牛痘DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶I(VacciniaVirusDNATopoisomeraseI)是一種來源于牛痘病毒的I型真核拓?fù)洚悩?gòu)酶,具有以下功能和應(yīng)用:1.**功能**:-牛痘DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶I可以催化雙鏈DNA分子中單鏈DNA特定序列位置的磷酸二酯鍵的斷開和連接。-具有解超螺旋的酶(DNARelaxingEnzyme)活性,能夠通過快速的酶切和連接使雙鏈共價閉合環(huán)狀的正或負(fù)超螺旋DNA發(fā)生解超螺旋,形成含有較少的正或負(fù)超螺旋的雙鏈環(huán)狀DNA分子。-能夠使雙鏈DNA形成繩結(jié)(knotting)或解開繩結(jié)(unknotting),聯(lián)結(jié)互補的單鏈環(huán)狀DNA成為雙鏈環(huán)狀DNA。2.**應(yīng)用**:-作為一種DNA重組連接的新型工具酶,用于DNA載體和重組片段的連接、缺刻修復(fù)、接頭連接等。-適用于TOPO克隆載體的制備、NGS建庫中的接頭連接等。-在TOPO克隆技術(shù)中,DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶I同時具有限制酶和連接酶特性,其生物學(xué)功能是在復(fù)制期間切割并重新連接DNA。3.**使用方法**:-用于DNA快速酶切流程,包括配制體系反應(yīng)液、輕柔混勻、37℃孵育15分鐘等步驟。4.**儲存條件**:-建議在-25~-15℃保存,有效期為3年。5.**注意事項**:-避免起泡或劇烈攪拌、渦旋等操作,以防止酶失活。牛痘DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶I因其獨特的功能,在分子生物學(xué)研究和基因工程中扮演著重要的角色。FnCas12a需要一個crRNA,而不需要tracrRNA,簡化了RNA的設(shè)計和構(gòu)建過程。Recombinant Human CD93/C1q R1 (hFc Tag)
pA-MNase(蛋白A-微球菌核酸酶)在以下實驗中特別有用:1.**ChIC(ChromatinImmunocleavage)**:這是一種用于研究蛋白質(zhì)-DNA相互作用的技術(shù),pA-MNase在此技術(shù)中用于在免疫沉淀后切割染色質(zhì)DNA,以分析特定蛋白質(zhì)與DNA的結(jié)合位點。2.**CUT&RUN(CleavageUnderTargetsandReleaseUsingNuclease)**:這是一種蛋白質(zhì)-基因組互作研究技術(shù),pA-MNase在此技術(shù)中用于在目標(biāo)蛋白質(zhì)被抗體識別后,通過核酸酶活性切割附近的DNA,從而釋放與目標(biāo)蛋白質(zhì)相互作用的DNA片段。CUT&RUN技術(shù)相比傳統(tǒng)的ChIP-Seq具有實驗周期短、信噪比高、可重復(fù)性好以及細(xì)胞投入量低的優(yōu)勢,尤其適用于早期胚胎發(fā)育、干細(xì)胞、**以及表觀遺傳學(xué)等研究領(lǐng)域。3.**染色質(zhì)免疫沉淀實驗**:pA-MNase在染色質(zhì)免疫沉淀實驗中用于染色質(zhì)片段化,它在核小體間DNAlinker上進行切割保持了核小體的完整性,并且由于其溫和的酶解條件,消除了超聲功率的可變性和超聲過程中染色質(zhì)乳化所帶來的負(fù)面影響。4.**去除核酸污染**:pA-MNase也可用于去除細(xì)胞裂解液中的核酸,以減少樣品的粘度,這對于后續(xù)的蛋白質(zhì)分析實驗尤為重要。
磁珠法提取的DNA通常指的是通過磁珠吸附技術(shù)從樣本中純化得到的核酸,而基因組DNA(gDNA)是指一個生物體細(xì)胞核中包含的全套遺傳信息的DNA。兩者的主要區(qū)別在于:1.**來源和組成**:-磁珠法提取的DNA可以是基因組DNA,也可以是質(zhì)粒DNA、線粒體DNA等其他類型的DNA。它是一個廣的概念,指的是通過磁珠法技術(shù)提取的任何類型的DNA。-基因組DNA特指一個生物體細(xì)胞核中的DNA,包含了所有的基因信息,以及可能的非編碼區(qū)域。它通常包含了大量的堿基對,如人類基因組由大約30億個堿基對組成。2.**純度和應(yīng)用**:-磁珠法提取的DNA的純度和質(zhì)量取決于提取過程中的裂解、吸附、洗滌和洗脫步驟,以及磁珠的質(zhì)量和操作條件。高質(zhì)量的磁珠法提取的DNA可以用于多種分子生物學(xué)實驗,如PCR、克隆、測序等。-基因組DNA的提取通常需要考慮其完整性和純度,以確保后續(xù)實驗的準(zhǔn)確性。基因組DNA提取的難點在于血液樣本成分復(fù)雜,且白細(xì)胞體積占比低,因此提取純化難度較高。3.**提取方法**:-磁珠法提取DNA是一種高效、快速的核酸提取技術(shù),它利用磁珠表面修飾的特定官能團與核酸的特異性結(jié)合,通過外加磁場實現(xiàn)核酸與雜質(zhì)的快速分離。
在質(zhì)粒DNA提取過程中,確保DNA的完整性和活性至關(guān)重要,這通常涉及以下幾個關(guān)鍵因素:1.**溫和的裂解條件**:選擇適當(dāng)?shù)牧呀夥椒▽τ诒3諨NA的完整性至關(guān)重要。對于大于15kb的質(zhì)粒DNA,應(yīng)采用溫和的裂解方法,如將細(xì)菌懸浮于等滲的葡萄糖溶液中,加入溶菌酶和EDTA破壞細(xì)胞壁和細(xì)胞膜,以減少對質(zhì)粒DNA的機械剪切力,從而保護其完整性。2.**避免過度裂解**:在質(zhì)粒提取過程中,并非裂解時間越長越好。過長的裂解時間可能會造成基因組DNA片段的污染,影響質(zhì)粒的純度。3.**適當(dāng)?shù)南礈旌拖疵?*:在純化過程中,適當(dāng)?shù)南礈炜梢匀コ鞍踪|(zhì)和其他雜質(zhì),但過度洗滌可能會導(dǎo)致DNA的損失。洗脫步驟中,確保洗脫液完全浸潤柱膜,以保證結(jié)合在柱膜上的質(zhì)粒得以充分洗脫,避免因洗脫體積過小而影響質(zhì)粒得率。4.**避免DNA的降解**:在提取過程中,添加核酸酶抑制劑可以防止DNA被核酸酶降解。同時,避免長時間將DNA暴露在室溫下,以及避免多次凍融循環(huán),這些都有助于保護DNA的完整性。5.**低溫操作**:盡量在低溫條件下進行提取操作,以減少核酸酶的活性,從而保護DNA的完整性。
BstDNA聚合酶在等溫擴增中的優(yōu)勢主要包括以下幾點:1.**高靈敏度和擴增效率**:BstDNA聚合酶具有鏈置換能力,能夠在恒溫條件下快速、高效、特異性地擴增模板。翌圣生物的BstPlusDNAPolymerase靈敏度超高,低至5copies目的基因可測,且始終能比競品更快達到閾值,擴增速率更快。2.**高dUTP耐受性**:BstPlusDNAPolymerase具有較高的dUTP耐受性,在反應(yīng)體系中添加dUTP對BstPlusDNAPolymerase的靈敏度及擴增效率無影響,這使得它在防污染系統(tǒng)中表現(xiàn)出色。3.**快速擴增**:使用BstDNA聚合酶的等溫擴增技術(shù),如LAMP,可以在15-60分鐘內(nèi)實現(xiàn)109-1010倍的擴增,顯示出快速的擴增能力。4.**熱穩(wěn)定性**:BstDNA聚合酶具有較強的熱穩(wěn)定性,能在60-65℃的恒溫條件下保持活性,這使得它非常適合于不需要溫度循環(huán)的等溫擴增技術(shù)。5.**簡化的反應(yīng)設(shè)置**:Bst3.0DNAPolymerase優(yōu)化了Loop-MediatedIsothermalDNAAmplification(LAMP)反應(yīng),簡化了反應(yīng)設(shè)置,可以實現(xiàn)單酶RT-LAMP反應(yīng)。6.**抗抑制劑能力強**:Bst3.0DNAPolymerase即使在高濃度的擴增抑制劑中,包括dUTP,也能展現(xiàn)出強大的性能。
Ultra-Long Master Mix 在分子生物學(xué)實驗中的應(yīng)用主要集中在需要擴增長片段DNA序列的場合。Recombinant Human CD93/C1q R1 (hFc Tag)
不同的DNA聚合酶在PCR中的應(yīng)用差異主要體現(xiàn)在以下幾個方面:1.**TaqDNAPolymerase**:是常用的DNA聚合酶之一,來源于Thermusaquaticus,具有較高的熱穩(wěn)定性及擴增效率。但它缺乏3'-5'核酸外切酶活性,即沒有校正功能,因此其保真性相對較低。Taq酶適合擴增較短的DNA片段(通常不超過3kb),且在PCR產(chǎn)物的3'端帶A堿基,可直接用于TA克隆。2.**PfuDNAPolymerase**:來源于Pyrococcusfuriosus,是一種高保真聚合酶,具有3'-5'外切酶活性,可以修復(fù)并糾正PCR反應(yīng)中的腺嘌呤堿基誤配,有效防止誤差累積。Pfu聚合酶適用于需要高度準(zhǔn)確的PCR擴增和DNA測序。3.**VentDNAPolymerase**:來源于Thermuslitoralis,具有中等保真度,比Taq聚合酶高兩倍。它適用于GC含量高或復(fù)雜序列的PCR擴增,具有較高的熱穩(wěn)定性,半衰期可達6.7小時。4.**KODDNAPolymerase**:來源于Thermococcuskodakaraensis,具有高保真性和高熱穩(wěn)定性,保真性是Taq的約50倍,同時具有合成速度快的特點,聚合速度約為普通PfuDNAPolymerase的5倍,特別適合于高保真地擴增6kb以內(nèi)的PCR產(chǎn)物。Recombinant Human CD93/C1q R1 (hFc Tag)