瓊脂平板篩選法,對突變體間差異可視化較弱,適用于突變庫的初步篩選,篩選后的突變體仍需要其他檢測方法如微孔板法進(jìn)行準(zhǔn)確定量。數(shù)字影像分光光度計(jì)在瓊脂平板篩選方法中的應(yīng)用使瓊脂平板法的靈敏度提高且通量達(dá)到10^5克隆/d,若可根據(jù)目標(biāo)酶或代謝產(chǎn)物的特性建立瓊脂平板篩選方法,則無需使用依賴復(fù)雜儀器設(shè)備的超高通量篩選法。平板篩選法是微生物在平板固體培養(yǎng)基上進(jìn)行生殖反應(yīng),從而反應(yīng)出來的性狀。微孔板篩選方法微孔板篩選方法通過檢測微孔板中底物或目標(biāo)產(chǎn)物所引起的吸光度或熒光變化對其進(jìn)行定量分析,可以保證篩選的精確性和靈敏度,是目前常用的篩選方法。根據(jù)熒光或吸光度精確檢測目標(biāo)產(chǎn)物的微孔板(Microtiterplate,MTP)篩選方法應(yīng)運(yùn)而生,并已廣泛應(yīng)用于酶和細(xì)胞工廠的定向改造中。但微孔板篩選法存在通量低、操作耗時(shí)等缺點(diǎn)。微孔板篩選法,可以理解成非常小的搖瓶,是微生物在液體環(huán)境中反應(yīng)出來的性狀。細(xì)胞水平高通量篩選。湖南流式細(xì)胞高通量篩選
高通量篩選的實(shí)驗(yàn)方法分子水平和細(xì)胞水平的實(shí)驗(yàn)方法(或稱篩選模型)是實(shí)現(xiàn)藥物高通量篩選的技術(shù)基礎(chǔ)。由于藥物高通量篩選要求同時(shí)處理大量樣品,實(shí)驗(yàn)體系必須微量化,而這些微量化的實(shí)驗(yàn)方法應(yīng)根據(jù)新的科研成果來建立。第四軍醫(yī)大學(xué)周四元研究認(rèn)為,藥物高通量篩選模型的實(shí)驗(yàn)方法,根據(jù)其生物學(xué)特點(diǎn),可分為以下幾類:受體結(jié)合分析法;酶活性測定法;細(xì)胞分子測定法;細(xì)胞活性測定法;代謝物質(zhì)測定法;基因產(chǎn)物測定法。這些實(shí)驗(yàn)方法,均已用于藥物高通量篩選中。充分利用藥用資源 由于高通量篩選依賴數(shù)量龐大的樣品庫,實(shí)現(xiàn)了藥物篩選的規(guī)模化,較大限度地利用了藥用物質(zhì)資源,提高了藥物發(fā)現(xiàn)的幾率,同時(shí)提高了發(fā)現(xiàn)新藥的質(zhì)量。湖南流式細(xì)胞高通量篩選通過高通量篩選得到的藥物。
基于細(xì)胞水平的篩選的關(guān)鍵特征之一是可以一次篩選多個(gè)靶標(biāo)?;诩?xì)胞的篩選常用于以下情況下:1)所需的分子靶標(biāo)未知,2)靶標(biāo)無法在生化測定中充分重組,3)所需的表型只存在于細(xì)胞環(huán)境中,例如從一種細(xì)胞類型分化到另一種細(xì)胞類型。基于細(xì)胞的檢測貫穿于藥物發(fā)現(xiàn)的所有階段:靶標(biāo)選擇和驗(yàn)證、初步篩選、先導(dǎo)化合物識別、先導(dǎo)化合物優(yōu)化以及安全和毒理學(xué)篩選。介紹一些細(xì)胞水平分析的方法:細(xì)胞活力、報(bào)告基因、第二信使和高內(nèi)涵成像等。
高通量篩選的實(shí)驗(yàn)方法分子水平和細(xì)胞水平的實(shí)驗(yàn)方法(或稱篩選模型)是實(shí)現(xiàn)藥物高通量篩選的技術(shù)基礎(chǔ)。由于藥物高通量篩選要求同時(shí)處理大量樣品,實(shí)驗(yàn)體系必須微量化,而這些微量化的實(shí)驗(yàn)方法應(yīng)根據(jù)新的科研成果來建立。第四軍醫(yī)大學(xué)周四元研究認(rèn)為,藥物高通量篩選模型的實(shí)驗(yàn)方法,根據(jù)其生物學(xué)特點(diǎn),可分為以下幾類:受體結(jié)合分析法;酶活性測定法;細(xì)胞分子測定法;細(xì)胞活性測定法;代謝物質(zhì)測定法;基因產(chǎn)物測定法。這些實(shí)驗(yàn)方法,均已用于藥物高通量篩選中。高通量篩選菌種技術(shù)。
在報(bào)告基因檢測(也稱為信號通路檢測)中,報(bào)告蛋白的序列編碼是在相關(guān)通路的轉(zhuǎn)錄控制下引入的。通過熒光或光學(xué)讀數(shù)監(jiān)測報(bào)告基因的表達(dá),通過這些指標(biāo)來間接反應(yīng)啟動(dòng)子的或抑制程度。觀察到的信號是整個(gè)通路的產(chǎn)物,篩選的化合物可以在該通路上的任何點(diǎn)相互作用。常見的報(bào)告基因是CAT(氯霉素乙酰轉(zhuǎn)移酶)、GAL(β-半乳糖苷酶)、LAC(β-內(nèi)酰胺酶)、LUC(熒光素酶)和GFP。我們通常使用的為LUC(熒光素酶),但也可以使用其他報(bào)告基因。高通量篩選方法有哪些。湖南流式細(xì)胞高通量篩選
藥物高通量篩選系統(tǒng)。湖南流式細(xì)胞高通量篩選
正如之前提到,在高通量篩選中Assay的檢出方法有很多,用于衡量酶活性多的當(dāng)屬于熒光檢出法和吸光度檢出法。這兩種方法都能非常便捷的與高通量進(jìn)行匹配。但是這兩種檢出方法也有不適用的場景,比如吸光度檢出法,在終點(diǎn)法測定(endpointassay)時(shí),如果化合物庫的吸收低于~410nm,實(shí)驗(yàn)的背景吸收會引入假陽性(false-positive)和假陰性(false-negative)結(jié)果。雖然假陽性結(jié)果可以通過動(dòng)力學(xué)Assay或者驗(yàn)證Assay來解決,但是由于微量定量板有位于340~410nm的強(qiáng)吸收,所以仍舊會導(dǎo)致Z因子降低,直接結(jié)果就是較弱活性的苗頭化合物將很難被篩選出來。而對于熒光檢出法而言,自發(fā)熒光化合物庫或者具有光敏特性的化合物庫同樣會遇到假陽性和假陰性結(jié)果。在某種程度上,選擇合適的檢出方法可以減少甚至避免上述問題,比如使用更長波段的光源,對于熒光檢出來說,>500nm會是比較好的選擇。湖南流式細(xì)胞高通量篩選