Real-time PCR鏈式反應(yīng):每次循環(huán)都得加入新的DNA聚合酶,不但操作煩瑣,而且價格昂貴,制約了PCR技術(shù)的應(yīng)用和發(fā)展。耐熱DNA聚合酶-Taq酶的發(fā)現(xiàn)對于PCR的應(yīng)用有里程碑的意義,該酶可以耐受90℃以上的高溫而不失活,不需要每個循環(huán)加酶,使PCR技術(shù)變得非常簡捷、同時也降低了成本,PCR技術(shù)得以大量應(yīng)用,并逐步應(yīng)用于臨床。多重連接依賴探針擴增允許用單個引物對擴增多個靶標,從而避免多重PCR的分辨率限制。引物的設(shè)計注意事項:1,注意引物設(shè)計好后的產(chǎn)物長度。Real-time PCR的較佳產(chǎn)物長度在150-250kb左右(書上說這樣可以增加熒光的敏感度,減少實驗誤差,但是我對這個說法持懷疑態(tài)度。產(chǎn)物長度越大,SYBR嵌入的越多,這樣才能夠保證之后的熒光值比較可信)。2,不同的管家基因擴增效率不同。所以在做整個實驗之前應(yīng)該做一次檢測擴增效率的實驗。如果擴增效率相差太大,就不能使用delt,deltCt法來比較基因表達量的高低。實時熒光定量PCR的定量方法,在Real-time PCR中,模板定量有兩種策略。蘇州骨頭RT-PCR檢測技術(shù)哪家好
Real-time PCR實驗常用的RNA酶抑制劑:1.焦磷酸二乙酯(DEPC):是一種強烈但不徹底的RNA酶抑制劑。它通過和RNA酶的活性基團組氨酸的咪唑環(huán)結(jié)合使蛋白質(zhì)變性,從而抑制酶的活性。2.異硫氰酸胍:目前被認為是較有效的RNA酶抑制劑,它在裂解組織的同時也使RNA酶失活。它既可破壞細胞結(jié)構(gòu)使核酸從蛋白中解離出來,又對RNA酶有強烈的變性作用。3.氧釩核糖核苷復(fù)合物:由氧化釩離子和核苷形成的復(fù)合物,它和RNA酶結(jié)合形成過渡態(tài)類物質(zhì),幾乎能完全抑制RNA酶的活性。4.RNA酶的蛋白抑制劑(RNasin):從大鼠肝或人胎盤中提取得來的酸性糖蛋白。RNasin是RNA酶的一種非競爭性抑制劑,可以和多種RNA酶結(jié)合,使其失活。5.其它:SDS、尿素、硅藻土等對RNA酶也有一定抑制作用。武漢特殊樣本熒光定量PCR原理實時熒光定量PCR實現(xiàn)了每一輪循環(huán)均檢測一次熒光信號的強度。
Real-time PCR:所謂Real-time PCR技術(shù),是指在PCR反應(yīng)體系中加入螢光基團,利用螢光信號累積實時監(jiān)測整個PCR進程,之后通過標準曲線對未知模板進行定量分析的方法。利用螢光信號的變化實時檢測PCR擴增反應(yīng)中每一個循環(huán)擴增產(chǎn)物量的變化,通過Ct值和標準曲線的分析對起始模板進行定量分析。Real-time PCR技術(shù)即實時螢光定量PCR避免了傳統(tǒng)PCR以終產(chǎn)物監(jiān)測定量產(chǎn)生的偏差,提高實驗的重複性。該技術(shù)已經(jīng)被普遍用于監(jiān)測細胞mRNA表達量的變化;比較不同組織的mRNA表達差異;驗證基因晶片,siRNA干擾的實驗結(jié)果。
Real-time PCR螢光染料摻入法:在PCR反應(yīng)體系中,加入過量SYBR螢光染料,SYBR螢光染料特異性地摻入DNA雙鏈后,發(fā)射螢光信號,而不摻入鏈中的SYBR染料分子不會發(fā)射任何螢光信號,從而保證螢光信號的增加與PCR產(chǎn)物的增加完全同步。此方法適用于:1、靈敏度高:使用SYBR可使螢光效果增強到1000倍以上。2、通用性好,不需要設(shè)計探針,方法簡便,省時,價格低廉。3、通用型方法,在國內(nèi)外科研中普遍使用。4、高通量大規(guī)模的定量PCR檢測。5、專一性要求不高的定量PCR檢測。所謂實時熒光定量PCR技術(shù),是指在PCR反應(yīng)體系中加入熒光基團。
Real-time PCR與普通PCR的實驗?zāi)康牟煌詫σ锏脑O(shè)計要求也不同。普通PCR的實驗?zāi)康闹皇菫榱双@得目的基因產(chǎn)物,允許有非特異擴增,只要目標條帶清晰明亮,就可以通過切膠回收的方法回收目標條帶,之后進行后續(xù)的克隆、測序。但Real-time PCR的目的是為了讓目的基因按照理論值或是按照接近理論值進行擴增,只有這樣的擴增后續(xù)由Ct值推算出的起始量模板量才準確,基于此,Real-time PCR對非特異性擴增和引物二聚體的存在有較嚴格的要求。Real-time PCR反是一項利用DNA雙鏈復(fù)制的原理。廈門微量Real-time PCR應(yīng)用
Real-time PCR探針法實驗結(jié)果穩(wěn)定重複性好,特異性更高。蘇州骨頭RT-PCR檢測技術(shù)哪家好
Real-time PCR-傳統(tǒng)定量PCR:1)內(nèi)參照法:在不同的PCR反應(yīng)管中加入已定量的內(nèi)標和引物,內(nèi)標用基因工程方法合成。上游引物用熒光標記,下游引物不標記。在模板擴增的同時,內(nèi)標也被擴增。在PCR產(chǎn)物中,由于內(nèi)標與靶模板的長度不同,二者的擴增產(chǎn)物可用電泳或高效液相分離開來,分別測定其熒光強度,以內(nèi)標為對照定量待檢測模板。2)競爭法:選擇由突變克隆產(chǎn)生的含有一個新內(nèi)切位點的外源競爭性模板。在同一反應(yīng)管中,待測樣品與競爭模板用同一對引物同時擴增(其中一個引物為熒光標記)。蘇州骨頭RT-PCR檢測技術(shù)哪家好
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