5'DNA腺苷?;噭┖型ㄟ^特定的酶催化反應(yīng),將5'-磷酸化的單鏈DNA(pDNA)轉(zhuǎn)化為5'-腺苷?;疍NA(AppDNA)。以下是啟用5'-磷酸化的單鏈DNA的一般步驟:1.**準(zhǔn)備反應(yīng)體系**:-根據(jù)試劑盒說明書,準(zhǔn)備所需的反應(yīng)組分,包括5'-磷酸化的單鏈DNA、腺苷酰化酶(如Adenylase或MthRNA連接酶)、ATP和相應(yīng)的緩沖液。2.**混合組分**:-將5'-磷酸化的單鏈DNA與腺苷酰化酶、ATP和緩沖液混合在適當(dāng)?shù)姆磻?yīng)容器中。3.**孵育反應(yīng)**:-將混合好的反應(yīng)體系在指定的溫度(通常是65℃)下孵育一定的時(shí)間,以允許酶將ATP中的AMP部分轉(zhuǎn)移到DNA的5'端。4.**酶失活**:-反應(yīng)完成后,在85℃孵育5分鐘以失活腺苷?;?,這一步是為了防止后續(xù)的去腺苷酰化現(xiàn)象,確保腺苷酰化比率不下降。5.**產(chǎn)物收集**:-由于轉(zhuǎn)化效率高,通常不需要進(jìn)行凝膠純化步驟??梢酝ㄟ^乙醇沉淀等方法收集腺苷?;蟮腄NA產(chǎn)物。6.**產(chǎn)物應(yīng)用**:-收集的腺苷?;疍NA可以直接用于后續(xù)的克隆、測序、連接或其他分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)。7.**注意事項(xiàng)**:-確保所有操作在無RNA酶和無DNA酶的環(huán)境中進(jìn)行,以避免污染。-使用時(shí)需注意反應(yīng)體系的準(zhǔn)確性,確保底物、酶和ATP的比例適當(dāng)。
DNA瓊脂糖凝膠電泳是一種常用的分子生物學(xué)技術(shù),用于分離、鑒定和定量DNA片段。以下是關(guān)于DNA瓊脂糖凝膠電泳的一些關(guān)鍵點(diǎn):1.**原理**:-利用瓊脂糖凝膠作為介質(zhì),DNA片段在電場作用下根據(jù)其大小和電荷差異進(jìn)行分離。較小的DNA片段遷移速度快,而較大的片段遷移速度慢。2.**瓊脂糖**:-一種由瓊脂糖粉末和緩沖液(如TAE或TBE)混合制成的凝膠。瓊脂糖濃度通常在0.7%到2%之間,濃度越高,分辨率越高,但凝膠孔隙越小,遷移速度越慢。3.**樣品準(zhǔn)備**:-DNA樣品通常需要在加載前進(jìn)行適當(dāng)?shù)奶幚?,如純化、稀釋,有時(shí)還需添加樣品緩沖液以保證樣品在電泳過程中的穩(wěn)定性。4.**加載樣品**:-使用微量移液管將樣品和加載緩沖液(通常含有追蹤染料,如溴酚藍(lán))混合后,小心地加載到凝膠孔中。5.**電泳**:-將凝膠置于電泳槽中,連接電源,施加恒定電壓進(jìn)行電泳。電壓和時(shí)間根據(jù)凝膠濃度和所需分辨率進(jìn)行調(diào)整。6.**染色**:-電泳完成后,為了可視化DNA條帶,通常使用熒光染料如EB(溴化乙錠)或SYBRGreen進(jìn)行染色。染色后的凝膠在紫外光下觀察,DNA條帶會發(fā)出熒光。7.**分析**:-通過比較DNA條帶的位置和已知大小的DNA標(biāo)準(zhǔn)品(DNAladder),可以估計(jì)DNA片段的大小。
pA-Tn5轉(zhuǎn)座酶是一種經(jīng)過改造的高活性Tn5轉(zhuǎn)座酶,與ProteinA融合,形成一種新型融合酶,應(yīng)用于CUT&Tag技術(shù)中,用于研究蛋白質(zhì)與基因組DNA的相互作用。這種融合酶具備以下特點(diǎn):1.**高活性**:pA-Tn5轉(zhuǎn)座酶是超高活性的突變形式,體外轉(zhuǎn)座效率比野生型高1000倍。2.**ProteinA融合**:pA-Tn5轉(zhuǎn)座酶的N端結(jié)構(gòu)域?yàn)镻roteinA的一部分,可以與免疫球蛋白的Fc區(qū)相互作用,特別是與大多數(shù)哺乳動(dòng)物的IgG結(jié)合。3.**Tn5轉(zhuǎn)座酶活性**:C端結(jié)構(gòu)域?yàn)門n5轉(zhuǎn)座酶,能夠特異性識別轉(zhuǎn)座子兩端反向重復(fù)的ME序列(MosaicEnd),并在形成轉(zhuǎn)座復(fù)合體后隨機(jī)插入靶DNA中。4.**應(yīng)用廣**:適用于CUT&Tag技術(shù)、高通量測序建庫、ATAC-seq等,特別適用于早期胚胎發(fā)育、干細(xì)胞、以及表觀遺傳學(xué)等研究領(lǐng)域。5.**操作簡便**:pA-Tn5轉(zhuǎn)座酶的使用簡化了實(shí)驗(yàn)步驟,可以在一步反應(yīng)中實(shí)現(xiàn)DNA片段化和接頭連接,從細(xì)胞到二代測序文庫的轉(zhuǎn)化過程需9小時(shí)。6.**低細(xì)胞投入量**:CUT&Tag技術(shù)允許從低至60個(gè)細(xì)胞的樣本中獲得結(jié)果,甚至可以應(yīng)用于單細(xì)胞水平的研究。7.**高質(zhì)量結(jié)果**:pA-Tn5轉(zhuǎn)座酶的使用可以保證DNA片段化,同時(shí)獲得的蛋白純度高、核酸殘留低。
PCR抑制劑是指那些在PCR反應(yīng)中能夠干擾或阻礙DNA擴(kuò)增的物質(zhì)。這些物質(zhì)通常來源于生物樣本本身或者樣本的收集和處理過程。以下是一些PCR抑制劑的特點(diǎn):1.**多樣性**:PCR抑制劑可以是多種不同的化合物,包括膽酸鹽、尿素、血紅素、酚類化合物、蛋白質(zhì)、多糖、植物或血液成分等。2.**來源**:它們可能來自血液(如血紅素)、尿液(如尿素)、糞便(如膽酸鹽)、植物(如多酚和多糖)、土壤(如腐殖酸)或化學(xué)物質(zhì)(如酚類化合物)。3.**影響**:抑制劑可以影響DNA聚合酶的活性,干擾引物的退火,或與DNA模板發(fā)生非特異性結(jié)合,導(dǎo)致PCR擴(kuò)增效率降低或特異性下降。4.**復(fù)雜性**:由于樣本來源的復(fù)雜性,不同的抑制劑可能需要不同的策略來克服。某些抑制劑可能通過物理方法(如離心、過濾)去除,而其他抑制劑可能需要化學(xué)處理或使用特定的PCR增強(qiáng)劑。5.**濃度依賴性**:抑制效果通常與抑制劑的濃度有關(guān)。在較低濃度下,某些抑制劑可能不會影響PCR,但隨著濃度增加,抑制效果會變得更加明顯。6.**特異性**:某些抑制劑可能對特定的DNA聚合酶或PCR體系有特定的影響。例如,一些抑制劑可能特別影響高GC含量的模板擴(kuò)增。在藥物篩選中,全長CB1受體可用于高通量篩選實(shí)驗(yàn),以發(fā)現(xiàn)和優(yōu)化潛在的藥物候選物。
dCTPSolution(脫氧胞苷三磷酸溶液)是一種分子生物學(xué)試劑,它是進(jìn)行DNA合成反應(yīng)的關(guān)鍵成分之一。dCTP與dATP、dGTP和dTTP一起,構(gòu)成DNA聚合過程中所需的四種脫氧核苷三磷酸(dNTPs)。每種dNTP對應(yīng)DNA中的一個(gè)堿基:腺嘌呤(A)、胞嘧啶(C)、鳥嘌呤(G)和胸腺嘧啶(T)。dCTP的化學(xué)名稱是2'-脫氧胞苷-5'-三磷酸,它在DNA合成中起到以下作用:-**DNA合成**:在聚合酶鏈反應(yīng)(PCR)和其他DNA合成過程中,dCTP作為底物,由DNA聚合酶催化,與DNA模板鏈上的鳥嘌呤(G)配對,形成新的DNA鏈。-**DNA測序**:在某些DNA測序方法中,dCTP可能用于標(biāo)記或合成測序產(chǎn)物。-**分子克隆和其他技術(shù)**:dCTP在分子克隆、基因表達(dá)分析和其他涉及DNA合成的實(shí)驗(yàn)中也有應(yīng)用。dCTPSolution通常以高濃度(如100mM)的溶液形式提供,以便于在實(shí)驗(yàn)中使用時(shí)進(jìn)行稀釋。這種溶液需要在低溫(通常是-20°C)條件下儲存,以保持其穩(wěn)定性和避免分解。在購買和使用dCTPSolution時(shí),用戶應(yīng)確保產(chǎn)品具有高純度、無PCR抑制劑、無核酸酶污染等特性,以保證實(shí)驗(yàn)的準(zhǔn)確性和重復(fù)性。此外,dCTPSolution應(yīng)用于研究用途,不應(yīng)用于臨床診斷過程。FnCas12a不僅可用于體外dsDNA的特異剪切,也可用于靶標(biāo)核酸的快速檢測,如HOLMES核酸快檢技術(shù)。Recombinant Protein A/G(Freeze-Dried)重組蛋白A/G (凍干)
在某些疾病中,特定蛋白質(zhì)的泛素化水平可能發(fā)生變化,因此,泛素化蛋白質(zhì)可以作為疾病的生物標(biāo)志物。Recombinant Mouse EGF Protein
5'DNA腺苷酰化試劑盒中使用的酶通常被稱為腺苷酰化酶(Adenylase),這種酶能夠催化5'端磷酸化的單鏈DNA或RNA(pDNA或pRNA)轉(zhuǎn)換成5'端腺苷?;疍NA或RNA(AppDNA或AppRNA)。根據(jù)搜索結(jié)果,該酶的來源是嗜熱古細(xì)菌,在大腸桿菌中進(jìn)行表達(dá)并純化而獲得。這種酶在反應(yīng)中將ATP分解成AMP和PPi,然后將AMP轉(zhuǎn)移到單鏈DNA的5'磷酸基團(tuán)上,形成腺苷?;瘑捂淒NA,從而制備出腺苷?;宇^(linker)。此外,一些5'DNA腺苷?;噭┖兄惺褂玫拿甘荕thRNA連接酶(例如NEB#M2611A),這種酶也用于生成高產(chǎn)量的5'腺苷?;疍NA,并且操作簡便,具有超過95%的效率,無需凝膠純化即可完成單步反應(yīng)。MthRNA連接酶是一種已知能夠在65℃下有效工作的酶,有助于避免DNA的二級結(jié)構(gòu)對腺苷?;磻?yīng)的干擾。這些酶的高效率和特異性使得5'DNA腺苷?;噭┖性趩捂淒NA的5'端腺苷?;揎椫蟹浅S行?,常用于miRNA等3'端為羥基的RNA或單鏈DNA在克隆、高通量測序建庫或PCR檢測等應(yīng)用中。Recombinant Mouse EGF Protein