T7EndonucleaseI(T7EI)在CRISPR/Cas9基因編輯中的應用主要體現(xiàn)在突變體檢測和基因編輯效率評估上。以下是T7EI在CRISPR/Cas9中的具體應用步驟和特點：1.**基因編輯效率評估**：-T7EI用于評估CRISPR-Cas9在給定的導向RNA靶位點上對細胞群體進行基因編輯的效率。-通過PCR擴增圍繞CRISPR導向RNA靶位點的基因組DNA，如果CRISPR-Cas9介導的非同源末端連接（NHEJ）修復事件引入了突變，變性和退火將形成突變型和野生型PCR擴增子的異源雙鏈DNA。2.**突變體檢測**：-如果CRISPR/Cas9編輯成功在DNA上引入突變，則可與野生型DNA片段退火產(chǎn)生異質(zhì)雙鏈DNA。T7EI可以識別該DNA上的不完全配對的DNA位點然后進行雙鏈切割，通過瓊脂糖凝膠電泳即可顯示酶切后的條帶，從而半定量判定基因編輯效果。-T7EI能識別長度大于或等于2bp的插入、缺失或突變導致的錯配DNA，不能識別1bp的插入、缺失或突變。3.**實驗步驟**：-收集細胞并提取基因組DNA，然后使用PCR擴增期望編輯的基因組區(qū)域。擴增子的長度建議為0.5-1kb。-對擴增的DNA進行變性和退火復性，以產(chǎn)生異質(zhì)雙鏈DNA。-使用T7EI酶處理退火后的DNA產(chǎn)物，在37℃孵育15分鐘。

牛痘DNA拓撲異構酶I（VacciniaVirusDNATopoisomeraseI）在實驗室中的使用主要涉及以下幾個步驟：1.**DNA載體連接**：-牛痘DNA拓撲異構酶I可以用于DNA載體連接，特別是在TOPO克隆載體制備中。它能夠識別并切割雙鏈DNA末端[5’C(T)CCTT]，并與DNA形成共價連接形成穩(wěn)定復合物，遇到DNA的5’-OH基團后，重新連接形成完整DNA鏈。2.**接頭連接**：-在NGS建庫中，牛痘DNA拓撲異構酶I可用于接頭連接。這包括將含有特定序列的接頭A和接頭B與酶一起孵育，以實現(xiàn)DNA片段的連接。3.**操作步驟**：-**質(zhì)粒解旋**：將超螺旋質(zhì)粒DNA與牛痘DNA拓撲異構酶I混合，在37°C下孵育5-15分鐘，以實現(xiàn)質(zhì)粒的解旋。-**接頭連接**：將接頭A（含CCCTT序列）和接頭B（含5’OH）與牛痘DNA拓撲異構酶I混合，在37°C下孵育5-15分鐘，以實現(xiàn)接頭的連接。4.**注意事項**：-雙鏈接頭A通常5’端做NH2封閉修飾，以防止自連接；接頭A的CCCTT后通常包含5-12bp尾巴，再長的尾巴會導致連接效率大幅下降。-雙鏈接頭B的5’端必須包含-OH。-由于該酶應用廣，在不同的實驗中使用策略不同，需要靈活運用，并根據(jù)具體文獻進行調(diào)整。

Recombinant Cynomolgus BDCA-2 Protein,mFc TagCRISPR/Cas12a 是一種單一的RNA引導的核酸內(nèi)切酶，通過CRISPR/Cas9系統(tǒng)為靶向基因組工程提供了新的機會。

在質(zhì)粒DNA提取過程中，確保DNA的完整性和活性至關重要，這通常涉及以下幾個關鍵因素：1.**溫和的裂解條件**：選擇適當?shù)牧呀夥椒▽τ诒３諨NA的完整性至關重要。對于大于15kb的質(zhì)粒DNA，應采用溫和的裂解方法，如將細菌懸浮于等滲的葡萄糖溶液中，加入溶菌酶和EDTA破壞細胞壁和細胞膜，以減少對質(zhì)粒DNA的機械剪切力，從而保護其完整性。2.**避免過度裂解**：在質(zhì)粒提取過程中，并非裂解時間越長越好。過長的裂解時間可能會造成基因組DNA片段的污染，影響質(zhì)粒的純度。3.**適當?shù)南礈旌拖疵?*：在純化過程中，適當?shù)南礈炜梢匀コ鞍踪|(zhì)和其他雜質(zhì)，但過度洗滌可能會導致DNA的損失。洗脫步驟中，確保洗脫液完全浸潤柱膜，以保證結合在柱膜上的質(zhì)粒得以充分洗脫，避免因洗脫體積過小而影響質(zhì)粒得率。4.**避免DNA的降解**：在提取過程中，添加核酸酶抑制劑可以防止DNA被核酸酶降解。同時，避免長時間將DNA暴露在室溫下，以及避免多次凍融循環(huán)，這些都有助于保護DNA的完整性。5.**低溫操作**：盡量在低溫條件下進行提取操作，以減少核酸酶的活性，從而保護DNA的完整性。

牛痘DNA拓撲異構酶I（VacciniaVirusDNATopoisomeraseI）是一種來源于牛痘病毒的I型真核拓撲異構酶，具有以下功能和應用：1.**功能**：-牛痘DNA拓撲異構酶I可以催化雙鏈DNA分子中單鏈DNA特定序列位置的磷酸二酯鍵的斷開和連接。-具有解超螺旋的酶(DNARelaxingEnzyme)活性，能夠通過快速的酶切和連接使雙鏈共價閉合環(huán)狀的正或負超螺旋DNA發(fā)生解超螺旋，形成含有較少的正或負超螺旋的雙鏈環(huán)狀DNA分子。-能夠使雙鏈DNA形成繩結(knotting)或解開繩結(unknotting)，聯(lián)結互補的單鏈環(huán)狀DNA成為雙鏈環(huán)狀DNA。2.**應用**：-作為一種DNA重組連接的新型工具酶，用于DNA載體和重組片段的連接、缺刻修復、接頭連接等。-適用于TOPO克隆載體的制備、NGS建庫中的接頭連接等。-在TOPO克隆技術中，DNA拓撲異構酶I同時具有限制酶和連接酶特性，其生物學功能是在復制期間切割并重新連接DNA。3.**使用方法**：-用于DNA快速酶切流程，包括配制體系反應液、輕柔混勻、37℃孵育15分鐘等步驟。4.**儲存條件**：-建議在-25～-15℃保存，有效期為3年。5.**注意事項**：-避免起泡或劇烈攪拌、渦旋等操作，以防止酶失活。牛痘DNA拓撲異構酶I因其獨特的功能，在分子生物學研究和基因工程中扮演著重要的角色。FnCas12a在完成特異性切割后，還能非特異性地切割其他單鏈DNA，這一特性被用于開發(fā)了多種核酸檢測技術。

CUT&RUN和ChIC是兩種用于研究蛋白質(zhì)-DNA相互作用的技術，它們有一些關鍵的區(qū)別：1.**技術原理**：-**ChIC（ChromatinImmunocleavage）**：ChIC技術利用抗體將感興趣的蛋白與ProteinA-MNase相結合來進行DNA切割。ChIC的優(yōu)勢在于使用TF特異性抗體系住MNase，并只在結合位點裂解。-**CUT&RUN（CleavageUnderTargetsandReleaseUsingNuclease）**：CUT&RUN技術則是在核的輕微MNase處理后釋放單核小體和TF-DNA復合物，留下寡核小體。CUT&RUN通過在冰上進行簡短的消化反應，在TF結合的MNase擴散到周邊的基因組和裂解可接近的染色質(zhì)之前在上清中恢復TF-DNA復合物。2.**操作步驟和簡便性**：-**ChIC**：ChIC可能需要甲醛固定操作，這可能重新引入了ChIP-seq的一些問題，如交聯(lián)導致的DNA和蛋白質(zhì)的化學修飾。-**CUT&RUN**：CUT&RUN簡化了操作步驟，使用磁珠固定細胞核，適用于新鮮和冷凍組織樣本，縮短了生成DNA測序文庫的時間（1-2天）。3.**背景信號和信噪比**：-**ChIC**：ChIC產(chǎn)生的背景信號可能較高，因為它可能涉及到非特異性的DNA切割。

泛素蛋白的C末端通常通過酰胺鍵與靶蛋白的氨基團連接在一起，最常見的是與靶蛋白賴氨酸的ε氨基團相連。Recombinant Human FLRT1 Protein,His Tag

確保Cre重組酶只作用于特定細胞，主要通過以下幾種方式實現(xiàn)：1.**組織特異性啟動子**：-利用組織特異性啟動子控制Cre重組酶的表達，可以確保Cre酶只在特定組織或細胞中表達。這種方法通過將Cre基因置于特定細胞類型特有的啟動子控制之下，實現(xiàn)對Cre酶表達的精確控制。2.**誘導型Cre重組酶系統(tǒng)**：-通過使用Cre-ERT（雌素受體突變體與Cre重組酶的融合蛋白），可以實現(xiàn)對Cre活性的時間控制。在無他莫昔芬誘導時，Cre-ERT與熱激蛋白Hsp90結合，定位于細胞質(zhì)中；當他莫昔芬給藥誘導時，Hsp90脫離Cre-ERT，使Cre-ERT進入細胞核發(fā)揮基因重組的作用。這種系統(tǒng)相當于為Cre-Lox系統(tǒng)加裝了一個由他莫昔芬控制的外源開關，使得體內(nèi)基因編輯更具時空靈活性。3.**藥物誘導的Cre系統(tǒng)**：-例如Tet-on系統(tǒng)，通過四環(huán)素或其衍生物多西環(huán)素的添加來激起基因表達。在三重轉(zhuǎn)基因動物中，rtTA在特定啟動子的控制下表達，多西環(huán)素與rtTA結合，Cre的表達，導致固定的報告基因重組。4.**AAV遞送Cre**：-利用包含組織特異性啟動子的腺相關病毒（AAV）載體可以選擇性地將Cre重組酶遞送至特定細胞。

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