在這里,Genovis分析了 C1 抑制劑——一種人血漿衍生的生物zhiliao藥物,由 6 種 N-聚糖和多達(dá) 28 種 O-聚糖修飾,主要由唾液酸he心 1 結(jié)構(gòu)組成。在不對(duì)這種高度異質(zhì)的蛋白質(zhì)進(jìn)行任何預(yù)處理的情況下,反相LC-MS分析產(chǎn)生了無(wú)法詳細(xì)解釋的復(fù)雜質(zhì)譜圖。在天然條件下使用OmniGLYZOR Microspin色譜柱,可在3小時(shí)內(nèi)有效去除所有O-聚糖。然而,蛋白質(zhì)上仍殘留著 1 到 3 個(gè) N-聚糖。使用凍干的PNGase F和OmniGLYZOR試劑盒中包含的MS友好型RapiGest? SF表面活性劑*,在變性條件下通過(guò)額外的去糖基化步驟去除這些不可接近的N-聚糖。觀察到所有聚糖的完全去除,但分子上存在的少量he心 2 O-聚糖除外。水解O-聚糖的酶不會(huì)從變性中獲益,這就是為什么OmniGLYZOR Microspin色譜柱只能在非變性條件下使用的原因。PNGase F酶在大腸桿菌中表達(dá),該重組基因來(lái)源于伊麗莎白金氏腦膜敗血癥。青海瑞典GenovisPNGaseF去糖基化酶蛋白質(zhì)組學(xué)研究
FucosEXO中的酶在大腸桿菌中表達(dá),帶有His標(biāo)簽,分子量為87 kDa和64 kDa。FucosEXO在天然條件下水解糖蛋白上的巖藻糖,在6至8的pH值范圍內(nèi)顯示出高活性,無(wú)需輔助因子或添加劑。1. 用于方法開(kāi)發(fā)的靈活格式;2. 可以結(jié)合酶以提高效率;3. 適用于自動(dòng)化工作流程;4.即用型 - 只需加水即可。Genovis的FucosEXO 是 α-巖藻糖苷酶的混合物,用于在 N-和 O-糖基化蛋白或游離寡糖上有效水解 α1-2、α1-3 和 α1-4-連接的巖藻糖。人血清中 O-糖蛋白的富集:GlycOCATCH還可用于從復(fù)雜的樣品混合物(如人血清)中選擇性富集O-糖基化蛋白。簡(jiǎn)而言之,用Genovis的SialEXO處理血清并應(yīng)用于GlycOCATCH樹(shù)脂。洗滌樹(shù)脂,用8M尿素洗脫O-糖基化蛋白。用胰蛋白酶消化樣品并使用 RP-LC-MS/MS 進(jìn)行分析,并使用 Swiss Prot 數(shù)據(jù)庫(kù)鑒定蛋白質(zhì)列表。O-糖基化蛋白以黃色表示。青海瑞典GenovisPNGaseF去糖基化酶蛋白質(zhì)組學(xué)研究PNGase F去除N-糖,被用于MS分析的樣品制備,以降低蛋白質(zhì)的異質(zhì)性,分析游離的糖,并研究N-糖的功能作用。
Genovis 集團(tuán)由瑞典 Genovis AB 和美國(guó)全資子公司 Genovis Inc. 組成。該公司的在納斯達(dá)克北方增長(zhǎng)市場(chǎng)上市。如需了解更多信息,請(qǐng)?jiān)L問(wèn)投資者關(guān)系。 Genovis的經(jīng)營(yíng)理念是為生物制藥和研究行業(yè)的客戶提供工具,以促進(jìn)和節(jié)省開(kāi)發(fā)新治療方法和診斷的時(shí)間。Genovis 酶產(chǎn)品,稱為 SmartEnzymes,被世界各地的科學(xué)家使用,創(chuàng)新的產(chǎn)品形式促進(jìn)了生物藥物的開(kāi)發(fā)和質(zhì)量控制。 通過(guò)在2020年收購(gòu)QED Bioscience,產(chǎn)品組合已擴(kuò)大到包括用于研究、生物藥物開(kāi)發(fā)和診斷檢測(cè)的抗體和試劑。在 網(wǎng)站 上閱讀有關(guān)QED的更多信息 Genovis 研發(fā)活動(dòng)的基石是客戶關(guān)系,使產(chǎn)品開(kāi)發(fā)能夠滿足客戶需求。與專注于表征新酶、開(kāi)發(fā)新工作流程和新靶點(diǎn)抗體的學(xué)術(shù)團(tuán)體的合作同樣有價(jià)值。
在Genovis的PNGaseF去除N-聚糖并用SialEXO和GalactEXO截?cái)郞-聚糖后,在質(zhì)譜圖中觀察到幾個(gè)與GalNAcs相關(guān)的峰。為了去除剩余的GalNAc殘基,應(yīng)用GalNAcEXO酶。用GalNAcEXO處理后觀察到的單個(gè)蛋白峰顯示完全去除剩余的GalNAcs。?GalNAcEXO在生理緩沖液和中性pH值中具有活性,使其與大多數(shù)樣品相容。此外,GalNAcEXO的活性不依賴于任何可能影響LC-MS分析的輔因子,如BSA。根據(jù)底物的性質(zhì),糖蛋白的GalNAcEXO反應(yīng)在2小時(shí)內(nèi)完成,而更復(fù)雜的樣品可能需要孵育過(guò)夜。Genovis的GalNAcEXO也可固定在離心柱中,以便快速方便地處理樣品,在制備過(guò)程中不會(huì)殘留酶。使用OpeRATOR對(duì)胞生成素(EPO)進(jìn)行O-糖位點(diǎn)特異性消化:確定中級(jí)水平的 O-糖基化位點(diǎn)。
我們測(cè)量了FucosEXO從一組dai表不同鍵的不同寡糖底物中釋放的巖藻糖。FucosEXO可有效釋放α1-2、α1-3和α1-4連接的巖藻糖,對(duì)α1-6連接的巖藻糖殘基沒(méi)有活Genovis的FucosEXO的底物特異性:巖藻糖以不同的鍵存在于N-和O-聚糖上。α1-2、α1-3 和 α1-4 連接的巖藻糖常見(jiàn)于 O-聚糖中,并作為 N-聚糖的天線巖藻糖基化,而 α1-6 連接的巖藻糖被發(fā)現(xiàn)是 N-聚糖he心的修飾。β1-3,4半乳糖的水解:Genovis的GalactEXO 是一種β-半乳糖苷酶混合物,可水解 N-和 O-糖基化蛋白中的 β1-3,4-連接末端半乳糖。PNGase F(肽 N-糖苷酶 F)是一種糖酰胺酶,可水解內(nèi)層 GlcNAc 之間的酰胺鍵。青海瑞典GenovisPNGaseF去糖基化酶蛋白質(zhì)組學(xué)研究
將OglyZOR酶與依那西普、TNFR 和阿巴西普在 37°C 下有或沒(méi)有 SialEXO 孵育 1 小時(shí)。青海瑞典GenovisPNGaseF去糖基化酶蛋白質(zhì)組學(xué)研究
蛋白質(zhì)的N-糖基化特征是一個(gè)關(guān)鍵的質(zhì)量屬性。它會(huì)影響生物制藥的安全性和有效性,因此需要在開(kāi)發(fā)和生產(chǎn)過(guò)程中進(jìn)行表征和監(jiān)測(cè)。常見(jiàn)的聚糖分析工作流程是用PNGase F釋放N-聚糖,然后用熒光標(biāo)記物(如2-AB、2-AA、普魯卡因胺或RapiFluor-MS?(沃特世公司))標(biāo)記生成的聚糖。然后使用HILIC-HPLC或毛細(xì)管電泳分離標(biāo)記的聚糖,以表征和定量不同的聚糖結(jié)構(gòu)。 在這里,使用游離聚糖方法分析zhiliao性抗體曲妥珠單抗、Fc-融合蛋白依那西普和糖蛋白R(shí)Nase B的N-聚糖。曲妥珠單抗和依那西普在天然條件下在37°C下用Genvois的PNGase F去糖基化1小時(shí),而RNase B需要變性和還原才能完全去糖基化。因此,在50°C下用PNGase F去糖基化10分鐘之前,用RapiGest? SF表面活性劑(沃特世公司)和TCEP處理RNase B。 用RapiFluor-MS標(biāo)記所得游離的聚糖,并通過(guò)HILIC UPLC-FLD-MS進(jìn)行分析。青海瑞典GenovisPNGaseF去糖基化酶蛋白質(zhì)組學(xué)研究