應(yīng)可能,應(yīng)確定靶抗原肽的較小識別基序(motif),并采用計(jì)算機(jī)預(yù)測分析評估交叉反應(yīng)性。如果計(jì)算機(jī)預(yù)測可識別出具有潛在交叉反應(yīng)性的抗原肽,應(yīng)在體外測定TCR修飾免疫細(xì)胞對表達(dá)相應(yīng)蛋白或遞呈相應(yīng)抗原肽的的細(xì)胞的識別能力。如果不能排除交叉反應(yīng)性,應(yīng)基于含有潛在交叉反應(yīng)性抗原肽的蛋白的表達(dá)模式以及TCR與潛在交叉反應(yīng)性抗原肽的親和力來進(jìn)行風(fēng)險(xiǎn)評估。為獲得TCR與其他等位HLA潛在交叉反應(yīng)性的信息,應(yīng)進(jìn)行充分的HLA交叉反應(yīng)性篩選。對于TCR修飾的T細(xì)胞,還應(yīng)關(guān)注引入TCR鏈和內(nèi)源性TCR之間的錯(cuò)配可能性,應(yīng)描述和說明旨在降低錯(cuò)配可能性的TCR設(shè)計(jì)策略。脫靶檢測政策,推薦唯可生物,實(shí)驗(yàn)實(shí)力強(qiáng),專業(yè)性高,檢測效率高,結(jié)果準(zhǔn)確率高。廣州crispr/cas9脫靶檢測報(bào)告
基因編輯產(chǎn)品除了適用基因zhiliao產(chǎn)品的一般考慮以及整合性載體的特殊考慮外,長期隨訪中還應(yīng)額外關(guān)注脫靶風(fēng)險(xiǎn),量化評估脫靶活性和在靶活性之間的相關(guān)性,或利用在靶活性來預(yù)測脫靶活性的水平。在開發(fā)過程中應(yīng)同時(shí)關(guān)注基因轉(zhuǎn)導(dǎo)效率、脫靶效率、插入突變情況、目的基因在靶細(xì)胞中整合位點(diǎn)及表達(dá)。評估基因zhiliao產(chǎn)品整合進(jìn)基因組的可能性,判斷是否需要開展另外的遺傳毒性研究,評估插入突變(插入位點(diǎn)、插入拷貝數(shù)等)引起的遺傳毒性風(fēng)險(xiǎn)。需要關(guān)注脫靶編輯、轉(zhuǎn)座子轉(zhuǎn)座印跡引起的遺傳毒性問題;鑒定/表征基因組整合位點(diǎn)。非臨床研究是藥物開發(fā)的重要環(huán)節(jié)之一。杭州基因編輯脫靶檢測guide-sequence定量脫靶檢測,推薦唯可生物,實(shí)驗(yàn)實(shí)力強(qiáng),專業(yè)性高,檢測效率高,結(jié)果準(zhǔn)確率高。
使用CRISPR/Cas9、ZFNs和TALENs等設(shè)計(jì)核酸酶進(jìn)行基因組編輯,可以將遺傳物質(zhì)定向?qū)氩溉閯?dòng)物基因組的特定位點(diǎn)。然而,可能會出現(xiàn)非預(yù)期的靶上和靶外基因組修飾,這可能導(dǎo)致基因組不穩(wěn)定,并破壞正?;虻墓δ埽瑥亩赡軐?dǎo)致臨床前和臨床研究中的安全問題。基因編輯目前的脫靶分析技術(shù)主要依賴于生物信息學(xué)預(yù)測和全基因組脫靶檢測技術(shù)。這些預(yù)測缺乏可靠性,因?yàn)樗鼈冎缓w了潛在基因組改變的一小部分。而頻率低于0.5%的脫靶突變大多無法被全基因組脫靶檢測技術(shù)檢測到。我們是開發(fā)用于全基因組靶向/非靶向分析的無偏分析的先驅(qū)。靶向基因組編輯唯可生物為基因編輯安全性評估提供多方面的PCR和基于NGS的分析。我們的多功能且經(jīng)濟(jì)高效的檢測方法可檢測靶向和非靶向基因組改變。我們先進(jìn)的分析技術(shù)與強(qiáng)大的內(nèi)部生物信息學(xué)體系相結(jié)合,可靠地量化了預(yù)期的靶向整合與非預(yù)期結(jié)果(如易位和INDEL)之間的比率。
誘導(dǎo)多能干細(xì)胞來源的細(xì)胞產(chǎn)品。誘導(dǎo)多能干細(xì)胞(inducedpluripotentstemcell,iPS)自身具有致瘤性風(fēng)險(xiǎn),在體內(nèi)可形成畸胎瘤,整合病毒載體的使用和誘導(dǎo)多能性可能增加iPS細(xì)胞插入致突變性和致性的風(fēng)險(xiǎn)。因此,應(yīng)在shou次臨床試驗(yàn)前完成致瘤性試驗(yàn)。若設(shè)計(jì)科學(xué)合理,能夠滿足評價(jià)要求,也可在持續(xù)時(shí)間足夠長的毒性研究中評估致瘤性風(fēng)險(xiǎn)。體內(nèi)致瘤性試驗(yàn)建議采用摻入未分化iPS細(xì)胞的細(xì)胞產(chǎn)品作為陽性對照,以確認(rèn)實(shí)驗(yàn)系統(tǒng)的靈敏度。如果iPS細(xì)胞設(shè)計(jì)了機(jī)制以降低致瘤風(fēng)險(xiǎn),應(yīng)在體內(nèi)試驗(yàn)中確認(rèn)/驗(yàn)證此類機(jī)制的功能 種子基因脫靶檢測機(jī)構(gòu)推薦唯可。
細(xì)胞外檢測方法:細(xì)胞外檢測方法較為直接,將基因組提純后進(jìn)行CRISPR體外切割實(shí)驗(yàn),再捕獲發(fā)生脫靶切割的位點(diǎn)即可。1) Digenome-seqDigenome-seq是較早提出的一類細(xì)胞外脫靶位點(diǎn)檢測方法,提純的基因組DNA被Cas9/sgRNA切割后,再經(jīng)過標(biāo)準(zhǔn)的全基因組測序流程獲得測序數(shù)據(jù),之后需要較為復(fù)雜的生物信息學(xué)分析才能夠獲得CRISPR切割位點(diǎn)的信息。總體來講,這種方法測序成本較高,并且檢測靈敏度也有限。2)SITE-seq為了有效檢測到低頻脫靶位點(diǎn),一般需要在建庫時(shí)定向捕獲CRISPR切割位點(diǎn)。SITE-seq就是這樣一種測序方法,提純的基因組DNA經(jīng)過Cas9/sgRNA切割后,在切割位點(diǎn)末端連接帶Biotin的接頭;再隨機(jī)打斷基因組,在另一端連接第二個(gè)接頭;經(jīng)過鏈霉親和素磁珠純化,只有一輪被Cas9切割的DNA才能夠被純化并測序,實(shí)現(xiàn)了CRISPR切割位點(diǎn)的富集。該方法雖然提高了脫靶位點(diǎn)的檢測靈敏度,但有著較高的實(shí)驗(yàn)要求,每次需要投入大量的基因組DNA,并且無法區(qū)分提純基因組DNA時(shí)發(fā)生的隨機(jī)斷裂和Cas9的切割,導(dǎo)致產(chǎn)出較為明顯的背景信號。同時(shí),由于一輪Biotin接頭只會接在Cas9切割位點(diǎn)的一側(cè),導(dǎo)致測序結(jié)果里只能看到脫靶位點(diǎn)一側(cè)的序列。脫靶(off-target)效應(yīng)是指MicroRNA Agomir/Antagomir可以與特異性互補(bǔ)的核苷酸序列結(jié)合。江蘇定量脫靶檢測企業(yè)
脫靶檢測評估標(biāo)準(zhǔn),推薦唯可生物,實(shí)驗(yàn)實(shí)力強(qiáng),專業(yè)性高,檢測效率高,結(jié)果準(zhǔn)確率高。廣州crispr/cas9脫靶檢測報(bào)告
脫落與傳播。對于部分有g(shù)anran或復(fù)制能力的基因zhiliao產(chǎn)品,從受試者者體內(nèi)排出或脫落到自然環(huán)境后,可能會傳播給受試者的密切接觸者,包括患者親屬和醫(yī)護(hù)人員等,進(jìn)而產(chǎn)生病毒傳播或ganran風(fēng)險(xiǎn)。其他考慮因素。除產(chǎn)品相關(guān)因素外,基因zhiliao產(chǎn)品的長期風(fēng)險(xiǎn)評估還應(yīng)考慮靶細(xì)胞/組織/qiguan,患者群體(年齡、免疫狀態(tài)、死亡風(fēng)險(xiǎn)等)和相關(guān)疾病的特征以及合并其他zhiliao的影響。如果基因zhiliao產(chǎn)品可在生殖腺、生殖細(xì)胞等組織qiguan中分布并發(fā)揮作用,可能對受試者或其配偶的生育能力、妊娠以及胎兒產(chǎn)生難以預(yù)測的遲發(fā)性影響。廣州crispr/cas9脫靶檢測報(bào)告