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病毒二代測(cè)序排行

來(lái)源: 發(fā)布時(shí)間:2022-01-22

二代測(cè)序可以用于對(duì)病毒的全基因組進(jìn)行測(cè)序有哪些挑戰(zhàn)?二代測(cè)序相較sanger測(cè)序,差異主要就是單次運(yùn)行可以獲得海量的數(shù)據(jù)量,因此也稱為高通量測(cè)序。想要通過(guò)高通量測(cè)序獲得病毒全序列,需要經(jīng)歷:核酸純化-文庫(kù)構(gòu)建-生物信息學(xué)分析這三大基本流程。而高通量測(cè)序技術(shù)本身并不是以病毒為目標(biāo)開發(fā)的,因此每個(gè)環(huán)節(jié)都是挑戰(zhàn)。核酸純化步驟決定了Input核酸的起始濃度和總量,從而決定了文庫(kù)構(gòu)建的成敗、質(zhì)量和產(chǎn)量;文庫(kù)的好壞決定了數(shù)據(jù)的質(zhì)量和產(chǎn)出;而數(shù)據(jù)的質(zhì)量產(chǎn)出直接影響分析結(jié)果。樣品一般核酸濃度很低,且?guī)в写罅克拗魑廴荆虼藢?shí)驗(yàn)部分和分析部分都比較困難。探普生物基于這些困難點(diǎn),進(jìn)行了大量有針對(duì)性的研發(fā)和測(cè)試,開發(fā)了全套的實(shí)驗(yàn)和分析流程用于對(duì)病毒的全基因組進(jìn)行測(cè)序,該流程自運(yùn)行以來(lái)廣受研究者們好評(píng)。病毒全基因組測(cè)序具有的特點(diǎn):完善的售后服務(wù)。病毒二代測(cè)序排行

深度測(cè)序技術(shù)稱為深度測(cè)序(deepsequencing),是因?yàn)樗菍?duì)傳統(tǒng)測(cè)序技術(shù)的一次**性改變,它通過(guò)一次性對(duì)幾十萬(wàn)到幾百萬(wàn)條DNA分子進(jìn)行序列測(cè)定(之前只是幾十至多幾千個(gè)堿基),同時(shí),如此的高通量測(cè)序使得對(duì)一個(gè)物種的轉(zhuǎn)錄組和基因組進(jìn)行細(xì)致全方面的分析成為可能。你以為深度測(cè)序只是一種“養(yǎng)”在實(shí)驗(yàn)室“深閨”中摸不著、看不透的高精尖技術(shù)?錯(cuò)!錯(cuò)!錯(cuò)!深度測(cè)序技術(shù)的巨大發(fā)展,與計(jì)算機(jī)的發(fā)展歷程有著類似之處,它將對(duì)人類的科學(xué)、經(jīng)濟(jì)和社會(huì)三個(gè)方面產(chǎn)生深遠(yuǎn)的影響。RNA全基因組病毒二代測(cè)序哪家好新一代測(cè)序中基因從頭測(cè)序和重測(cè)序有什么區(qū)別?

病毒全基因組測(cè)序具有的特點(diǎn):1.不預(yù)設(shè)目標(biāo)檢出物,樣本的所有病原信息一網(wǎng)打盡;2.無(wú)需培養(yǎng)和特異性擴(kuò)增,對(duì)采集臨床樣本直接檢測(cè);3.獨(dú)有的一定定量技術(shù),實(shí)現(xiàn)病原定量分析,使病原診斷更準(zhǔn)確;4.與臨床各領(lǐng)域有名**共同打造呼吸道系統(tǒng)、神經(jīng)內(nèi)科系統(tǒng)和血流系統(tǒng)傳染病原數(shù)據(jù)庫(kù),更加貼合需求;5.采用高通量測(cè)序儀,全流程質(zhì)控,結(jié)果穩(wěn)定可靠;6.整體檢出率陽(yáng)性率較傳統(tǒng)方法提升25~30%:肺泡灌洗液檢出率60~80%,腦脊液檢出率40~60%,血液檢出率40~60%;7.專業(yè)化服務(wù):臨床微生物**出具報(bào)告,專業(yè)醫(yī)學(xué)團(tuán)隊(duì)報(bào)告解讀。針對(duì)疑難報(bào)告,由**進(jìn)行深度解析;8.完善的售后服務(wù):基于PCR技術(shù)和抗原抗體技術(shù)的售后驗(yàn)證平臺(tái),致力于解決臨床的每一個(gè)疑問(wèn)。

病毒是由一種核酸分子(DNA或RNA)與蛋白質(zhì)(Protein)構(gòu)成或只由蛋白質(zhì)構(gòu)成(如朊病毒)。根據(jù)遺傳物質(zhì)的組成,可分為單鏈DNA病毒(ssDNA)、雙鏈DNA病毒(dsDNA)、單鏈RNA病毒(ssRNA)、雙鏈RNA病毒(dsRNA)和蛋白質(zhì)病毒(如朊病毒)。根據(jù)宿主類型的不同,可以分為噬菌體(細(xì)菌病毒)、植物病毒(煙花葉病毒)和動(dòng)物病毒(如禽流感病毒、天花病毒和HIV等)。病毒全基因組測(cè)序(VirusWholeGenomeSequencing,VWGS),是指基于第二代高通量測(cè)序技術(shù),對(duì)病毒全基因組進(jìn)行測(cè)序,利用生物信息分析手段,得到病毒的全基因組序列,解析編碼信息,并獲得相應(yīng)的變異信息。想要通過(guò)高通量測(cè)序獲得病毒全序列,需要經(jīng)歷:核酸純化-文庫(kù)構(gòu)建-生物信息學(xué)分析這三大基本流程。

病毒基因組測(cè)序:病毒基因組測(cè)序包括完成圖測(cè)序、掃描圖測(cè)序和重測(cè)序三個(gè)層面,通過(guò)二代/三代測(cè)序平臺(tái),獲得病毒的基因組的序列信息,并在結(jié)構(gòu)基因組學(xué)、比較基因組學(xué)層面通過(guò)差異分析、同源基因分析、共線性分析、物種進(jìn)化分析等手段探究病毒的毒力系統(tǒng)、基因組的進(jìn)化與演變歷程等。對(duì)疑似傳染標(biāo)本采集提取后直接進(jìn)行高通量測(cè)序,通過(guò)病原微生物專門用的數(shù)據(jù)庫(kù)比對(duì)和智能化算法分析,獲得疑似致病微生物種屬信息,并提供全方面深入的報(bào)告,為疑難危重傳染提供快速準(zhǔn)確診斷依據(jù),促進(jìn)藥物的合理應(yīng)用。病毒全基因組測(cè)序具有的特點(diǎn):不預(yù)設(shè)目標(biāo)檢出物,樣本的所有病原信息一網(wǎng)打盡。國(guó)內(nèi)病毒高通量測(cè)序進(jìn)化分析

病毒全基因組測(cè)序具有的特點(diǎn):獨(dú)有的一定定量技術(shù),實(shí)現(xiàn)病原定量分析。病毒二代測(cè)序排行

深度測(cè)序技術(shù)對(duì)經(jīng)濟(jì)市場(chǎng)具有的影響:未來(lái)社會(huì)的創(chuàng)新驅(qū)動(dòng)將由信息技術(shù)向心理社會(huì)健康方面轉(zhuǎn)移。可以預(yù)見,全球老年化社會(huì)到來(lái)后的經(jīng)濟(jì)主戰(zhàn)場(chǎng)將是健康行業(yè),而以基因測(cè)序預(yù)測(cè)健康和臨床準(zhǔn)確分型的市場(chǎng)將會(huì)越來(lái)越大。深度測(cè)序相關(guān)的經(jīng)濟(jì)市場(chǎng)有兩個(gè)方面。一是測(cè)序儀器和技術(shù)相關(guān)的市場(chǎng),二是測(cè)序應(yīng)用市場(chǎng)的競(jìng)爭(zhēng)。一個(gè)顯見的例子是,近年來(lái)深度測(cè)序技術(shù)促進(jìn)了對(duì)肺病的進(jìn)一步認(rèn)識(shí)和分型,更多的位點(diǎn)突變?nèi)鏏LK、ERCC1、MET、PI3K、RRM1等被陸續(xù)發(fā)現(xiàn),多基因檢測(cè)肺病致病驅(qū)動(dòng)基因?qū)︶t(yī)生準(zhǔn)確選擇靶向藥物十分重要。以肺病中常見的EGFR突變型為例,對(duì)于敏感性基因突變(19Del+L858R),第1代靶向藥物(如易瑞沙等)可以進(jìn)行良好的調(diào)整和控制;但是對(duì)于耐藥性基因突變(T790M),則需要第三代靶向藥物(AZD9291)才有較好的臨床效果。不久的將來(lái),病癥患者將獲得更具個(gè)性化的藥物,從而達(dá)到準(zhǔn)確醫(yī)療。病毒二代測(cè)序排行

上海探普生物科技有限公司總部位于放鶴路1088號(hào)6號(hào)樓307,是一家從事生物科技專業(yè)領(lǐng)域內(nèi)技術(shù)開發(fā)、技術(shù)轉(zhuǎn)讓、技術(shù)咨詢、技術(shù)服務(wù),化工原料及產(chǎn)品(除危險(xiǎn)化學(xué)品、監(jiān)控化學(xué)品、煙花爆竹、易制毒化學(xué)品),實(shí)驗(yàn)室設(shè)備,計(jì)算機(jī)、軟件及輔助設(shè)備,電子產(chǎn)品銷售,計(jì)算機(jī)軟件開發(fā)及維護(hù),計(jì)算機(jī)信息系統(tǒng)集成服務(wù)等。的公司。上海探普生物深耕行業(yè)多年,始終以客戶的需求為向?qū)?,為客戶提?**的病毒測(cè)序,病毒全基因組測(cè)序,病毒宏基因組測(cè)序,未知病原鑒定。上海探普生物不斷開拓創(chuàng)新,追求出色,以技術(shù)為先導(dǎo),以產(chǎn)品為平臺(tái),以應(yīng)用為重點(diǎn),以服務(wù)為保證,不斷為客戶創(chuàng)造更高價(jià)值,提供更優(yōu)服務(wù)。上海探普生物始終關(guān)注醫(yī)藥健康市場(chǎng),以敏銳的市場(chǎng)洞察力,實(shí)現(xiàn)與客戶的成長(zhǎng)共贏。