聚合酶鏈式反應準備:10×擴增緩沖液、4種dNTP混合物(終濃度)、引物(終濃度)、模板DNA、Taq DNA聚合酶、Mg2+(終濃度)、補加雙蒸水等。其中dNTP、引物、模板DNA、Taq DNA聚合酶以及Mg2+的加量(或濃度)可根據(jù)實驗調整,以上表格只提供大致參考值。PCR反應五要素:參加PCR反應的物質主要有五種即:引物(PCR引物為DN段,細胞內DNA復制的引物為一段RNA鏈)、酶、dNTP、模板和緩沖液(其中需要Mg2+)。引物有多種設計方法,由PCR在實驗中的目的決定,但基本原則相同。聚合酶鏈式反應的特異性依賴于與靶序列兩端互補的寡核苷酸引物。徐州骨頭數(shù)字PCR方案
PCR的反應條件:Tm=4(G+c)+(A+T),一般在45~55度,溫度低容易退火但特異性低;溫度高,不容易退火但特異性高。退火時間30秒。延伸溫度一般在70~75度這時TaqDNA聚合酶活性很高(150個/S),當引物在16個堿基以下時可采用緩慢升高溫度到70~75度的方法,使在低溫下就開始合成。一般<1KB時間1分鐘即可。當〈1KB時在較后的循環(huán)中延長擴增時間。循環(huán)次數(shù)25~30次。無產(chǎn)物時:取10ul擴增混合液作模板在進行PCR擴增;增加TaqDNA聚合酶濃度;增加循環(huán)次數(shù);降低退火溫度;加靶DNA量。常州骨頭熒光定量PCR原理PCR由變性-退火-延伸三個基本反應步驟構成。
絕大多數(shù)聚合酶鏈反應方法依賴于熱循環(huán)。熱循環(huán)將反應物暴露于加熱和冷卻的重復循環(huán)中,以允許不同的溫度依賴性反應——具體地說,脫氧核糖核酸融化和酶-驅動DNA復制。聚合酶鏈反應使用兩種主要試劑-引物(引物是短的單鏈DN段,稱為寡核苷酸,是目標DNA區(qū)域的互補序列)和DNA聚合酶。在PCR反應的步,DNA雙螺旋結構的兩條鏈在高溫下物理分離,這個過程稱為脫氧核糖核酸變性。第二步,降低溫度,引物與互補的脫氧核糖核酸序列結合。這兩條DNA鏈就變成了模板,以酶促的方式從構成DNA的自由核苷酸中組裝出一條新的DNA鏈。隨著聚合酶鏈反應的進行,產(chǎn)生的DNA本身被用作復制的模板,啟動了一個連鎖反應,原始的DNA模板是以指數(shù)形式放大。
聚合酶鏈式反應的試驗污染:實驗室中克隆質粒的污染:在分子生物學實驗室及某些用克隆質粒做陽性對照的檢驗室,這個問題也比較常見。因為克隆質粒在單位容積內含量相當高,另外在純化過程中需用較多的用具及試劑,而且在活細胞內的質粒,由于活細胞的生長繁殖的簡便性及具有很強的生命力。其污染可能性也很大。污染的監(jiān)測:一個好的實驗室,要時刻注意污染的監(jiān)測,考慮有無污染是什么原因造成的污染,以便采取措施,防止和消除污染。重復性試驗。選擇不同區(qū)域的引物進行PCR擴增。逆轉錄-聚合酶鏈反應較廣用于表達譜,以確定基因的表達或鑒定RNA轉錄物的序列。
聚合酶鏈式反應PCR技術的基本原理類似于DNA的天然復制過程,其特異性依賴于與靶序列兩端互補的寡核苷酸引物。PCR由變性-退火-延伸三個基本反應步驟構成:模板DNA的變性:模板DNA經(jīng)加熱至93℃左右一定時間后,使模板DNA雙鏈或經(jīng)PCR擴增形成的雙鏈DNA解離,使之成為單鏈,以便它與引物結合,為下輪反應作準備;模板DNA與引物的退火(復性):模板DNA經(jīng)加熱變性成單鏈后,溫度降至55℃左右,引物與模板DNA單鏈的互補序列配對結合;引物的延伸:DNA模板-引物結合物在72℃、DNA聚合酶(如TaqDNA聚合酶)的作用下,以dNTP為反應原料,靶序列為模板,按堿基互補配對與半保留復制原理,合成一條新的與模板DNA鏈互補的半保留復制鏈,重復循環(huán)變性-退火-延伸三過程就可獲得更多的“半保留復制鏈”,而且這種新鏈又可成為下次循環(huán)的模板。每完成一個循環(huán)需2~4分鐘,2~3小時就能將待擴目的基因擴增放大幾百萬倍。聚合酶鏈反應可以用于分析病癥、微生物或其他疾病狀態(tài)中基因表達水平的變化。武漢實時熒光PCR供應商
序列間特異性聚合酶鏈反應放大簡單重復序列之間的區(qū)域,以產(chǎn)生擴增片段長度的獨特指紋。徐州骨頭數(shù)字PCR方案
聚合酶鏈反應的常見問題分析與解決方法:MgCl2濃度過高。可適當降低其用量。模板量過多。質粒DNA的用量應<50 ng,而基因組DNA則應<200 ng。引物濃度不夠優(yōu)化。對引物進行梯度稀釋重復PCR反應。循環(huán)次數(shù)過多;增加模板量減少循環(huán)次數(shù)至30,縮短退火時間及延伸時間,或改用二種溫度的PCR循環(huán)。退火溫度過低。電泳體系有問題:凝膠中緩沖液和電泳緩沖液濃度相差太大;凝膠沒有凝固好;瓊脂糖質量差。若為PCR試劑盒則可能:由于運輸儲存不當引起試劑盒失效;試劑盒本身質量有問題,如引物選擇、循環(huán)參數(shù)等選擇不當。降解的陳舊模板擴增也易產(chǎn)生涂布。徐州骨頭數(shù)字PCR方案