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RNA二代測(cè)序分析檢測(cè)

來(lái)源: 發(fā)布時(shí)間:2022-04-01

RNA病毒基因組測(cè)序工作:動(dòng)物、人、植物被特定病毒株侵染、分離到病毒株、連續(xù)傳代的病毒株往往都需要獲得盡量完整的基因組序列來(lái)指導(dǎo)下一步的研究,傳統(tǒng)的sanger測(cè)序需要了解序列、設(shè)計(jì)引物、做很多PCR,往往效率很低,而NGS作為一種無(wú)需特異性引物擴(kuò)增的測(cè)序方式,可以直接從RNA中獲得序列。如果,1,您的目的是:獲得一種指定RNA病毒盡量完整的序列;2,您可以提供該病毒的中英文名稱(chēng);3,您了解樣本中病毒的載量情況、培養(yǎng)狀況、ct值等任一信息。那么,RNA病毒基因組測(cè)序可以幫助你,探普為你準(zhǔn)備了完整的下單、樣本準(zhǔn)備方法。全基因組測(cè)序覆蓋面廣。RNA二代測(cè)序分析檢測(cè)

測(cè)序技術(shù):在病毒的鑒定及診斷中,通過(guò)高通量測(cè)序技術(shù)和RT-PCR方法的聯(lián)合使用,可以實(shí)現(xiàn)優(yōu)勢(shì)互補(bǔ),提高陽(yáng)性檢出率。更為重要的是,利用高通量測(cè)序技術(shù)還可以對(duì)病毒序列進(jìn)行組裝,獲得病毒全長(zhǎng)基因組信息,為監(jiān)測(cè)病毒變異、探究致病機(jī)理提供研究基礎(chǔ)。本次報(bào)告將圍繞高通量測(cè)序技術(shù)在檢測(cè)中的方法和策略展開(kāi)分享。高通量測(cè)序技術(shù)的飛速發(fā)展使其在病毒學(xué)研究領(lǐng)域得到了越來(lái)越普遍的應(yīng)用。無(wú)論是突發(fā)病情的應(yīng)急處理、新病毒的發(fā)現(xiàn),還是較大規(guī)模的分子流行病調(diào)查,高通量測(cè)序技術(shù)都比一代測(cè)序技術(shù)有著巨大的優(yōu)勢(shì)。SFTS病毒(SFTSvirus,SFTSV)是2009年在中國(guó)新發(fā)現(xiàn)的一種布尼亞科白蛉病毒屬的蜱傳病毒,為新發(fā)傳染病發(fā)熱伴血小板減少綜合征(Severefeverwiththrombocytopeniasyndrome,SFTS)致病病因,現(xiàn)在在中國(guó)至少20個(gè)省流行。重慶高通量測(cè)序突變分析公司全基因組測(cè)序可以檢測(cè)個(gè)體基因組中的全部遺傳信息,準(zhǔn)確性高。

為了便于新發(fā)或罕見(jiàn)病毒性傳染病的篩查檢測(cè),利用多重置換擴(kuò)增技術(shù),以負(fù)鏈RNA病毒—發(fā)熱伴血小板減少綜合征病毒和正鏈RNA病毒—登革病毒為模擬樣本探索臨床樣本中RNA病毒基因組非特異性擴(kuò)增方法。研究中通過(guò)梯度稀釋的RNA病毒模擬樣本中可能存在的不同豐度的病原體,樣本核酸依次加工成單鏈cDNA,雙鏈cDNA,T4DNA連接酶處理后的雙鏈cDNA以及添加外源輔助RNA后合成并連接的雙鏈cDNA形式,然后進(jìn)行Phi29DNA聚合酶等溫?cái)U(kuò)增,使用熒光定量PCR方法比較各種方法對(duì)RNA病毒核酸擴(kuò)增的影響。

病毒全基因組測(cè)序,高通量測(cè)序技術(shù)的發(fā)展在生物信息學(xué)分析方面,通過(guò)新的分析軟件的研發(fā)和原有分析軟件的升級(jí),對(duì)測(cè)序所得數(shù)據(jù)的分析也變得更加可靠;除此之外,伴隨著B(niǎo)asSpace等服務(wù)的出現(xiàn),進(jìn)行數(shù)據(jù)分析工作所需的設(shè)備成本也在逐步降低。將來(lái),伴隨著高通量測(cè)序技術(shù)與數(shù)據(jù)分析技術(shù)的不斷進(jìn)步,測(cè)序精度與可靠性的上升,測(cè)序與數(shù)據(jù)分析成本的下降,高通量測(cè)序技術(shù)會(huì)在各個(gè)領(lǐng)域得到應(yīng)用。在病原微生物檢測(cè)和鑒定應(yīng)用中,高通量測(cè)序技術(shù)勢(shì)必會(huì)成為不可或缺的技術(shù)并發(fā)揮越來(lái)越重要的作用。高通量測(cè)序?qū)嶒?yàn)足夠靈敏和完善,方能獲得準(zhǔn)確、可信任的結(jié)果。新一代測(cè)序中基因從頭測(cè)序和重測(cè)序有什么區(qū)別?

病毒全基因組測(cè)序定:探普生物對(duì)病毒的全基因組進(jìn)行測(cè)序的實(shí)驗(yàn)基于二代測(cè)序技術(shù)。樣本經(jīng)過(guò)核酸純化-文庫(kù)構(gòu)建-生物信息學(xué)分析這3大基本流程后轉(zhuǎn)換成了序列數(shù)據(jù)。先,在核酸純化環(huán)節(jié),探普提供專(zhuān)門(mén)針對(duì)性的核酸純化樣本指南,以提高目的物種的核酸純度和得率,與此同時(shí)探普生物也提供核酸純化服務(wù)。第二,文庫(kù)構(gòu)建環(huán)節(jié),樣本的核酸具備濃度低,總量少的特點(diǎn)。探普生物專(zhuān)門(mén)針對(duì)這一點(diǎn)開(kāi)發(fā)了超微量核酸文庫(kù)構(gòu)建,可以將0.01ng/μl甚至更低濃度的核酸構(gòu)建成測(cè)序文庫(kù)。第三,生物信息學(xué)分析環(huán)節(jié)。生存環(huán)境和狀態(tài)決定了對(duì)病毒的全基因組進(jìn)行測(cè)序的下機(jī)數(shù)據(jù)一般都伴隨大量的宿主和其他微生物的數(shù)據(jù)。探普生物基于該特點(diǎn),優(yōu)化了自有數(shù)據(jù)庫(kù),搭載了專(zhuān)門(mén)用的的生物信息學(xué)分析流程,可處理復(fù)雜背景下的目標(biāo)物種序列。病原學(xué)的診斷始終是傳染性疾病診斷的重要一環(huán)。重慶高通量測(cè)序突變分析公司

病毒的全基因組測(cè)序以及對(duì)應(yīng)的生物信息學(xué)分析方法是研究病毒進(jìn)化、毒力因子變異、疫病爆發(fā)之間的關(guān)系。RNA二代測(cè)序分析檢測(cè)

對(duì)病毒的全基因組進(jìn)行測(cè)序價(jià)格合理:上海探普生物科技有限公司致力于醫(yī)藥、保養(yǎng),以科技創(chuàng)新實(shí)現(xiàn)管理的追求。探普生物擁有一支經(jīng)驗(yàn)豐富、技術(shù)創(chuàng)新的專(zhuān)業(yè)研發(fā)團(tuán)隊(duì),以高度的專(zhuān)注和執(zhí)著為客戶提供病毒測(cè)序,病毒全基因組測(cè)序,病毒宏基因組測(cè)序,未知病原鑒定。探普生物繼續(xù)堅(jiān)定不移地走高質(zhì)量發(fā)展道路,既要實(shí)現(xiàn)基本面穩(wěn)定增長(zhǎng),又要聚焦關(guān)鍵領(lǐng)域,實(shí)現(xiàn)轉(zhuǎn)型再突破。探普生物始終關(guān)注醫(yī)藥、保養(yǎng)市場(chǎng),以敏銳的市場(chǎng)洞察力,實(shí)現(xiàn)與客戶的成長(zhǎng)共贏。RNA二代測(cè)序分析檢測(cè)

上海探普生物科技有限公司致力于醫(yī)藥健康,是一家服務(wù)型公司。上海探普生物致力于為客戶提供良好的病毒測(cè)序,病毒全基因組測(cè)序,病毒宏基因組測(cè)序,未知病原鑒定,一切以用戶需求為中心,深受廣大客戶的歡迎。公司從事醫(yī)藥健康多年,有著創(chuàng)新的設(shè)計(jì)、強(qiáng)大的技術(shù),還有一批**的專(zhuān)業(yè)化的隊(duì)伍,確保為客戶提供良好的產(chǎn)品及服務(wù)。上海探普生物秉承“客戶為尊、服務(wù)為榮、創(chuàng)意為先、技術(shù)為實(shí)”的經(jīng)營(yíng)理念,全力打造公司的重點(diǎn)競(jìng)爭(zhēng)力。