隨著測序技術(shù)的發(fā)展，對微生物群（微生物組）的研究逐漸加深，研究熱點越來越多集中于環(huán)境和生物體相互作用的微生物群。加之測序成本降低，分析技術(shù)不斷提升，都使得宏基因組測序技術(shù)得到普遍應(yīng)用。為什么要做宏基因組：宏基因組相對16S來說其物種分辨率會更高，隨著物種測序完成越來越多，數(shù)據(jù)庫更加完善，在腸道菌群方面基本能實現(xiàn)97%以上的菌都能鑒定到種，90%以上到菌株層面。而且可以同時獲得除RNA病毒外的所有物種的分布。此外包括菌基因組CNV等方法的出現(xiàn)，可以直接通過大規(guī)模宏基因組測序不只找到可能的菌，進一步還能鑒定出特定候選基因區(qū)段。宏基因組測序可以提供比傳統(tǒng)方法更快、更早的診斷結(jié)果，以及在的升級/降級方面具有重要意義。土壤微生物多樣性測序公司

病毒宏基因組學(xué)：病毒宏基因組學(xué)是宏基因組學(xué)的一個分支，指研究特定環(huán)境中的病毒群落的一門技術(shù)。近年來隨著新測序技術(shù)的不斷發(fā)展，尤其是第二代、第三代測序儀的出現(xiàn)，使病毒宏基因組學(xué)發(fā)展尤為迅速。對海洋中病毒群體進行了研究，闡明海水中病毒群體以噬菌體為主，并且是應(yīng)用宏基因組學(xué)分析人糞便中不能培養(yǎng)的病毒群落，標(biāo)志病毒宏基因組學(xué)的開端。病毒宏基因組學(xué)這一概念，其描述的是環(huán)境中的病毒群落―噬菌體。再次提到病毒宏基因組學(xué)這一概念，并對宏基因組學(xué)挖掘新病毒的方法進行了闡述，側(cè)重于人和動物機體中的真核病毒群落。武漢水體微生物測序分析方法病毒宏基因組也是旨在研究微生物群體中的物種分布規(guī)律和差異,通過大數(shù)據(jù)分析微生物群體的功能.

病原體-宏基因組的測序:1.開發(fā)了一種經(jīng)過驗證的臨床mNGS檢測方法，用于在許可的微生物實驗室中診斷腦脊髓液（CSF）引起的腦膜炎和腦炎的傳染原因。2.開發(fā)了定制的生物信息學(xué)管道SURPI+，以快速分析mNGS數(shù)據(jù)，生成檢測到的病原體的自動摘要，并提供用于評估和解釋結(jié)果的圖形用戶界面。3.mNGS提供了一種全方面的方法，通過該方法可以在一次測定中準(zhǔn)確鑒定幾乎所有潛在病原體-病毒，細(xì)菌，寄生蟲。4.將mNGS測試遷移到臨床微生物學(xué)實驗室仍然面臨許多挑戰(zhàn)：1、缺乏用于mNGS臨床驗證的既定藍(lán)圖；2、難以將病原體從殖民者或污染物中區(qū)分開；3、缺乏專為臨床診斷使用的生物信息學(xué)軟件；4、注重質(zhì)量和全方面性的可獲得的參考數(shù)據(jù)庫；5、臨床實驗室改進修正案（CLIA）環(huán)境中，患者診斷測試固有的法規(guī)遵從性要求

探普生物進行病毒宏基因組測序，樣品具備什么條件才能獲得比較質(zhì)量的宏基因組分析效果？其他公司對用于測序的樣本的要求較高。而在探普生物進行病毒宏基因組測序，基于探普的專有流程，樣本要求非常低，不要求總量到達(dá)微克，探普有專門的收樣標(biāo)準(zhǔn)和送樣流程。為了保證后續(xù)數(shù)據(jù)的有效利用率，需要客戶配合完成合格的取樣步驟和樣本前處理步驟。當(dāng)然探普也提供適當(dāng)?shù)臉颖咎幚矸?wù)。核酸性質(zhì)有RNA和DNA之分，核酸鏈還有單雙鏈之分，而核酸本質(zhì)不同和單雙鏈的不同，進行同樣的實驗步驟其效率也不一樣。這些特點決定了宏基因組測序是相對個性化定制化的一類服務(wù)，出于對結(jié)果真實性的尊重和保證，需要客戶和銷售人員充分溝通，設(shè)定合理的樣本處理方案。病原微生物二代測序也稱宏基因組測序（mNGS）是目前臨床上針對病原常用的基因測序方法。

宏基因組測序相關(guān)知識：宏基因組測序是對人體樣本或特定環(huán)境樣品中的總核酸（DNA或RNA）進行高通量測序，通過比對數(shù)據(jù)庫，得到傳染病原體的信息，能夠檢測出新發(fā)和罕見病原體，特別是在未知病原檢測中發(fā)揮了難以替代的作用，當(dāng)然宏基因組檢測方法也面臨不少挑戰(zhàn)，檢測結(jié)果的靈敏度受宿主及其他微生物背景核酸的影響。高通量測序技術(shù)能夠提供準(zhǔn)確而科學(xué)的基因測序分析結(jié)果，為病情防控提供有力技術(shù)保障?？茖W(xué)家通過對病毒進行全基因組測序，可以了解病毒不同傳播階段的變異情況，推測病毒對人的傳染力的變化及傳播情況。宏基因組測序技術(shù)不依賴于微生物的分離培養(yǎng)。武漢水體微生物測序分析方法

未知病原微生物樣本需要經(jīng)歷：核酸純化-文庫構(gòu)建-以及生物信息學(xué)分析這三大基本流程才能完成鑒定。土壤微生物多樣性測序公司

新發(fā)人畜共患病呈現(xiàn)逐年遞增的趨勢，人類想要征服新發(fā)人畜共患病，就必須提前發(fā)掘潛在的新的致病的病原，并針對新病原進行基因組分析、流行病學(xué)調(diào)查、致病機制及疫苗開發(fā)等方面的研究。病毒宏基因組學(xué)是在宏基因組學(xué)基礎(chǔ)上發(fā)展起來研究特定環(huán)境中病毒的新興技術(shù)，該技術(shù)結(jié)合深度測序技術(shù)（第二代、第三代測序技術(shù)）已經(jīng)在人類、動物、特定環(huán)境中挖掘出大量的新病毒，該技術(shù)不依賴于病毒培養(yǎng)及病毒序列，在國內(nèi)外被普遍應(yīng)用于新發(fā)人畜共患病病原的挖掘與臨床診斷。就病毒宏基因組學(xué)在動物病毒研究中的應(yīng)用及研究進展進行了介紹。土壤微生物多樣性測序公司