免疫共沉淀(Co-Immunoprecipitation,Co-IP)的優(yōu)點主要包括:高度特異性:免疫共沉淀利用高親和力的抗體與目標(biāo)蛋白結(jié)合,能夠高度特異性地識別目標(biāo)蛋白質(zhì),從而減少假陽性和假陰性的誤差,提高實驗結(jié)果的準(zhǔn)確性??煽匦詮姡好庖吖渤恋韺嶒灥姆磻?yīng)條件相對穩(wěn)定,實驗長度、溫度、蛋白濃度、抗體濃度等可被有效控制,這樣可以有效地減少誤差和變異性??捎糜谘芯康鞍紫嗷プ饔茫好庖吖渤恋聿粌H可以檢測單個蛋白質(zhì),還可以研究蛋白質(zhì)之間的相互作用,從而揭示蛋白質(zhì)的組裝和功能。這對于理解細(xì)胞內(nèi)的信號轉(zhuǎn)導(dǎo)、代謝途徑等復(fù)雜生物過程具有重要意義。天然狀態(tài):通過免疫共沉淀得到的蛋白質(zhì)相互作用是在自然狀態(tài)下進(jìn)行的,避免了人為影響,可以分離得到天然狀態(tài)下相互作用的蛋白復(fù)合物。這對于理解蛋白質(zhì)在細(xì)胞內(nèi)的真實功能和相互作用模式具有重要意義??赡嫘裕好庖吖渤恋韺嶒炇强赡娴?,在沉淀后的蛋白質(zhì)可以被再次溶解和分離進(jìn)行下一步操作或其他科學(xué)研究。操作簡便:免疫共沉淀的實驗流程相對簡便,不需要事先制備大規(guī)模蛋白表達(dá)文庫,使得這種方法在實驗室中易于實施。Co-IP和ChIP實驗對象有什么區(qū)別。上海免疫沉淀CoIP-Mass檢測
CoIP-Mass和CoIP-WB檢測要點:
互作蛋白篩選和驗證:數(shù)據(jù)分析以非標(biāo)定量信號強度(LFQintensity和FC>10)作為強陽篩選,以文獻(xiàn)查閱,功能匹配,批量CoIP-WB驗證,提高驗證成功率。理想CoIP-MS結(jié)果的蛋白定量都到超過1000種蛋白。其中絕大部分蛋白為非特異結(jié)合或背景蛋白。以目的蛋白的富集信號強度和差異倍數(shù)作為參考(相對強信號和差異),分析實驗組中明顯定量較高且差異較大的蛋白,作為重要候選蛋白。同時對重要候選蛋白進(jìn)行STRING互作分析,文獻(xiàn)分析,目的蛋白功能匹配分析,選擇Top的4-5個蛋白進(jìn)行CoIP-WB驗證,提高CoIP-WB成功率。 山西CoIP-MassCo-IP實驗要點:樣品新鮮、抗體特異、偶聯(lián)充分、洗滌徹底,確保結(jié)果準(zhǔn)確可靠!
在CoIP(免疫共沉淀)實驗中,對照組的設(shè)計對實驗結(jié)果尤為重要,陽性對照組設(shè)計建議如下:1. 已知相互作用蛋白對照組:如果可能的話,使用已知與誘餌蛋白相互作用的蛋白作為陽性對照。這可以驗證實驗條件的可行性,以及抗體和實驗方法的可靠性。2. 設(shè)置過量誘餌蛋白對照組:通過加入過量的誘餌蛋白,可以驗證靶蛋白與誘餌蛋白之間的相互作用是否具有飽和性。如果加入過量誘餌蛋白后,靶蛋白的結(jié)合減少或消失,則表明相互作用具有飽和性。
在CoIP(免疫共沉淀)實驗中,技術(shù)重復(fù)和生物重復(fù)設(shè)計建議如下:進(jìn)行多次技術(shù)重復(fù)(在同一實驗條件下使用不同的樣品或樣品批次)和生物重復(fù)(使用來自不同生物或不同實驗條件的樣品),以評估結(jié)果的穩(wěn)定性和可靠性。在設(shè)置對照組時,還需要注意以下幾點:對照組的設(shè)置應(yīng)遵循科學(xué)原理,并充分考慮實驗的具體需求和目標(biāo)。確保對照組和實驗組在實驗條件和操作步驟上保持一致,以便進(jìn)行準(zhǔn)確的比較。在分析實驗結(jié)果時,應(yīng)綜合考慮對照組和實驗組的數(shù)據(jù),以得出更準(zhǔn)確的結(jié)論。總之,在CoIP實驗中,通過精心設(shè)計和執(zhí)行對照組實驗,可以提高實驗的準(zhǔn)確性和可靠性,從而更準(zhǔn)確地評估目標(biāo)蛋白與誘餌蛋白之間的相互作用。CoIP實驗需多次重復(fù),科學(xué)設(shè)對照組,確保結(jié)果準(zhǔn)確可靠!
CoIP-Mass和CoIP-WB檢測要點:
試驗設(shè)計:盡量進(jìn)行試驗組別設(shè)計和進(jìn)行生物學(xué)重復(fù)檢測,提高后續(xù)驗證的陽性率。常規(guī)過表達(dá)單組(AbIPvsIgGIP);動態(tài)互作組學(xué)(實驗組vs對照組vsIg組)。根據(jù)目的設(shè)計適當(dāng)?shù)纳飳W(xué)重復(fù)。如果后續(xù)以CoIP-Mass數(shù)據(jù)進(jìn)行互作組標(biāo)準(zhǔn)分析,則需要3-4組生物學(xué)重復(fù);如果后續(xù)以尋找關(guān)鍵互作蛋白,進(jìn)行機制深入研究,則建議1-2次生物學(xué)重復(fù)。經(jīng)驗顯示單次重復(fù)假陽性率90%。
蛋白表達(dá)和細(xì)胞量:細(xì)胞用量要求大(2-10e7細(xì)胞量),建議不少于5e7(金標(biāo)準(zhǔn):320g離心細(xì)胞量50μl,保障項目用量)。低表達(dá)蛋白,建議使用過表達(dá)組進(jìn)行檢測。蛋白表達(dá)可根據(jù)WB結(jié)果或初步根據(jù)數(shù)據(jù)庫判定(ProteomicsDB;HumanProteinAtlas)。 Co-IP和ChIP基本原理方面的區(qū)別有什么。四川互作機制CoIP
Co-IP技術(shù)揭示蛋白互作,助力藥物研發(fā)與疾病機制探索!上海免疫沉淀CoIP-Mass檢測
免疫共沉淀(Co-Immunoprecipitation,Co-IP)是一種經(jīng)典的生物學(xué)技術(shù),主要用于研究蛋白質(zhì)之間的相互作用。它以其獨特的優(yōu)勢在蛋白質(zhì)組學(xué)、生物化學(xué)和細(xì)胞生物學(xué)等領(lǐng)域中得到了大范圍應(yīng)用。Co-IP的主要優(yōu)點包括。直接性:Co-IP能夠直接檢測蛋白質(zhì)之間的相互作用,從而提供關(guān)于蛋白質(zhì)功能和調(diào)控機制的直接證據(jù)。特異性:通過使用特異性抗體,Co-IP能夠精確地捕獲目標(biāo)蛋白及其相互作用伙伴,減少非特異性干擾。靈敏度:Co-IP能夠檢測到低豐度的蛋白質(zhì)相互作用,這對于研究微弱或瞬時的蛋白互作具有重要意義。適用性廣:該技術(shù)適用于多種樣本類型,包括細(xì)胞裂解液、組織提取物和純化后的蛋白質(zhì)復(fù)合物。兼容性強:Co-IP技術(shù)可以與其他技術(shù)相結(jié)合,如質(zhì)譜分析,從而提供更詳盡的互作網(wǎng)絡(luò)信息。綜上所述,Co-IP技術(shù)的優(yōu)點在于其直接性、特異性、靈敏度、大范圍的適用性和與其他技術(shù)的兼容性,這些優(yōu)點使其成為研究蛋白質(zhì)相互作用的有力工具。上海免疫沉淀CoIP-Mass檢測