除了CRISPR-Cas9技術(shù),還有其他幾種基因編輯技術(shù)可以用于金黃色葡萄球菌的研究:1.**單堿基編輯技術(shù)**:這是一種新型的基因編輯技術(shù),可以在不切割DNA雙鏈的情況下實(shí)現(xiàn)基因的定點(diǎn)突變。季泉江教授課題組與中國(guó)科學(xué)院北京基因組所韓大力研究員課題組合作,在金黃色葡萄球菌中建立了單堿基編輯技術(shù),通過融合失活的Cas9蛋白(Cas9D10A)和胞嘧啶脫氨酶(APOBEC1),實(shí)現(xiàn)了高效單堿基編輯,有助于研究耐藥機(jī)制和開發(fā)新型手段。2.**同源重組(HR)修復(fù)技術(shù)**:在某些細(xì)菌中,可以通過同源重組機(jī)制對(duì)CRISPR-Cas9系統(tǒng)產(chǎn)生的雙鏈DNA斷裂進(jìn)行修復(fù),實(shí)現(xiàn)基因的精確編輯。例如,在谷氨酸棒桿菌中,利用CRISPR/Cas9技術(shù)結(jié)合同源重組修復(fù)模板,實(shí)現(xiàn)了高效的基因缺失和點(diǎn)突變。3.**非同源末端連接(NHEJ)相關(guān)蛋白共表達(dá)**:通過共表達(dá)Cas9蛋白和NHEJ相關(guān)蛋白,如連接酶LigD,可以在鏈霉菌中實(shí)現(xiàn)有效的基因組編輯,這種方法不依賴于同源重組,可以應(yīng)用于那些同源重組效率較低的細(xì)菌。4.**CRISPR干擾技術(shù)(CRISPRi)**:利用失活的Cas9蛋白(dCas9)阻斷基因的轉(zhuǎn)錄,從而抑制特定基因的表達(dá)。這種技術(shù)可以用于研究基因功能和調(diào)控基因表達(dá),已經(jīng)在多種細(xì)菌中得到應(yīng)用。有研究者反映pCas/pTargetF在某些大腸桿菌菌株如BL21(DE3)中編輯不理想,體現(xiàn)為無法獲得轉(zhuǎn)化子。上海酶定向進(jìn)化技術(shù)服務(wù)開發(fā)
除了His標(biāo)簽和GST標(biāo)簽,還有多種融合伴侶技術(shù)可以用于提高蛋白的表達(dá)和純度,包括但不限于以下幾種:1.**Flag標(biāo)簽**:Flag是一個(gè)八肽序列(DYKDDDDK),可以通過抗Flag標(biāo)簽的抗體進(jìn)行免疫沉淀或西方印跡分析,有助于提高蛋白的純度。2.**Fc融合蛋白**:Fc標(biāo)簽是免疫球蛋白的恒定區(qū),可以提高蛋白在哺乳動(dòng)物細(xì)胞中的溶解性和穩(wěn)定性,并且可以通過蛋白A親和層析進(jìn)行純化。3.**人血清白蛋白(HSA)**:HSA作為融合伴侶可以提高蛋白的溶解性和穩(wěn)定性,延長(zhǎng)半衰期,并通過其固有的結(jié)合特性進(jìn)行純化。4.**轉(zhuǎn)鐵蛋白**:轉(zhuǎn)鐵蛋白可以作為融合伴侶,利用其與鐵的高親和力進(jìn)行純化,并且有助于提高蛋白的穩(wěn)定性。5.**XTEN聚合物**:XTEN是一種柔性的多肽聚合物,可以提高蛋白的溶解性和穩(wěn)定性,有助于防止聚集。6.**彈性蛋白樣多肽(ELP)**:ELP具有可逆的熱響應(yīng)性質(zhì),可以通過溫度誘導(dǎo)的相分離進(jìn)行純化,有助于提高純度。7.**Strep標(biāo)簽**:Strep標(biāo)簽是一個(gè)短肽序列,可以通過Strep-Tactin親和層析進(jìn)行高效率的純化。8.**MBP融合蛋白**:麥芽糖結(jié)合蛋白(MBP)可以作為融合伴侶,提高蛋白的溶解性,并通過親和層析進(jìn)行純化。。北京人源膠原蛋白開發(fā)技術(shù)服務(wù)研發(fā)sgRNA質(zhì)粒丟失了,這時(shí)候含有Kan的這一管菌液就可以用于接種制備感受態(tài)細(xì)胞,進(jìn)行下一輪編輯。
重組蛋白表達(dá)服務(wù)是生物技術(shù)領(lǐng)域的一個(gè)重要分支,它涉及到使用各種生物表達(dá)系統(tǒng)來生產(chǎn)特定的重組蛋白,這些蛋白通常用于臨床前研究、藥物開發(fā)、疫苗制備等。以下是重組蛋白表達(dá)服務(wù)在臨床前研究中的一些關(guān)鍵應(yīng)用和技術(shù)要點(diǎn):1.**目標(biāo)蛋白的選擇與設(shè)計(jì)**:-根據(jù)研究目的選擇合適的目標(biāo)蛋白,可能包括蛋白、酶、抗體、病毒抗原等。-設(shè)計(jì)蛋白序列時(shí),可能需要進(jìn)行突變、融合標(biāo)簽或優(yōu)化密碼子以提高表達(dá)效率。2.**表達(dá)系統(tǒng)的選取**:-選擇適合目標(biāo)蛋白的表達(dá)系統(tǒng),如大腸桿菌、酵母、昆蟲細(xì)胞、哺乳動(dòng)物細(xì)胞等,每個(gè)系統(tǒng)都有其特定優(yōu)勢(shì)和局限性。3.**載體構(gòu)建**:-構(gòu)建含有目標(biāo)蛋白基因的表達(dá)載體,選擇合適的啟動(dòng)子、標(biāo)記基因和抗性基因。4.**蛋白表達(dá)與優(yōu)化**:-將構(gòu)建好的載體轉(zhuǎn)化到宿主細(xì)胞中,進(jìn)行蛋白表達(dá)。-通過優(yōu)化誘導(dǎo)條件、培養(yǎng)時(shí)間和溫度等參數(shù)來提高蛋白的表達(dá)量和可溶性。5.**翻譯后修飾**:-根據(jù)蛋白的功能需求,進(jìn)行必要的翻譯后修飾,如磷酸化、糖基化等。6.**蛋白純化**:-使用色譜等技術(shù)對(duì)表達(dá)的蛋白進(jìn)行純化,確保蛋白的純度和活性。7.**功能性驗(yàn)證**:-對(duì)純化后的蛋白進(jìn)行功能性驗(yàn)證,確保其生物學(xué)活性和穩(wěn)定性。
Thioredoxin-NP-27是一種腸激酶的底物,用于檢測(cè)腸激酶的活性。它是由硫氧還蛋白和NP-27融合而成,中間通過腸激酶的酶切位點(diǎn)(DDDDK)連接。這種底物在經(jīng)過腸激酶酶切后,可以通過SDS-PAGE電泳觀察到分子量分別為18kDa和27kDa的兩條帶。腸激酶是一種高度專一性識(shí)別Asp-Asp-Asp-Asp-Lys序列的蛋白酶,它在Lys的C端水解多肽。腸激酶可以將胰蛋白酶原轉(zhuǎn)變?yōu)橐让?,也可以將帶有這個(gè)識(shí)別序列的融合蛋白切開。在37℃,16小時(shí)內(nèi)將0.5mg的反應(yīng)底物Thioredoxin-NP-27切割為NP-27達(dá)95%所需的酶量定義為一個(gè)單位。腸激酶的活性單位定義為在37℃,16小時(shí)內(nèi)將0.5毫克的Thioredoxin-NP-2795%降解為NP-27所需要的酶量。這種酶在基因工程產(chǎn)品開發(fā)中具有廣泛的應(yīng)用,特別是作為工具蛋白酶用于重組融合蛋白質(zhì)的特異性斷裂。Thioredoxin-NP-27產(chǎn)品的優(yōu)勢(shì)在于它符合GB/T41907-2022標(biāo)準(zhǔn),適用于腸激酶活性檢測(cè)的底物。產(chǎn)品保存條件為-30~-15℃,運(yùn)輸條件為≤0℃,以確保其穩(wěn)定性和活性。使用時(shí),應(yīng)按照產(chǎn)品說明進(jìn)行操作,并注意安全防護(hù)措施。我們的服務(wù)內(nèi)容包括:從上游細(xì)胞培養(yǎng)、下游蛋白純化到制劑灌裝、成品包裝等GMP生產(chǎn)服務(wù)。
單堿基編輯技術(shù)在金黃色葡萄球菌研究中的優(yōu)勢(shì)和挑戰(zhàn)如下:**優(yōu)勢(shì)**:1.**高效性**:?jiǎn)螇A基編輯技術(shù)可以在不產(chǎn)生DNA雙鏈斷裂的情況下實(shí)現(xiàn)基因組中單個(gè)堿基的轉(zhuǎn)換,如將C?G轉(zhuǎn)變?yōu)門?A或A?T轉(zhuǎn)變?yōu)镚?C,這使得它在基因編輯中具有較高的效率。2.**精確性**:該技術(shù)通過CRISPR/Cas系統(tǒng)實(shí)現(xiàn)DNA的定位,提高了基因編輯的準(zhǔn)確性,減少了非目標(biāo)效應(yīng),這對(duì)于研究特定基因功能和遺傳性疾病至關(guān)重要。3.**操作簡(jiǎn)便**:?jiǎn)螇A基編輯技術(shù)不需要復(fù)雜的蛋白質(zhì)設(shè)計(jì)或同源重組修復(fù)模板,簡(jiǎn)化了實(shí)驗(yàn)操作流程。**挑戰(zhàn)**:1.**脫靶效應(yīng)**:盡管單堿基編輯技術(shù)具有高特異性,但仍存在一定的脫靶風(fēng)險(xiǎn),需要通過優(yōu)化sgRNA設(shè)計(jì)和篩選策略。2.**編輯窗口限制**:?jiǎn)螇A基編輯技術(shù)的編輯窗口通常較寬,限制了其在某些精細(xì)調(diào)控場(chǎng)合的應(yīng)用,需要進(jìn)一步研究以縮小編輯窗口。3.**技術(shù)優(yōu)化需求**:為了提高單堿基編輯技術(shù)在金黃色葡萄球菌中的效率和應(yīng)用范圍,需要進(jìn)一步對(duì)編輯系統(tǒng)進(jìn)行優(yōu)化,包括提高編輯器的純度和擴(kuò)展靶向范圍。4.**體內(nèi)遞送挑戰(zhàn)**:在實(shí)際應(yīng)用中,如何有效地將單堿基編輯系統(tǒng)遞送到目標(biāo)細(xì)胞或組織,同時(shí)減少免疫原性反應(yīng),是實(shí)現(xiàn)其臨床應(yīng)用的關(guān)鍵挑戰(zhàn)之一。我們的GMP蛋白穩(wěn)定細(xì)胞系開發(fā)服務(wù)涵蓋從細(xì)胞線構(gòu)建到鑒定和驗(yàn)證的全過程,為您提供一站式解決方案。黑龍江重組人源膠原蛋白技術(shù)服務(wù)臨床前研究
利用基因編輯技術(shù)對(duì)粘質(zhì)沙雷氏菌進(jìn)行精細(xì)基因調(diào)控,拓展其應(yīng)用領(lǐng)域。上海酶定向進(jìn)化技術(shù)服務(wù)開發(fā)
漢遜酵母表達(dá)系統(tǒng)是一種新型的酵母菌表達(dá)平臺(tái),它具有高密度培養(yǎng)和高效表達(dá)外源蛋白的能力。在臨床前研究中,漢遜酵母被用于表達(dá)瘤病毒(HPV)病毒樣顆粒(VLPs),這為開發(fā)HPV疫苗提供了一種有希望的策略。HPVB19是一種高度傳染性的病毒,對(duì)免疫功能低下者和胎兒可能造成嚴(yán)重后果。目前,尚無針對(duì)HPVB19的批準(zhǔn)疫苗或抗病毒藥物,因此開發(fā)有效的疫苗顯得尤為重要。漢遜酵母表達(dá)的VLPs,特別是VP1與VP2共組裝的VLP(VP1/VP2VLP),可能成為HPVB19疫苗開發(fā)的候選免疫原。在一項(xiàng)研究中,漢遜酵母成功表達(dá)了HPV68bL1蛋白,并形成了VLPs。這些VLPs在小鼠模型中顯示出良好的免疫原性,能夠誘導(dǎo)產(chǎn)生較高滴度的中和抗體,并且對(duì)HPV68a型也表現(xiàn)出一定的交叉保護(hù)作用。這表明漢遜酵母表達(dá)的HPV68bVLPs可能作為多價(jià)HPV疫苗的組分,用于疫苗生產(chǎn)。漢遜酵母表達(dá)系統(tǒng)還提供了一整套從表達(dá)載體構(gòu)建到產(chǎn)業(yè)化發(fā)酵和蛋白純化的通用技術(shù)平臺(tái),適合不同規(guī)模的企業(yè)使用。在HPV68bL1蛋白的VLPs研究中,通過高密度發(fā)酵和系列純化步驟,獲得了純度超過95%的VLPs,這些VLPs在形態(tài)上與天然病毒顆粒相似,并通過假病毒體外中和試驗(yàn)證明了其免疫學(xué)效果。上海酶定向進(jìn)化技術(shù)服務(wù)開發(fā)