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Real-time PCR:實(shí)時熒光定量PCR是目前確定樣品中DNA(或cDNA)拷貝數(shù)較敏感、較準(zhǔn)確的方法。如果用于RNA檢測,這被稱為逆轉(zhuǎn)錄實(shí)時PCR即(Real-timeRT-PCR)是實(shí)時PCR法,它是指對DNA或經(jīng)過反轉(zhuǎn)入(RT-PCR)的RNA通過聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)并實(shí)時監(jiān)測DNA的放大過程,在擴(kuò)增的指數(shù)增長期就測量擴(kuò)增產(chǎn)物,因?yàn)閿U(kuò)增指數(shù)增長期測量值與特異DNA(RNA)起始量存在相關(guān)性,從而實(shí)現(xiàn)定量檢測。Real-time PCR的基本目標(biāo)是精確測量和鑒別非常微量的特異性核酸,從而可通過監(jiān)測CT值而實(shí)現(xiàn)對原始目標(biāo)基因的含量定量。實(shí)時熒光定量PCR法較大的優(yōu)點(diǎn)是克服了終點(diǎn)PCR法進(jìn)入平臺期或叫飽和期后定量的較大誤差,實(shí)現(xiàn)DNA/RNA的精確定量。該技術(shù)不單單實(shí)現(xiàn)了對DNA/RNA模板的定量,而且具有靈敏度和特異性高、能實(shí)現(xiàn)多重反應(yīng)、自動化程度高、無污染、實(shí)時和準(zhǔn)確等特點(diǎn),該技術(shù)在醫(yī)學(xué)臨床檢驗(yàn)及臨床醫(yī)學(xué)研究方面有著重要的意義。Real-time PCR是在PCR擴(kuò)增過程中,通過熒光信號,對PCR進(jìn)程進(jìn)行實(shí)時檢測。溫州細(xì)胞數(shù)字PCR供應(yīng)商
Real-time PCR鏈反應(yīng)注意事項(xiàng):在實(shí)驗(yàn)過程中要防止RNA的降解,保持RNA的完整性。在總RNA的提取過程中,注意避免mRNA的斷裂;為了防止非特異性擴(kuò)增,必須設(shè)陰性對照;內(nèi)參的設(shè)定:主要為了用于靶RNA的定量。常用的內(nèi)參有G3PD(甘油醛-3-磷酸脫氫酶)、β-Actin(β-肌動蛋白)等。其目的在于避免RNA定量誤差、加樣誤差以及各PCR反應(yīng)體系中擴(kuò)增效率不均一各孔間的溫度差等所造成的誤差;PCR不能進(jìn)入平臺期,出現(xiàn)平臺效應(yīng)與所擴(kuò)增的目的基因的長度、序列、二級結(jié)構(gòu)以及目標(biāo)DNA起始的數(shù)量有關(guān)。故對于每一個目標(biāo)序列出現(xiàn)平臺效應(yīng)的循環(huán)數(shù),均應(yīng)通過單獨(dú)實(shí)驗(yàn)來確定;防止DNA的污染:采用DNA酶處理RNA;在可能的情況下,將PCR引物置于基因的不同外顯子,以消除基因和mRNA的共線性。廣州骨頭Real-time PCR供應(yīng)商Real-time PCR的基本目標(biāo)是精確測量和鑒別非常微量的特異性核酸。
Real-time PCR:1.DNA或RNA的定量分析:Real-time PCR包括病原微生物或病毒含量的檢測,轉(zhuǎn)基因動植物轉(zhuǎn)基因拷貝數(shù)的檢測,RNAi基因失活率的檢測等;2.基因表達(dá)差異分析:例如比較經(jīng)過不同處理樣本之間特定基因的表達(dá)差異(如藥物處理、物理處理、化學(xué)處理等),特定基因在不同時相的表達(dá)差異以及cDNA晶片或差顯結(jié)果的確證;3.基因分型:例如SNP檢測,甲基化檢測等。Real-time PCR常用的兩種方法分別為Sybrgreen(螢光染料摻入法)和Taqmanprobe(探針法)。
Real-time PCR:使用Real-time PCR進(jìn)行基因檢測,被普遍應(yīng)用于病毒和病原菌檢測、轉(zhuǎn)基因食品檢測、遺傳病基因檢測等領(lǐng)域。一般首先需要利用專業(yè)使用的試劑盒從待檢樣品中提取其核酸(DNAorRNA),并經(jīng)過精制等復(fù)雜的操作(通常稱為前處理操作)之后才可以進(jìn)行Real-time PCR。不易受反應(yīng)阻害物的影響,使用時不需要進(jìn)行復(fù)雜的前處理操作,單單需將待檢樣品直接加入到檢測試劑中即可開始檢測。通過使用本產(chǎn)品,可以在更短的時間內(nèi),簡便、低成本地進(jìn)行Real-time PCR檢測。實(shí)時熒光定量PCR的定量方法,在Real-time PCR中,模板定量有兩種策略。
Real-time PCR:所謂Real-time PCR技術(shù),是指在PCR反應(yīng)體系中加入螢光基團(tuán),利用螢光信號累積實(shí)時監(jiān)測整個PCR進(jìn)程,之后通過標(biāo)準(zhǔn)曲線對未知模板進(jìn)行定量分析的方法。利用螢光信號的變化實(shí)時檢測PCR擴(kuò)增反應(yīng)中每一個循環(huán)擴(kuò)增產(chǎn)物量的變化,通過Ct值和標(biāo)準(zhǔn)曲線的分析對起始模板進(jìn)行定量分析。Real-time PCR技術(shù)即實(shí)時螢光定量PCR避免了傳統(tǒng)PCR以終產(chǎn)物監(jiān)測定量產(chǎn)生的偏差,提高實(shí)驗(yàn)的重複性。該技術(shù)已經(jīng)被普遍用于監(jiān)測細(xì)胞mRNA表達(dá)量的變化;比較不同組織的mRNA表達(dá)差異;驗(yàn)證基因晶片,siRNA干擾的實(shí)驗(yàn)結(jié)果。Real-time PCR從用途上分可以分為定性分析和定量分析。溫州細(xì)胞數(shù)字PCR供應(yīng)商
Real-time PCR提高實(shí)驗(yàn)的重復(fù)性。溫州細(xì)胞數(shù)字PCR供應(yīng)商
Real-time PCR鏈?zhǔn)椒磻?yīng)的常見問題:靶序列變異:如靶序列發(fā)生突變或缺失,影響引物與模板特異性結(jié)合,或因靶序列某段缺失使引物與模板失去互補(bǔ)序列,其PCR擴(kuò)增是不會成功的。假陽性:出現(xiàn)的PCR擴(kuò)增條帶與目的靶序列條帶一致,有時其條帶更整齊,亮度更高。引物設(shè)計不合適:選擇的擴(kuò)增序列與非目的擴(kuò)增序列有同源性,因而在進(jìn)行PCR擴(kuò)增時,擴(kuò)增出的PCR產(chǎn)物為非目的性的序列。靶序列太短或引物太短,容易出現(xiàn)假陽性。需重新設(shè)計引物。出現(xiàn)片狀拖帶或涂抹帶:PCR擴(kuò)增有時出現(xiàn)涂抹帶或片狀帶或地毯樣帶。其原因往往由于酶量過多或酶的質(zhì)量差,dNTP濃度過高,Mg2+濃度過高,退火溫度過低,循環(huán)次數(shù)過多引起。其對策有:減少酶量,或調(diào)換另一來源的酶。②減少dNTP的濃度。適當(dāng)降低Mg2+濃度。增加模板量,減少循環(huán)次數(shù)。聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)準(zhǔn)備:PCR所用的酶主要有兩種來源:Taq和Pfu,分別來自兩種不同的噬熱菌。溫州細(xì)胞數(shù)字PCR供應(yīng)商
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