pA-Tn5轉(zhuǎn)座酶是通過將ProteinA與Tn5轉(zhuǎn)座酶進(jìn)行融合來構(gòu)建的。ProteinA是一種來源于金黃色葡萄球菌的蛋白質(zhì),它具有高親和力結(jié)合大多數(shù)哺乳動物IgG抗體的Fc片段的能力。Tn5轉(zhuǎn)座酶是一種能夠識別特定DNA序列并在基因組上進(jìn)行“剪切-粘貼”或“復(fù)制-粘貼”的酶。融合ProteinA的目的是為了在實驗中實現(xiàn)對特定蛋白質(zhì)的靶向。下面是pA-Tn5轉(zhuǎn)座酶融合的一般步驟:1.**基因克隆**:首先,將Tn5轉(zhuǎn)座酶的基因和ProteinA的基因克隆到一個表達(dá)載體中。這通常涉及到分子克隆技術(shù),如PCR擴(kuò)增、限制性內(nèi)切酶消化和連接酶連接。2.**融合蛋白設(shè)計**:設(shè)計一個融合蛋白,其中ProteinA的基因序列和Tn5轉(zhuǎn)座酶的基因序列通過一個短的連接肽(LinkerPeptide)相連。這個連接肽通常包含幾個氨基酸殘基,以確保兩個蛋白部分在融合后仍能保持各自的構(gòu)象和功能。3.**表達(dá)載體構(gòu)建**:將融合基因插入到適合的表達(dá)載體中,這個載體應(yīng)該包含適當(dāng)?shù)膯幼?、?biāo)記基因(如抗性基因)和終止子,以確保融合蛋白在宿主細(xì)胞中得到高效表達(dá)。4.**宿主細(xì)胞表達(dá)**:將構(gòu)建好的表達(dá)載體轉(zhuǎn)化到宿主細(xì)胞(如大腸桿菌)中,通過誘導(dǎo)表達(dá)融合蛋白。牛痘DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶I的反應(yīng)溫度為37°C。在這個溫度下,酶的活性高,能夠有效地進(jìn)行DNA的切割和連接。Recombinant Human IL-25/IL-17E Protein,His Tag
pA-Tn5轉(zhuǎn)座酶的產(chǎn)品組分通常包括以下幾個部分:1.**pA-Tn5轉(zhuǎn)座酶蛋白**:一種高活性的Tn5轉(zhuǎn)座酶突變體與ProteinA的融合蛋白,它是產(chǎn)品的主要組分,用于實現(xiàn)DNA片段化和接頭連接的功能。2.**儲存溶液**:碧云天的BeyoNGS?pA-Tn5轉(zhuǎn)座酶產(chǎn)品含有特定的儲存溶液,其組成為50mMHEPES(pH7.2),100mMNaCl,0.1mMEDTA,1mMDTT,0.1%TritonX-100,50%(v/v)Glycerol,這種溶液有助于保持酶的穩(wěn)定性和活性。3.**測序接頭(Adapters)**:用于與pA-Tn5轉(zhuǎn)座酶組裝形成pA-Tn5轉(zhuǎn)座體(pA-Tn5Transposome),這是進(jìn)行CUT&Tag實驗的必需組分。4.**反應(yīng)緩沖液**:部分產(chǎn)品包含用于轉(zhuǎn)座酶反應(yīng)的緩沖液,例如5×TagmentBuffer,這種緩沖液含有Mg2+,對轉(zhuǎn)座酶的活性至關(guān)重要。5.**附件**:某些產(chǎn)品可能還包括附件,如說明書,提供產(chǎn)品使用和保存的詳細(xì)信息。6.**其他組分**:根據(jù)產(chǎn)品的不同,可能還包括CouplingBuffer、AnnealingBuffer等其他輔助組分,這些組分有助于轉(zhuǎn)座酶與DNA的結(jié)合和反應(yīng)的進(jìn)行。7.**包裝規(guī)格**:pA-Tn5轉(zhuǎn)座酶的包裝規(guī)格可能有所不同,例如碧云天提供的BeyoNGS?pA-Tn5轉(zhuǎn)座酶有800pmol和4000pmol兩種包裝規(guī)格。TAT 2-4利用牛痘DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶I的連接原理,可以在無需DNA連接酶的情況下,快速高效地連接DNA片段,實現(xiàn)克隆。
重組酶聚合酶擴(kuò)增技術(shù)(RecombinasePolymeraseAmplification,簡稱RPA)是一種核酸擴(kuò)增技術(shù),能夠在等溫條件下快速檢測特定DNA序列。這項技術(shù)以其快速、靈敏度高、特異性強、對設(shè)備要求低等優(yōu)點,在臨床快速診斷、食品檢測、防控、工業(yè)應(yīng)用、現(xiàn)場實時檢測等領(lǐng)域具有廣泛的應(yīng)用潛力。**技術(shù)原理**:RPA技術(shù)主要依賴于幾種關(guān)鍵的酶和蛋白質(zhì):-**重組酶**:能夠識別并結(jié)合到單鏈核酸(寡核苷酸引物)上。-**單鏈DNA結(jié)合蛋白(SSB)**:與被置換的單鏈DNA結(jié)合,防止其重新結(jié)合形成雙鏈。-**鏈置換DNA聚合酶**:在引物定位同源序列后,進(jìn)行鏈延伸,實現(xiàn)DNA的指數(shù)增長。RPA的工作原理是,重組酶與引物結(jié)合形成的蛋白-DNA復(fù)合物能在雙鏈DNA中尋找同源序列。一旦引物定位了同源序列,就會發(fā)生鏈交換反應(yīng)形成并啟動DNA合成,對模板上的目標(biāo)區(qū)域進(jìn)行指數(shù)式擴(kuò)增。整個過程進(jìn)行得非??欤话憧稍谑昼娭畠?nèi)獲得可檢出水平的擴(kuò)增產(chǎn)物。**技術(shù)優(yōu)勢**:-**快速性**:RPA可以在37-42°C的等溫條件下快速完成核酸的擴(kuò)增,通常在10到30分鐘內(nèi)即可完成。-**靈敏度和特異性**:RPA能夠檢測低至單拷貝的核酸模板,并具有高特異性。
5'DNA腺苷酰化試劑盒中使用的酶通常被稱為腺苷?;?Adenylase),這種酶能夠催化5'端磷酸化的單鏈DNA或RNA(pDNA或pRNA)轉(zhuǎn)換成5'端腺苷?;疍NA或RNA(AppDNA或AppRNA)。根據(jù)搜索結(jié)果,該酶的來源是嗜熱古細(xì)菌,在大腸桿菌中進(jìn)行表達(dá)并純化而獲得。這種酶在反應(yīng)中將ATP分解成AMP和PPi,然后將AMP轉(zhuǎn)移到單鏈DNA的5'磷酸基團(tuán)上,形成腺苷酰化單鏈DNA,從而制備出腺苷酰化接頭(linker)。此外,一些5'DNA腺苷?;噭┖兄惺褂玫拿甘荕thRNA連接酶(例如NEB#M2611A),這種酶也用于生成高產(chǎn)量的5'腺苷?;疍NA,并且操作簡便,具有超過95%的效率,無需凝膠純化即可完成單步反應(yīng)。MthRNA連接酶是一種已知能夠在65℃下有效工作的酶,有助于避免DNA的二級結(jié)構(gòu)對腺苷?;磻?yīng)的干擾。這些酶的高效率和特異性使得5'DNA腺苷?;噭┖性趩捂淒NA的5'端腺苷酰化修飾中非常有效,常用于miRNA等3'端為羥基的RNA或單鏈DNA在克隆、高通量測序建庫或PCR檢測等應(yīng)用中。在基因編輯過程中,Pfu DNA Polymerase 可用于合成高質(zhì)量的單鏈或雙鏈DNA修復(fù)模板。
磁珠本身并不直接參與電泳過程,但它們可以用于電泳后的樣品處理,特別是在核酸(DNA或RNA)的提取和純化過程中。以下是使用磁珠進(jìn)行電泳后樣品處理的一般步驟:1.**凝膠電泳**:-首先,將DNA或RNA樣品通過凝膠電泳進(jìn)行分離。凝膠通常是瓊脂糖或聚丙烯酰胺凝膠,根據(jù)樣品的大小和類型選擇合適的凝膠濃度和緩沖體系。2.**觀察和切割**:-電泳完成后,使用紫外線照射凝膠并使用適當(dāng)?shù)娜玖希ㄈ鏓B或SYBRGreen)對DNA或RNA進(jìn)行染色,以在紫外光下觀察到DNA或RNA的條帶。3.**樣品提取**:-確定目標(biāo)DNA或RNA條帶后,使用干凈的工具(如切割器或移液槍)從凝膠中切割出含有目標(biāo)分子的凝膠片段。4.**磁珠準(zhǔn)備**:-根據(jù)磁珠試劑盒的說明書,準(zhǔn)備磁珠。通常包括磁珠的重懸和可能的表面修飾,以確保它們能夠特異性地結(jié)合目標(biāo)核酸。5.**樣品與磁珠混合**:-將切割出的凝膠片段轉(zhuǎn)移到含有磁珠的溶液中,溫和地混合以促進(jìn)磁珠與核酸的結(jié)合。6.**磁分離**:-將含有磁珠和核酸的混合物置于磁分離架上,利用磁場使磁珠快速聚集在管底,從而實現(xiàn)與溶液的分離。7.**洗滌**:-移除未結(jié)合的溶液,向磁珠上加入洗滌液,再次進(jìn)行磁分離以去除雜質(zhì)。GPRC5D蛋白在宿主細(xì)胞內(nèi)通過自組裝形成VLP。這一步驟通常在細(xì)胞內(nèi)發(fā)生,以提高VLP的產(chǎn)量和質(zhì)量。Recombinant Biotinylated Human CXCL4 Protein,His-Avi Tag
可以利用現(xiàn)有的計算工具,如CRISPR design tools,預(yù)測gRNA的活性和特異性,以輔助實驗設(shè)計 。Recombinant Human IL-25/IL-17E Protein,His Tag
1stStrandcDNASynthesisKit(RNaseH-)通常提供幾種不同類型的引物用于啟動cDNA的合成。這些引物包括:1.**Oligo(dT)引物**:這種引物通常與mRNA的poly(A)尾部互補配對,適用于從真核生物的mRNA中合成cDNA。它能夠產(chǎn)生大量全長cDNA,特別是當(dāng)模板來源于真核生物時。2.**隨機六聚體引物(RandomHexamers)**:這些引物是一組隨機的六核苷酸序列,可以與RNA模板的任何部分結(jié)合,從而啟動cDNA的合成。它們適用于mRNA、rRNA、tRNA和長非編碼RNA等多種類型的RNA模板。3.**基因特異性引物(GeneSpecificPrimers)**:這些引物是針對特定基因序列設(shè)計的,可以用于從總RNA或mRNA中合成特定基因的cDNA。它們通常用于當(dāng)需要選擇性地擴(kuò)增特定基因或基因家族時。在選擇引物時,需要考慮RNA模板的來源、RNA的質(zhì)量和特性以及后續(xù)實驗的需求。例如,如果RNA模板具有復(fù)雜的二級結(jié)構(gòu)或較高的GC含量,可能需要使用隨機引物以提高cDNA合成的效率。另外,如果后續(xù)實驗是qPCR,可以將Oligo(dT)與隨機引物混合使用,以提高qPCR結(jié)果的真實性和重復(fù)性。Recombinant Human IL-25/IL-17E Protein,His Tag